Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0000700
Sequence Length
2637 nt
GC Content
0.3944
GUGGAUUGCUUGAGCCCAGAAGUUCAGAACCAGCCUACGCAACAUAGUGAGAUACCAUGUCUACAAAAAAUACAAAAAUUAUAGUUGGAAAAUGAAUUUUAAUUGUUAAACUGUAUAUCUAAGUUGAUUUUUACAAGUCGUUUUAUUUUUUCUUCAAAAGCUUUUGUUAAUACAAAGUAUCAAUAUGGGUAUGGCGAAAGAGAACUCUUGUACCCUAUUGGUGGGAAUGUAAAUUGGAACAGCCAUUAUGGAGCACAAUAUGGAGGUUCUUCUCAAAAUUAAAAAUAGAACUACUGUACAAUUCAGCAAUCCCACUUCUAGGUAUAUAUCCAAAGGAAGUGAAAUCAGUAGAUUGAAGAGAUAUCUGUACCCCCAUGUUAAUUGUAGCAUUAUUCACAAUAGCUGAGAUGUGGAAGUAACGUUAGUGUCCAUCGACGGAUGAAUGUGUAAAGAAAUUGUGGCAUACACACACACAGCAGAAUACUAUUUAGCCAUAAAAAGAAGGAAAUCCUGUCAUUGGUGACAUUAUGGAUGAAACUGGGAGAUAUUAUGCUAAGUGAAAUAAGCCAGAUACAGAAAGACAAAUAUUGUAUAGUCUCAUUAAUAUGUGGAAUCCAACAAGUUGAACUCAUAAAAGCAGAGCAUACAAGGGUGGUUGCUAGUGCCUGGGGAGGAGGUAGGGGAAAUAGGGAGGGGAUGUAAUGUACAGCAUGGUUACUAUAGUUGAUUAUACUGUAUUGCUUACUUGAAAUUUGAUAAAGAGAGCAAAUUGUAAGUGACCCAUGGUCACUAUGGGUGGUGGUGUUGAUUGUGUUAAUUUGACUGUGGUAGUCAGUACAUAAUGUGUAUAUAUAUACCAAAUCAUCAUUUUAUAUACCUUGAAUGUUAUAUAUAUAUUUUUUCAAUUACAUGUUUUAAAAUUAAAAAGUUGGCCGGGACCGGGUGUGGGGGCUCGUGCCUGUAACCCCCGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGUGUAGAUCAUCUUGAGGUCAGGAGUUCAGGACCAGCCUGGCCAAUAUGGUGAAACCCUGUCUGUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGUGUGGUGGUGGUGGAGGGGGGGCCGCCUGUAAUUCCAGCGACUCGGGAGACUGAGGCAGGAGAGUCACUUGAACCCCGCUGGGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGUGCCGUUGCACUCCAGCCUGGGUGGCAAGAGCGAAACUCUGUCUCAGUCUCAGUGGCUCAGGAGGUGGAGGCUGGAGGGCCACUUGAGGCCAGGAGUUCAAGACCAGCUUGGGUAGCAUAGAGAGACCCUGAUCUCUACAAAAGUUAGAAAAAAUUAGCUGGAUAUGGUGGUGCGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGCUAGAAGGAUCACUUGAGCCUGGGAGUUUGAGGCUGAAGUGAGCUAUGAUUGUGCCACUGCAUUCCAGCCUGGGCAACAGAGUGAGAUCCUGCCUCCAAAAAAAAAAAUUUUUUUUUAAUGUAAAAACCAUCAAAAUACUGUUAUCUACACAUCACUAAUGUUUACAAUCAACAGGUUUAUACAUUUAUUUUAGGUAAAUCUAAAGGCAUCCUAUAUAUACAUUUUAUGUGAGAGGAAAGUAUUAAUAAAAUCUGAAAUUGAAAAGUAGCUUUUAUUUCAUACAGACUGGUUUUUAUCAGGAAUGAAGAAGGGUAAUUUUUUAAUGCUUUUUUUAUAAUGAUAAAGGAAUUAGUUGAAAGGAUAUAACAAUUCUUAAUGUUUAUGCCUUUAAUAACAGUUUCAAAAUACAUGAAGCAAAAACUGAUAGACUGAAAGGAGAAAAAGACAAAUCCAUAAUUUUAGUCAGAGAUUUUAAUGCCAUUCUCGUACUAGUUGAUAGCACAAGUGGACAGAAAACCAUCAAGGAUGUAGUAGACUUGUUACAACACUAUUUACUUGACUUGAUUUAUAGAGCCCUCUGUGCAACAACAGAGAGACAUUCUGCUAAAGUGCACAUGGAAUAUUCAUCAAGACAGACCACAUUCAGGCUGAGCAUGGUGUCUUAACUCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAGGGUGGGAGGAUUGCUUGAGGCCAGGAGUUCAAGACCAGGCUGGGCAACAUAGCAAGACCCUGUCUCUGCAAAAAAAUAAAUGAAAAAAAAAAAAAGACCAGAUUCUUAGCCAUAAAACAAGUCUUGAUAACUAUGAAAGAAUUUGGGUUAUACAAAGUACAUUCUCUGACCAUAAGGCAUUUAAGUUAGAAAUCAGUAACAGAAAGAUUCUUGGAAAAUUCCCAAGUACUGAAUUUGGAAACUGAAAAACAUACUUUAUUUUUAAAAAAAUUUUUCUUUUUUUUCUUUUCUGUUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUUUCGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAGGGCGCAAUCUCUGCUCACUGCUCACUGCCAUCUCCACCUCCUGAGUUCAAGCGAUUCUCCUGUCGCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCGCCACCACACCCGGCUAAUUUUGUACUUUUAGAAGAGAGAGGUUUCUCUGUGUUGGUUAGGCUGGUCACGAGCUCCCAACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-872.