Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0006900
Sequence Length
608 nt
GC Content
0.3997
UGGGGUUCCAGCGUGUUUCUGUGUUAUAAGAAGUCUGUACCUGCUUCAAAUGCAAUAGCAUAUAAGGCUGGUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-124.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -137.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 136.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......((.((((..(((.((((((((((((((......(((((((((((....))))..(((((((((................(((((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))..)))).(((((...)))))......(((((.(((((((...((............)).)))))))...))))).((((.((((.((((((((..(((((...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((..((.......)).))))....((....)).....))).))..)).)))))).)))).))))((((.........))))......(((((((....)))))))........)))))))))...))))))).....)))..))))))))((((......))))....(((((((((((.(((............(((((......)))))........((...(((....(((((..((........))..)))))....)))...)))))..))))).)))))).............)))))).....))))))...)))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((...((,{(({..((({(.{(((((((((,{...,,.(((((((((((....))))..{((((((((........,,{.....{((((((((((..(((.{{.............}}.})}...)).))))),})))}.,{{{{...|||||......{((({.(((((((...,(............,,.)))))))...})))}.((((.((((.((((((((..(((((...(((((.((((((((((.....)))))))))).))))).,((({,{(,...,,,.,,,)))}....((....))...,,)))},)..)).)))))).)))).))))((((.........))))......(((((({....})))))).,,,,,..))))))))}...)))))))...,}))}.})))))))}{{,,......}}}}....(((((((((((.{{{............,((((.,....}}}},.......,|,...{{{....|{{{{..{{........}}..|||},..,,)))...}}})}..))))).))))))..........}}})),})),....}})))}..,}),|...}
Back