Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0007300
Sequence Length
2296 nt
GC Content
0.3776
GUGGACUUGCUUCCUUUCUCCUUUGUUGCAAAGAAUCAGCUAUAUGGAGGAGAGGAGGGCCUGAGAAACUUUUCUGCCAUGAAGUGUUUGAGAAAUCUAUCGCCACAUUCUUACUGCACAUUAAAGUGUCAAGGGCUGUAAAGAUUUAAGUGUCACGUCUUCAUUCCACUGGUAUGGUGGGAUAAAAACUGAAAAUACAGGUAUGCUCCAGUUGUAAAUAGAAAAGAUACUGGAAUACUUCUUUGUGAAAAGAAGCAGUGCUAAUUACUAUUUGAUUAUGCACAGUUCUUGAAAUAAAGUUUUACUUCAGGGAAGUCAGGCAAAUUCAUAUCCAAAAAAUCGUGAUUUUCAUAAAAACAUUCAUACUAAUGAACCAAACCAUUUAAUUUAUAAUAUAAAAAUAAUGGCAACGACUAACGUAUAAAAUUCAGUAUCAUUUUAAAAUCUGAUACUGUAGGCUGGGCAUGGUGGCUCACGCCUGUAAUUCCAGCACUUUGGGAGAGUGAGGCGGGCAGAUCGCUUGAGGCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGCACGCAUCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCACGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCACACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAAAGCAAGAUCCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAGUGAUACUGUUAAUACUGCUGUAAUAUGUUGAUUAUGUGUGAUGUCCUUUUUUUGUUGUUGUUGUUGUUUUUGGUGGAGAAAAGAUAUCACUUAAAAAACUUAUAGAAAGAAACUGUACCAAAGUAUUCAGUUAUUUGAUAUGAGACACUUAUUUUAGAAUAGAGAGUUUUAGAUACUGAAUUUGGGCUCAAAAUUCUACUACUGAUUUUGAAGUUUUUCACUUAGAGAUGGUCUAUAUAUUGAUGACCUUAGAGGCUAAUGAACAGAUGCCAUGUAGCUAAUUUAUUCUGUGGGUCUUCAUUGUGGUUCUCAAAGUGUCACUUGCUCCUACUUUCUGGGUCUCACAUACUCUGUACUUAGUCACAGUGUUUCUGUCUCAUUUACUUUUCAUGUUGCAUGCCUUUUACACUGCUUCCCUCUUAAGAUGAGUUUAGGGGCUGUGAUAAUUUCUGUUGCCUCAGCAUUAUUUCAUAACACUUGUCUCUUCCCUGAAUUUUUCACAGAAGACUAACUGAAAUAGUUGGUAAAUUUUUCUGUAUGUUUCUUACCAUUUUCCACAAGGUGUUGGCAUGUGUAGAAGAAAAUACAUUAAGAUUGGUGAUCAAGAUUGGUUGAAUGGAAUCUCAACUAGUAUAUUAAUACAUUUUAAAUGUUACAAUGAACUGUAAAUUCAUGGGUAAAAUAUCAGGGGUAAACUUAUUUUAGUUUCUGUUAUAGCAAGGGGGAAAUCAAUUUUAAAAUACCACACAAGUAUUGCCAUGAAAUUCGGCAUUAAAAUAUUCCAUUAAUACCUAUCAUAUGCAAUUUAUGGAAAAGUAACUAUUUAAAAAAUUUAUUGUUGUCUCAUUCUUCAAAAGGUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-576.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -621.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.............)))...(((((((((..((((((((((((.((((((((((((.((((....(((((((....(((((.(((((((......((((((..(((((.((((((((.......(((((((((((...(((......)))........((((((((.....)))))))).....(((......)))......((((((................))))))...(((((((....)))))))....((((((((.....)))))).)))))))))))))....((((...))))...((((((((.(....................).)))))))).........(((((....))))).....(((((...(((((...)))))...)))))..(((.....)))........((((((((..........))))))))((((((((((......))))).))))).....(((((((((((((((((((((((((.....))))))..(((((((.(((...)))...))))))).....(((((.......((((((((((((((((((....((((((((((((....)))))..)))...((((((....))))))...(((((((.((.....((((..(((((((....((((..(((((((..............)))))))))))..)))))))....))))....)).))))))).........((((((((.(((((...((((.(.((........)).)))))...))...)))))))))))))))...))).))))))))))))))).......)))))(((.((((.((((((((((.....((((((....((((((((...((((.((((((((......((.((((((......((((...(((..((((.((((((((........))))))))(((....(((((.((((....(((((...(((.(((((((((((((((((.........))).))))).......)))).))))).))).))))).)))).)))))......)))))))..)))...))))......)))))).)).......))))))))))))..............(((((((.((((((...(((.(.((........)).))))..))))))))))))).....(((((...)))))...................(((((..((((...))))..))))).))))))))....))))))..)))))))))).)))).))).)))))))).))))))))))).))))))))))))).............))))))