Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0004900
Sequence Length
1928 nt
GC Content
0.3968
AGUUCUAUAUGAAGGGAAAGAACGGCUUAUUCCAGGAUGUGAAGUGAUCCUAGCCACACCCUAUGGUCGCUGUGCCAAUGUCAACAAUAGUUCAACUACUUCACAAAGAAUCUUUAUCACUUAUCGAAGGGCUCCUCCAGUUCGACCCCAGAAUUCCUUGGCUGUAACUGAUAUCUGUGUUAUUGUAACCAGUAAAGGAGAAACUCCUCCUCAUACCUUCUGCAAAGUUGACAAAAACUUAAAUUGUGGAAUGUGGGGUUCCAGCGUGUUUCUGUGUUAUAAGAAGUCUGUACCUGCUUCAAAUGCAAUAGCAUAUAAGGCUGGUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUGUUUUUGUCUCAUUGAUUAAACACAUUUUGUCCAUGUUUUUAUUUCAUAAAAAGGUUAAUACAAGUUUUAUUUGAAUGUUAGGAUUAUUUGGACAUGAUACAUUUUGGUUUAAAUUUACACUGUCAUCCCCAAGGUGAGAAAUCAACAUGAAAAUUGCUAUCAGGAUAUUGAUACCUCUGGAACUUCUACAGAAGCAAAGAUAAAGUCUCUCUGGAUAGACACCUUCAAAACCCAGGUGUCAAGAUGAGAUGAUUAUGACAGAUCAAGGACAUAGGUACCAUAGAAAGAAUCGACAGACACAAUUAAAAAGCAGGGUUAGACCCUCAAGACAUUGAAAUGACAGAAUGACAAUAUAAAGGAUGUUAUAAAUUAAAAUAUCAUUGAGAUGACCUAAGAACUAAUGGAGGGGCUCAAAAUAUCAAGGAAGGAACAGGAUAUUUUGAAAAAUGAAUAGAUUGGGAAAAGAAUCAAGUGUUUAGAAAUGAAAAAUAUGGUCCUUAAAAUUAAAAAUUCAGUGAAUGGGUUAAACAGCAGAGAUAAGGCCAGGUGCGGUGGCUCACGCCUGCAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGACAGGUGGAUCACUUCAGGCCAGGAGUUCAAGGCCAGCCUGGGCAACAUAGCACAACUCCGUCUCUACUGAAAAUACAAAAAAUUAGCCAGGCUUGGUGGUACACGCCUGUAAUCCUGGCUACUCGGGAGGGUGAGGCAUGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGACAGAGGUUGCAAUGAGCUGAGACUGCACCAUUGCACUCCAGCCUAGGCUACAGAGCGAUACUCUUUCUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUAGCAGAGAUAAGACAUACAUGAAGGGAUAAUUAAUGAAGUGGAAGAUAGGUUACCUUAAAUGUGGUACAUACAAAUGUAAAACAUAAAAGGAGUUUUAAAAUGUAGCAGAUAGAACUAGAAGGUCUAAUAGAUAUUUAAUGAGUUACUGAAGGAGAGACUAGAAAAGGACAAGGCUACAUCCUAAGAGCUAAUGGUUGAGAGUUUUCCAAGGUUGAUGAAAAAAUUGAGUCUUCAGGUUAAAGAUGUACUCUGAAUCUGCAGCAGAGAAAAAUAAACAAAUAAGUAAAUAAAUAAAUAAUCCCACCUCUUUUUUUUUUGAGACGGAAUGUCACUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCACCUACCAGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUUAAGCAGUGGGAUUACAGGUGUGCGUCACCACGCCCAGCUAAUUUUGUAUUUUUUUUUUUUAGUAGAGACAGGAUUUCACCCUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUAAAGUGAUCCACCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUCCUGGAUUAUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-632.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -668.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 436.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.....))((((...(...((((......(((((........))))))))).).))))..((((((((((((..............((((.(((...(((...((.(((((.((.((.(((.....(((((((((((((.....((....(((((..(((.....((((((((....((((.(((((((..(((((...)))))(((((((..((((((((((((......))))....))))))))))))))).......(((((..((((((....(((((........))))).))))))..))))).....)))))))))))...)))))))))))..)))))...)).((((((((.....((((.(((....((((.((..(..((.(((((...))))).))..)..))))))...))).))))...........((.(((..(((.((((((....(((((((...(((((((.((((((((..((((.....(((((...(((((....(((((((((..((.(((((((...))))))).))..)))............))))))...)))))...)))))..)))).))))))))..........(((((((..((((((((.((.(((...(((........)))...))).))..))))).)))..((((....)))).........((((((((......(((((((.........))))))).....)))).))))))))))).....((((....)).)).....)))))))....................