Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND2A_0002600
Sequence Length
446 nt
GC Content
0.5404
CUCACAGCCAGCGCCUGGUCAACGUGAAGUCCCGGCUGAAGCAGGCGCCUCGGUACCCAUCACUUGCCCGGGAACUCAUCGAGUACCAGGAGAGGCAGCUCUUCGAGUACUUUGUGGUUGUGUCUUUGCACAAGAAGCAGGCCGGGGCUGCCUACGUGCCAGAACUCACCCAACAGUUCCCUCUGAAGUUGGAAAGGUCUUUCAAGUUCAUGAGAGAAGCUGAGGACCAACUGAAGGCCAUUCCCCAGUUCUGUUUUCCCGAUGCCAAGGAUUGGGUUCCUGUCCAGCAGUUCACCAGUGAAACAUUCUCAUUUGUCUUAACUGGAGAAGAUGGGAGCAGAAGGUUCGGUUACUGCCGAAGACUGCUGCCUGGAGGCAAAGGGAAGCGCCUUCCUGAAGUUUACUGCAUUGUGAGCCGCCUGGGAUGCUUCAGCCUCUUUUCAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-152.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 125.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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