Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0007900
Sequence Length
1325 nt
GC Content
0.3962
GUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCUAUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-300.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -326.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((((((.((((((((((((((..(((.((.............)).)))...)).))))))))............(((((((.((((((.((.(((((((..((.......((((((.((((..(..((((((.(((..((..((.((..(((((..((((..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))......((((((((((...((((((((((...(((((..((....((((((......((((((.........))))))......))))))....))..))))))))))).))))......(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((.............)))).....))))...)).)))).((((.((((.((((........)))).)))).))))...((((((.........))))))..............))))..)))))..)).))..))..))).))))))..)..)))).......(((((....)))))...........))))))....)).)))))))))))))...)).)))))))((((((((.(...(((...)))...).)))))))).......)))).))))))))....))))(....(((((((.............................((.......))...(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..((((((((.(((({(((((((((..(((,{{...........,,}}.}}}...)).)))))})}||{,,{{{....|(((({,.,..{((((,(((((((...{(..........,,,..}}}}|||...}}}},.((((.((((.((((((((..(((({...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..{(({,{{,...,,,.,,,)))}...,((....}}...}})))}})..)).)))))).)))).})}}{(((.........))))......(((((({....})))))).,,,,,.,,,.{(|,((({{..{{{({{{{(((,,.,,{{||{..,((({{{{|,|||{.,{{{((((,{(((.....}|},,,,.....{((({......})))}.,..,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).}}..,||||||||,,,,|||...}}}.||}))}))}...}}))).}),..)}|||}},..,))),.}}}}}|}}((((.,........,}.)))),.....|,,.|||||||,..((((.((((.((((........)))).)))).)))}..,{{{{{{.......,,)}}}})||}|}|...|||.{{|},...}),})},|,.,|,}|||||||||||...||||||||{{....}|||||},.,)),,)}}}},,|||,,((|(((,,,..},}}}||||||.||||,,||.||||.,,,,..,.,,})}}...,}}},)),,},,},})))),,|....})))}.}))}}))).,..)))){.,..(((((({....,,,,,,...,,,,,......,,,,,||,,,,.,,,,|,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)))))))..,.)
Back