Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DENND4C_0006400

Sequence Length

250 nt

GC Content

0.3360

UGGGGUUCCAGCGUGUUUCUGUGUUAUAAGAAGUCUGUACCUGCUUCAAAUGCAAUAGCAUAUAAGGCUGGUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUCCUUGGCUGUCAUGGUGUGGGGUGCAGACAGACUUAUAUGACGUGAAGCUAUGGAUACACGUGUGCAUUAAUUCUACCCUUGAAUGUUAACCACAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-48.71 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -51.36

Frequency: 0.0137

Diversity: 27.10

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((....((((....((((((((..((((((..((((((((((((((...((((....))))...))))...............((((((((..(((((....................................................)))))..)))....))))).))))))))))...))))))..))).)))))..))))..))((((((.....((((.......))))......)))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((....((((....((((((((..((((((..((((((((((((((...((((....))))...))))..{{{{{,...,})}}|..,(((..(((((....................................................)))))..))).,,,,,,}},))))))))))...))))))..))).)))))..))))..))((((((.....((((.......))))......)))))..)