Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0001200
Sequence Length
2139 nt
GC Content
0.4465
GCUGGAGUGCAAUGGUGCGAUCUCGGCUCACCGCAACCUCCGCCUACCGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGACUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCGCCACCGCACCCAGCUAAUUUUGUAUAUUUAGUAGAGAUGGGAUUUCUCCAUGUUGAUCAGGCUGGUCUCAAACUCCCAACCUCAGGUGUUGCACCCUCCUCGGCCUUCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGUGCCCGGCCUGGAUAUGUUUCACUAUCUUGAUUGUGGUAAUGGUUUUAUUGGUUGUUGUUUCUUAUGCUCUAUCUGGUAUUUUUAGAUAUAAAAGAUUUAAUGAUUCCUGAGCUUACUUAUUUUACAUGGUAUUUAUGGAAAGUUUAAUUCUUAUAAAGCACAAGAGUUCUAACUGGAUUGUUGAGAAACUGCUUUAAUGAUAUUUAUUACUGUUACCUUAAUUUUUCUGAUCUUGGAUCUUGACUGAUGAUGCACUCAAUUUAUUUAAAUGUGGAGUUUAGCUCUAAGACUCCUGUAACUUAAAAGAGAAUGAUAUUUUGAAUGAUCUGAAUAUUGUUCAUUAAGUACAUUUUGCUCAAAGGAAAAUACCGUAGUCCACCUCUGACAGUUUAGUAUUAUUAUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUUGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCCUGGCUCACUGCAAACCUCUGCCCCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUAGCCAGGCUGGUGUCAAAUUCCUGACCUCAAGUGAUCCACCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCAGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCAGGCCCGGCCUUUUUUUUUUUUUUCUUUCUCUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGUCUUCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCAAUUUGGGCUCACUGAAACCUCCGCCUUCCGGGGUCGAGCGAUUCUCAUGCCCCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUGACAGGCGCACACCACCACGCCUGGCUAAUGUUUAUUUUCAUUUUUAUUUAUUUUUUGAGAUGGAGUUUCUCUCUUUCACCCAGGCUGAGGUGAAGUGGAGCAAUCUCCGCUCACUGCAGCUUCUGCCCCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGGGUAGCUGGGAUUAUAGGCGCCCCCCACCAGGCUCAGCUAAAUUUUUGUAUUUUUGUAGAGAUGGGGUUUUGCCGUGGUGGCUAGGCUGUUCUCGAGCUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCCACCUCCACCUCCCAUAGUGCUAAGAUUACAGGUGUGAGCCACCAUGCCCAGCCUAAUAUUUAUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAGGUUGGGCACACUGGUCGCGAACUUAAGACCUCAGGUGAUCCACUUGCCUUGGCCCCCCAAAGUGCUAGGAUUACAGGCAUGAGCCAUCGCGCCCGGCCCCAGUUUAAUUAUCCUUAAUAGAAUAUGAGAAGAUUAUAGUUGUAUUACAGAUGAAUUGAUGCUGUUAACUUGUACUUUUGCUUUUACCAACUGACAAGAUGAUAAAAGCAGGCUUCUUCUCAGAAUGGCAAUUUGAUUAUAAAUCUAGCUGGGAAGUGUGCUAGUUGAUGAUUGUUAACUCAAGGAUAUAUUAAUUUUUGUCAGGAUAAAGUAUUUUAUUUUAUUGGUAUCUUUCCCCUCCCUCUUCUAGAAAAUACAGUAGCAGCCAUGAUAGAAGACAAAGGACCAAGAGUGACAGACUACUUUGUCGUAGCUGGUCUCACUGACACAUCUACUCUUUUGGAUCAAGAAAUAAAUCGUUUAGAUACUAAGUCAACUGGACCUAAAGCUCCAAUUACAGACAUUGCCAUUAUUAUCAAAUCAGCUGGAGAAACAGUACCUGAAGGUUACACCUGUGUAGAAGCCACUCCAUCAGCUCUCCAAGCAAACUUGAACUAUGGAAGUCUGAAAAGCCCAGAACUUUUCCUCUGUUAUAAGAGAGGGAGAGAUAAACCACCGCUUACAGAUAUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-640.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -676.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 465.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((...((((.(.......).)))))))..))))))(((((((((....(((((.(((.(((((.......(((((((((((((......(((....)))......)))))))).................(((.((((((((..(((.(((.....))))))....))).)))))..))).((((..(((((.(((.(((((((...))).)))))))((((....))))(((((.((((((((((((((((.(.((((..(((..(((((.(((((((((..((...(((((..............(((((((.....)))))))...((((.((((...((((((((..((((..........)))))))).))))...)))).)))).((((((((((.(((((.....))))).)))......))))))))))))...))..))))))))).))))).....)))..)))).)((((.((......)).)))).............(((((((.......)))))))((((.(((((....(((((((((((.((....)).))))))))))).))))))))).....(((((((((((((((....(((.......)))......)))))....))))))))))(((((((...))))))))))))))))))).)))).)))))..((.(((((......(((......)))...))))).))..(((.......)))((((((..(....)..))))))......))))).))))