Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND2A_0006000
Sequence Length
451 nt
GC Content
0.4989
AAAGUCCUAUGAGUUUGAAGAUUUACUGCAGUCUUCCUCUGAGAGCAGCAGGGUGGACUGGUACGCGCAGACUAAGCUGGGGCUGACACGCACUUUAUCGGAGGAGAACGUCUAUGAAGACAUUCUAGAUCCGCCAAUGAAGGAGAACCCUUAUGAGGACAUCGAGUUACAUGGUCGCUGCCUGGGAAAGAAGUGUGUCUUGAAUUUUCCUGCUUCUCCCACCUCUUCCAUCCCUGACACACUCACCAAGCAGUCAUUGUCCAAACCUGCUUUUUUCCGACAAAAUUCAGAGAGGAGGAACUUCAAGCUGCUGGACACUAGGAAGCUGAGUCGGGAUGGAACUGGGUCCCCUUCCAAAAUCAGCCCUCCCUCCACUCCCAGCAGCCCUGAUGACAUUUUCUUUAACCUUGGAGACCCACAGAACGGCAGGAAGAAGAGAAAGAUACCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-119.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -127.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 81.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((((......(((..(((((((((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.((((((((((..((((.((((....)))).))))...))))...)))))).....(((.....(((.((.(((.(.....).))).))))))))......))))))).....(((((((((((((((....((((((.((.((((.....((...((((((.............))))))......))......)))).))))))))...(((.((((((((......(((.(((((....(((.(((......)))...)))....)))))..)))........))))))))..)))...................)))))..........)))))))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((..((((((......(((..((((((,((((((....))).)))).)))))))))....))))))....))))))),{({(((.(((((({(({,,((((.((((....)))).))))...)))},}.)))))),....,{(|,...(((.((.(((.(.....).))).)))))})}...,..)))))||{{...((((((((((((({,....((((((.((.((((.....,,...((((((....,......,.))))))......},......)))).))))))))...{({.((((((((.....,(({.(((((....(((.((,......},}}..)))....)))))..}}),,......))))))))..})}.|......{{,.......,)))))......},..)))))))))).....,,,,,.......
Back