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -923.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 576.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((..((((((......))))))...((((((((.((.((((((((....((((((((((.....(((((......((((((((((......)))))))))).....)))))......(((((.((.((((.((.(((((((((((.........(((((.((....)))))))(((((((.((((((((.((........)))))))))))))))))((((.........(((((..((((..((.....))..))))..)))))))))......))))))))))).)))))).)).))))).....(((((((.((.......))...)))))))......)))))............((((((((((((((((....))))))...........((((...((((......(((((...((((......)))).)))))..........((((.....))))))))))))......((((((..((.........(((....))).(((((.(((....))).)))))..((((...((.((((.....)))).))...))))........((((............))))..(((((.(((((...)).))).))))).(((......(((.((((..((....))..))))..))).....)))......))..))))))...)))).......))))))...((((((((((((.......))))).((((((.(((...........))).))))))......))))))))))))))))))))..)))))).))))(((((((....(((((((...))))))).)))))))..(((((((((((.((..(((...............))).)).))))))))))).........((((((((((..............((((....(((((((((((((.............))))))))).))))..))))))))))))))))))..)(((((((..(((((((..((((((((((((((((((((.((((((((.(((...((((((.(((((((.((((((.((((((((((((......((....))(((((((((((((((.(((((((((.(((.((((((((((((.(((((((.(....(((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((....)))...))))))).))))))((((((((((.(.((..((((((((((.((((((........))))))....(((((........)))))((((..((((.....))))....))))..)))))))))).))))))))).......((((((.(((((.(.....).))))).))))))((((((.((((((....))...(((((((((.........((((.(((((((((.((((((((....))))))))...........................((((((((((.(((((((.((.((((....)))))).)))))...(((((......)))))((((((((.((((((.....))))))..)))..........((((((((...((((((((((.((((((.((((((.....(((((....)))))..)))))))))))).))))))))))...((((((((....))))))))(((((((.(((((....((((........))))....))))).......((((((.......))))))...))))))).(((((((((((............)))....))))))))..))))))))))))).((((.((.(((.(((......))).)))))))))........))))))).)))))...((((..(((((((((((((((((((((..(((....((..((((((....(((((.....)))))......)))))).))..)))..))))))...........))))).)))..)))))))..))))....(((((((...((((((((....))))))))...)))))))..)))).))))).))))...))))))))))))))))))).....)))).....(((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((...((((.................)))).))))))))))..................((((((...((....))...))))))..((((((...........(((((.......))))))))))).((((((((.((((........))))))))))))........)))))))))).))))).)))).)))))))))...............))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))......))))))))).)))))))))))