Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND2A_0005000
Sequence Length
596 nt
GC Content
0.4983
AAAGUCCUAUGAGUUUGAAGAUUUACUGCAGUCUUCCUCUGAGAGCAGCAGGGUGGACUGGUACGCGCAGACUAAGCUGGGGCUGACACGCACUUUAUCGGAGGAGAACGUCUAUGAAGACAUUCUAGAUCCGCCAAUGAAGGAGAACCCUUAUGAGGACAUCGAGUUACAUGGUCGCUGCCUGGGAAAGAAGUGUGUCUUGAAUUUUCCUGCUUCUCCCACCUCUUCCAUCCCUGACACACUCACCAAGCAGUCAUUGUCCAAACCUGCUUUUUUCCGACAAAAUUCAGAGAGGAGGAACUUCAAGCUGCUGGACACUAGGAAGCUGAGUCGGGAUGGAACUGGGUCCCCUUCCAAAAUCAGCCCUCCCUCCACUCCCAGCAGCCCUGAUGACAUUUUCUUUAACCUUGGAGACCCACAGAACGGCAGGAAGAAGAGAAAGAUACCCAAGCUGGUGUUGCGAAUCAACGCCAUUUAUGAGGUCCGGAGAGGAAAGAAACGGGUGAAGAGGCUGUCCCAGUCAAUGGAGAGCAACUCAGGAAAAGUGACAGAUGAGAACAGUGAGUCUGACAGUGACACAGAGGAGAAGCUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-170.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -180.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 105.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((((......(((..(((((((((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.((((((((((..((((.((((....)))).))))...))))...)))))).....(((.....(((.((.(((.(.....).))).))))))))......)))))))......((((..((((((((....(((....((.(((.((.((((((....((((((((.(((..(((((.((((((((........((((.((((.....))))..((((((((......(((.(((((....(((.(((......)))...)))....)))))..)))........)))))))).)))).....((((((((..((((((....))).........)))..))))))))....(((((...((((((((.....))))))))....)).))).......)))))))).)))))...((((((.(((........))).)))..))).)))..))))))...))......)))))).)).))).))...))))))))))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((..((((((......(((..((((((,((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.(((((({(({,,((((.((((....)))).))))...)))},}.)))))).....,{(|,...(((.((.(((.(.....).))).)))))})}...,..))))))).....,((((..((((((({...,(((....((.(((.((.((((((....{,((((((.(((..(((((.((((((((,.......,|,{{(((({,...|,{({.((((((((.....,(({.(((((....(((.((,......},)}..)))....)))))..}}),,......))))))))..))}.,...||||||||..,(((,(.{{{({|..,,..{{{,||..|},},,,..,,,{{{,..,.{||||||{.....)}})))),,}}.)).))))).}}}.)))))))).)))))...({{(((.(((........))).)))..))).)))..))))))...))......)))))).)).))).))...))))))))))).)))),
Back