(((((((.((((((((((((.......((((.((((...(((((...)))))...)))).))))........((((((.....((((((....(((((...((((..((.((((((.((((.(((............(((((.......)))))(((.........))).........((((((.(((..(........)..))).)))))).......((((((((((((((.(((..(.......)..))).))))....))))))))))....(((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))))))).)))).)))))).))..)))).))))).......)))))).......)))))).))))).....)))))))...)))))))..((((....))))...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..))))))).)))))...)))))))....)))).)).)))((((((...((.(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).))).))......)))))).(((((....))))).(((((..((((.......))))..))))).....)))))))))))(((((......)))))....................(((((..((........))..))))).(((.(((((((((........(((((.((....))))))).(.((((.(((.....((((((......))))))......((((((...)))))).))).)))).)(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))).))))))....))).)))))))))))..)).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.............)))...(((((((((..((((((((((((.((((((((((((((((({...(((((((....(((((.(((((((.{(({(((((((..,((((,((((((({....{{.((((((((({{...(((......}}}..,|,||.((((((((.....)))))))).....(((......))).,.,..((((((................)))))).,.(((((((....)))))))..{{((((((((.....)))))).)))))))))))))..,...(({{.||||,..{|||||{|,|,....,..............}.)))})))).........{((((....))))}.....(((((...(((((...)))))...)))))..(((.....)))........((((((((..........))))))))((((((((((......))))).))))).....((((((((((((((((((({(((((,....|||||}..(((((((.{{(...,}}...))))))).....|||||...,,,,((((((((((((((((((.,{.,((((,,(((((....)))))..,,|...((((({....}))))).}}(((((((.((...{.((((,.(((((((....((((..(((((((.,............)))))))))))..)))))))..,.))))....)).))))))).......,.((((((((.{((({.,{(((({{.,,..,.....}},}))}}.)))),})})}))))))))})))}}.)))},)))))))))))))).......})})){{{.((((.((((((((((.....((((((..,,((((((((...((((.((((((((....,,((.((((((,((...((((.{.(((..{(((,((((((((........)))))))}(((....(((((.((((....(((((.,.(((.(((((((((((((((((.........))).))))).......)))).))))).))).))))).)))).)))))..}}}.}},))}}..))).}.))))......)))))).)).}}....))))))))))))..............{((((((.(((({{.,.{{{,{.{{........)}.}))).,))))))))))))}.....{({((...)))))................,,.(((((..((({...})))..))))).)))))))).,,.))))))..)))))))))).)))).}},.)))))))).))))))))))).))))))))}}}},.......,,,}}.)))))))..})}||((((((,.(((((({..,..,((,(,,,.,,||{{,...}}}}|,,.|}}|.||||,.......((((((.....((((((.,..(((((...((((..((.((((((.((((.((({...........,((((.......))))|(((.........)))}.,,.....((((((.(((..(........)..))).)))))).......(((((((((({({{.(({..(.......}..))).})))},..,}))))))))....{((((((((..(((.{{.............)}.)))...)).)))))))))).)))).)))))).))..)))).))))).......)))))).......)))))).,,,}}||,..,}|||},...},.}))}.})))))}}))))),..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..))))))}.)))))...))))))}..{((||{.||.,,||||||{||,{{.({{.{(((((({....,{{{,,,,,,...})}),,,,..{(((((,....})))))}.})))),}}}.)))}}|,....,||},,,.||{|{....}}}}}.{{|,...,|,}.,,....,||{...}}.,},},)))))))))))){((((......})))}......,||...........{{{{{..((........)}..)))}}.({{.(((((((((,,......{((({.......,,}}},}.,.((((.(((.....,,,,,({,,...))))}}......((((({...}))))).))}.)))),.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}))))))....))).)))))))))))..)).))))))).
Back