..((((((((..(((((((.(((((....((.(((...((((.((((((((((((((((((((((((((......)))).....(((((((...(((...((....))...)))...))))))).((((((.(((..(((.((((((..................................((((((((((...))))))))))..((((.((((..(((((((.((...)).)).)))))....))))))))...(((((.(((.....)))..))))).............)))))).)))...))).)))))))))).)))))))))))))....(((((...............))))).((((..((...(((..((((((((((.(((((.((((((....))))))))))).)))).........))))))..))).))..)))).((((.....((((((....))))))....))))(((..(((((((((..((((..(((((((((....)))))))))..))))..))).))))))...))).......(((........))).)))))...))))..))).)).......))))).))))))))))))))).((.((((((((((((((....(((((.......)))))....((......))))))))))))...)))).))...........)))))(((((((....(((((((....)).))).))..)))))))))))).)))..)))))))))))...(((((((((((((..(((((.(((((((.....)))).))).)))))..)))).))))).))))..............((((((((.((.((....)).)).))))))))(((((((.(.(((((((((((((((((((..(((((((((((........)))))))..))))..))).)))).((((..........))))((((((((....)))))))).(((((((((....(((...(((((((......................)))))))...))).(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).)))))))...................)))))))))(((((.((((........)))).))...))))))))))))............((((......))))(((....))).....))).).)))))))..(((((.((.....((((....))))..))))))).(((((..((((......((((((((((........))))))))))..........)))).)))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((..,((((((.....|||,})}})}}..))))))(({((((((....(((((.(((.((((({{(....|||||((((((((......(((....)))......))))))))....,.,,......,,,{{{,(((((,{,..{({.({{.....}}}}))....,}}.)))))..}}}.((((..{((((.({(,(((((({...})).))))))}...,,{|{|||,(((((.((((((((((((((((.,.,{{{..{{{..(((((.(((((((((..((,,,({{((,(({(((,.,{{{.(((((((.....)))))))...((((.((((...((((,,({..((((..........)))).)),.))))...)))).)))).,,,||||(((.(((((.....))))).)))}}}}}},)),}})))))}...}}..))))))))).))))).....|||,.||}}||,{{{.{{,.,,..}}.}}},............,(((((.,.}}}}|{((((((((((,,(((((....(((((((((((.((....)).))))))))))).))))))))).....(((((((((((((((....(((.......)))......)))))....))))))))))..)))))))}},,,,,.}))))))))))).)))).)))))..((.(((((,.....(((......)))...}}}||,}}..{{{.....,,})}{|{|||,,{...,)..)))))),.....|||}}.}}})..((((((((..(((((({.(((((....((.(((...((((.((((((((((((((((((((((((((......)))).....(((((((...(((.,.((....))...)))...))))))).((((((.(((..(((.((((((..................................((((((((((...))))))))))..((((.((((..(((((((.({...}).)).)))))....))))))))...(((((.(((.....)))..))))).,......},}..)))))).)))...))).)))))))))).))))))))))))).....,,,,...............|||||.((((..((.,.(((..((((((((((.((((,{((((((....))))))))))).)))}........,))))))..))).))..)))).((((.,...((((((....))))))....))))(((..(((((((((..((((..(((((((((....)))))))))..))))..))).))))))...)))...,,,,|||.....,..}}).)))))...))))..))).)}.......))))).})))))))))))))).|{,|{{{((((((((((.....,,,,.....,,}},|||||.,{}},,,.)}))))))))))...}))),}}........,.,},,,}(((((((....(({((((....)))),).))..)))))))))))).)))..)))))))))))...(((((((((((((..(((((.(((((((.....))))},)).)))))..)))))})))).))))..............((((((((.((.((....)).)).))))))))(((((((.{.(((((((((((({((((({..{((({((({((,,,,.,{,|||||||,,}}}},,))).}|||{(((,.....,,,},))}},,((((((,,,.,}))))))}|||||||{|,,,,{((...(((((((......................)))))))...))).(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).))))))).....,,......,,,.,,))))}}}}}|||||.((((......,.)))).,,...}},))))))))).........,,,((((......)))),{|,,,.}}}.....))).}.)))))))..(((((.((.,.,.{(((....))))}.))))))).(((((..{(((...,..((((((((((........))))))))))..........)))).)))))..)))
Back