..).))))))).)))))))))))).))).))))))))).)))))))))))))))...)))))))))))).))))))))))))).)))))).))).)).)))))).))))))))))))))))))))..)))))))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{({(((((({(((,.....}}}}},..{(,(((,,(,{......|||({(({..,|})}}.,.....(((((......((((((((((......)))))))))).....)))))......(((((.((.(((,,((.(((((((((((.........((((((((....))))))}{((((((.(((((({{.({........))))))))))))))))}((((.........(((((..((((..((.....))..))))..)))))))))......))))))))))).)))))).)).))))).....(((((((.((.......))...))))))).,,.{,{{,{{((((((((((((,((({,((((((((((....}}|}}|..{(((({.,.,.{{,|{||||,,..,.||||{.,{(((({{{...,)))}.,|||{,........{,(({,.,.,,,,{|{..{(({.,{{{{(,{(((,((((({.....{((....))}((((....}))).}))))).}}}..}}}}.,,.}})}.))))..)))...,..}))},||||,,...,{{.....,},},,.}))),,{{{{{.|{{||...}},})}.})))}.{{{......(((.((((..({....))..))))..))),|,,,},,,|||||}))}.{{{|,.,{{{(,{(((({,((((((.((((((({,,,.||})}}}}}.))))}|{((((,(((..,,,,,,...}}}.}}}))},,,.}}||||((({{{||}}}))})}|||{||||{,{|{(((((({....{((((({...))))))},})))))){|||||,,,}))}))}.,))}}}}}}})}}}}.))))...}},}.)))).))))))))))))))}}.||{||{...........,},|||{,,..(((((((((((((..,......}...))))))))))}}))..))))}))))},))}},))},|(((((((..(((((((..((((((((((((((((((((.((((((((.(((.,.((((((.((((((((((((((.((((((((((((......({....))(((((((((((((((.(((((((((.(((.((((((((((((.(((((((.,.,..(((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((....)))...)))))))},))))),,,,((((({,(.((..((((((((((.((((((........))))))....(((((,......,)))))((((,{((,(,,...,))).,},})))..)))))))))).)))))))))....,,.((((((.(((((.(.....).))))).))))))((((((.((((((....)),..(((((((((.........((({.(((((((((.{(((((((....}))))))}{(((((.(((((..........(((,....|,{{{{.....}})}.,,.....}}}}))))).)))))}...((((({....,))))){(({((((,{{,{{{,,...}})))|.(((((..(((({{,.,((((((...((((((((((.((((((.{(((((.....(((((....)))))..)))))})))))).)))))))))).,|(({{(({{...,))))))))||||(((,(((((.(({((((........))))}))}))))).......((((((.......))))))...,,,,,,,.(((((((((((............)))....))))))))..))))))))))))..))))){{.(((.{{{......)}},|||}}.,....,,||{,||}}}||{{{{{,..,({,...|||||||}}}}|||,||||||..{{{..,||({,((({{,...}|||||,,,,,||}||{,....}))}}},||..},}..}}}}}}.{,,.{{....,,,})})))},}})))))}}}.,,....(((((((...((((((((....))))))))...)))))))..)))),,)))).})))...))))))))))))))))))).{{{{,,,)}}}..(((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((...((((...,,.....},.....)))).)))))))))).........,{,|.....((((((..,((....,),,.))))))..(((((..((((..,...(((((.......))))).,}}...))))...))))).......,.}}},,,,,,,,,........)))))))))).))))).)))).)))))))))...............))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))......))))))))).))))))))))),.).))))))).)))))))))))).))).))))))))).)))))))))))))))...)))))))))))).))))))))))))).)))))).)}),)},)))))).))))))))))))))))))))..)))))))..)))))))
Back