Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND2A_0006100
Sequence Length
425 nt
GC Content
0.5153
GUGACCUGGAACUCCCCUCGGUACUGACAUGAUGACAGUGUGCAGGCCGGCCAAGGGCAGCCACAGCCAGACUGAAAACCUGAGCUACAAAUUGGCUGACAAAUCCGCCAAUGAAGGAGAACCCUUAUGAGGACAUCGAGUUACAUGGUCGCUGCCUGGGAAAGAAGUGUGUCUUGAAUUUUCCUGCUUCUCCCACCUCUUCCAUCCCUGACACACUCACCAAGCAGUCAUUGUCCAAACCUGCUUUUUUCCGACAAAAUUCAGAGAGGAGGAACUUCAAGCUGCUGGACACUAGGAAGCUGAGUCGGGAUGGAACUGGGUCCCCUUCCAAAAUCAGCCCUCCCUCCACUCCCAGCAGCCCUGAUGACAUUUUCUUUAACCUUGGAGACCCACAGAACGGCAGGAAGAAGAGAAAGAUACCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -124.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 77.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..((((.(((((((.(((((((.......)))).))))))(((........)))..((((((.........))).)))....((((((.((....)).)))))).((((.....))))..)))).....))))..)).))))))(...((((.........((((((...(((((((((((((((....((((((.((.((((.....((...((((((.............))))))......))......)))).))))))))...(((.((((((((......(((.(((((....(((.(((......)))...)))....)))))..)))........))))))))..)))...................)))))..........)))))))))).....)))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.,((((.(((((((,((({(({.....,,)))).)}|||}|{{,..,))|.|||..((((((.........))).)))....{(((((.({....}).)))))}.((((.....)))).,)))).....)))),.)).))))))(...((((.........((((((...((((((((((((({,....((((((.((.((((.....,,...((((((....,......,.))))))......},......)))).))))))))...{({.((((((((.....,(({.(((((....(((.((,......},}}..)))....)))))..}}),,......))))))))..))}.|......{{,.......,)))))......},..)))))))))).....)))))))))).)
Back