(((((...)))))))))))))))))).))).)))))...........((((((.........))))))...))))))))....))))...)))))))))((((((((((..(.......)..))))))))))..........))).))))))))).))..)))..)))...)))).....(((.(((((...........((..((..((.......)).))..))))))))))))))))))))))...))(((....(((((.((((((((((((((((.((((((((((((((.(((.((((((((..((((((((((((.(((((.........(((((((((((((((((((((((..((((((..(((.((((((..((((((((((((((..(((.((.((((((.(((((((.((((((((((((((((.((.((...(((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((.((((((.((((.(((.(((.((((((((((...........((((((((......((.((((((....((((((....((((((((......((((..((((..(((((....)))))..))))..))))((((((...(((((((........((((....(((..(((..((((...))))..)))..)))....))))...........)))))))....))))))...........))))))))..))))))............)))))).))......))).)))))..((((...))))..........................................)))))))))).))).))).)))).))).))).))).))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))...)).)).)))))))))))))))).))))))).)))))).)).))).))))))))))))))..)))))).)))..))))))))))))).......))))))))))))).)))........))))).))))))))))))..)))))))).))).)))))))))))))).)))))))))))))))).))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{({(,....,,,{((..,{...(({{.....,(((((........)))))}}}}.|.||},.,((((((((((((..,,,......,.{({.,,||,,{{({{...({,{,{{{.,,.{{,....,,|{(((((((((((((.......,...{((((((((((....,.{((((,{{(({((({{..}||||.(((((......)))))..,|,,,,..((((((((((.(((((((......(((({,{{((((((((((((,..,{((((.(.{{(.{(((({.,,.(((.((((...((((....))))...)))).))).,,,}))))..))).})))}|{{{(((..{{{|||.......,,,.{{||{,||{,.},.,,))}.,}}}}.{({{{...)))))..,{,...,}}))))))))))))........}}})))))....)))))))))))))}}}}}..((((((((..,,.{(((((((..(((({{{{.,(((,...,|||,}}}}|,{{{,(((({({,((((((,,{{|||}|||,}|,...,,}}.}}}}.,.}))),},,}})),,}..}))))).,))}).)))))))).,,....)).)))))}...{{{{{|{{.|{.{{{...,{{........|||{{,}}}.)),,))})},}))..,,,,,,}})}))}}.}}}}}.{(((((((....,.(((((((.........))))))).,...)))).)})}...)))).))))))),.{{{||..,..........{{....},............,.(((((...)))))|....{{{{..{{{{{.,..|{{{,,.{,,......}})))),........,.)))})..)))))}}}}.)))),..}))))))))|(((((((((..(.......)..))))))))),....{{{{{,,||{||...,,,,,))},,})|||}....,,,}..,,.|||,||||,....,....||||,,}},.}})))}..,},,},..},}},)))))))))}}))))},...}}|{{....(((((.((((((((((((((((.((((((((((((((.(((.((((((((..((((((((((((.(((((..,...,,.((((((((((((((((((((({,,{((((((..(((.((((((,.(((((((((((((({.{((.((.((((((.(((((((.((((((((((((((((.((.{(...(((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((.((((((.((((.(((.(((.{((((((((,..........,((((,.,.,,,,.,{{.((((((..,.((((((....((((((((......((((..((((..(((((....)))))..))))..))))(((((({..(((((((...,,,..((,,..,||||,..,,...||,....{{{{.{{.....)}.}))).............)))))))..},))))))...........))))))))..))))))............)))))).}}.....,))).})))}..||||,..}}||,................,,....................,,,)))))))))).))).))).)))).)))},)).))).))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))...)}.)).)))))))))))))))).))))))).)))))).)).)))})))))))))))))).,)))))).)))..)))))))))))))},.....,}))))))))))).))).,......))))).))))))))))))..)))))))).))).)))))))))))))).)))))))))))))))).))))).....}))
Back