Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CORO1C_0005200

Sequence Length

746 nt

GC Content

0.4920

CUUACUUUUGAAACACUUGCUUGAAGAUGCUGGUAGGGAUUGCAGCUUCUAUAACUUGUACAGAUGGUUGCAGAUGGUUGUGUGGGGAAGUGGAGCCCAAGACCAGCUGGCUGUACGUUGGCUUUUGUAUAGAUGUGCUUUCCUUUUGCUUUUCACCACCUCAUGGAAGCUGUCUUAUCUAACUCACGCUUGAGAAGUAUUCAUAUUGAUUCCAAAAUGAAGGACCCUGGCCACGAAUCAUUUGCCAUCUCCUCUACCAAAGACUCAAAAUGUAUGGCCCUGGUAGUCAGCUGGGAAAGUCUGGCAAUAACAGCUGGGCUAAGGAACGUGGAUGCUCAAUUGCCUGCCAAGGGUCUCUUACUUCAGCCCGGCUACAUGCCCCCAGCAUUGGAGAGAGGCCACUUUCACACAUGCGUUGGAAGGACACGAUGAGGCGAGUGGUACGACAGAGCAAGUUUCGGCAUGUAUUUGGGCAAGCGGUGAAAAAUGACCAGUGCUAUGAUGACAUCCGGGUUUCUCGUGUGACCUGGGAUAGUUCCUUUUGUGCUGUCAAUCCCAGAUUUGUUGCCAUAAUCAUAGAGGCAAGUGGGGGAGGAGCGUUCCUUGUCCUCCCUCUGCACAAGACUGGUCGAAUUGACAAAUCUUACCCUACAGUAUGUGGCCACACAGGACCAGUGCUGGACAUAGACUGGUGCCCACAUAACGAUCAGGUCAUUGCCAGCGGUUCAGAGGACUGCACGGUCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-231.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -246.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 222.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...(((((((..(.(((.....)))..((((((((.(((((((((((((.((.....)).))).)))))))(((.((((((((((((((((((((((....(((((((((((((((((.((....))...)))))))........((((((((....((....))((((((............)).))))))))))))(((((.(((....))).)))))..(((..(((((.....(((((....(((..........)))....)))))..)))))..)))))))))))))...((((((((.......))))))))........((((.((......)).).))).))).))).)))))).((((((.((((((((.(((....))).(((((....)))))..((.(((.(((...(..(((..........)))...)..))).))).))...)))))))).))))))...............((((((.(((((.......(((((((.(....).)))))))((((((.........))))))......(((((((((((((...((......(((...(((((((((.((.....))))))))))))))....)).))))......))))))))).......((((((.(((((.....)).)))))))))..))))))))))).)))))))))).)))..))).)))))))))..)))))))...)((......))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(...((((((({.{.(((.....))).,((((((({.(((((((((((((.{{.....}}.))).)))))))(((.(((((((((({{{(((({((((,...(((((((((((((((({.{{....))...)}}))))......,,(((((((({((,{{,,,|}|,{{{((,,{{.,,,{|,.||.|}}}}}}}}}}}{((((.(((....))).))))),|(((..(((({.....{{{{{,...(((..........}}}....}}}})..))))}.,)))))}}}||||},..{{{{{(((......,||||||||.,{{....{((,.{{,,....}).}.}},.))),)))}}))))),||||(|,|{{{||||,|||||.{{|,.{|{,|||,|||}}}.|.|||}|||||},,,,,))),)))}}}.},))))}....,}},))},)....)))))))}.))))))..,,{,{........((((((.({{((....,.,(((((((.{....).))))))){{{{{{.......}.}}}|||{{{{,{{{.|{{{(((((.,.........)))),{{(((((((((.((.....})))))))))),)),}}}}|})))||}..}}))),..,,,,...,..({{{{{,(({{{.,,,.}},|||||}|||..}}))))))))).)))))))))).)))..))).})))))))),))))))))...)((......))