Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0008200
Sequence Length
2253 nt
GC Content
0.4066
GUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCUAUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAGUUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAGGUGUGCUAUCGAGUAGUGAUGCAGCUUUGUGGACUUUGGGGUCAUCCUGUUUUAGCAGUGAGAGUCUUAUUUGAAAUGAAAACUGCUAGGAUAAAGCCUAAUGCUAUUACUUAUGGUUAUUAUAAUAAGGUAGUCUUGGAGAGCCCGUGGCCUAGCAGUACCCGCAGUGGUAUUUUCUUAUGGACGAAGGUACGGAAUGUGGUACGUGGCUUGGCACAGUUUAGGCAGCCGCUUAAAAAGACUGUGCAAAGGUCACAGGUCUCCUCAAUAUCAGCUCUUCAAAAUGUCACAGGUGGAAGUGAUGGGGACACGGUGAGCCACGGUAGUGUGGAUAGUUCUAAUGAUGCUAACAAUGGGGAGCACACAGUCUUCGUCAGAGAUUUAAUCAGGCUUGAGUCCAUUGAUAAUCACUCUAGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-573.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -615.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((.(((........(((((((..((((.......)))).(((((..(((......))).))))).(((((((((..(((((((....))))((((..(((((((..((((.(((.((((.(.((((((((......((((((...((((((((.((.....(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))...)).)))))))).((((((.(((((((((((((((.((((..(((..((((((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((((((((.......((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..)))))))))))).....)))))).....(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..)))..).))).............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))....)))))))))))))))))))))..)))))))).)...)))).))))))).))))).....))..))))((((.((((((((.....((((((.....(((.((.((((((..........((.(((..((..((.((((.(((((((...(((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((((((((((((......)).)))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((((((.....(((((((.(((((........(((((((.........(((.(((((((((((((.((......((((...(((((....)))))....))))........)).))))..))))))))))))(((((((.((((.((((..(((.((((((((.((......)).)))).)))).)))))))...(((((....)))))......)))).)))))))..((((((..(((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...))..)))))).)))))))))))).))))))).))).)))).))))....))))))))))))))..(((((((((.....)))).)))))...))))))))))))))))))...(((.((.(((.(((((.(((.(.((((((((........)))))))).)..))))))))...))).)))))..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))))).....................)))))))).))..))..)))))..)))))).))))).....)))))))))))))).)))))))..).)))))))).....))))))))))))))))).)))(.((((.((((............)))).))).).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((.(((.....,,,(((((({.{(({(,......}}}}.{{{{{,,{{,.,,.,|))),}}}||,(((((((((,,((({{{{.,,,||}|((((,{{{{(({,..{{{,.,{{.{{{|,|,||{{{{{{,,,,,,(((({(,,.{((((({{.{{,,...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..,||{}|}},|||.((((((.((((((((((((((({{(((((((...((.(((.((((((((....((((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))).||,,....))))},.||||.....,,,,.,(({{....,,},,,..(((((((.((((.....,{{((({.....(((({......|}||}...,,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.{({....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......}}}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).,,...((((((({.((((((...,.,.{(....)).......))))))....(((((...)))))....,,|..((((.,,.......,,.)))),,,.......})))))))..((((,((((.((((........)))).}))).)))}..,{{{{{{.......,,|}}}}},{||.{...{{{.{|,.....)).))),,...,.)))}}})}))}}..,}})))}}),,....,|{(({....))))),.....(((((((.(((((({...,,,(({(((.{(((((((.((((...........))))....))).))))}....)))))){(....))((((({...,,}))}}}}}},,{((....))}...})))))).)))))))})))..})))))}............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))...,)))))))))))))))))))},..))))},,}.},..}))),))}}}}).}))}),,,,.}}..}}}}{{||.((((((({.....((((((.....(((.((.((((({.,,.....,{((,{((..{(,,(({,((({((,{{{,..{(((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((({((((((((......,}})))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((({((.....(((((((.(((({,......,(((((((.........{((,({(((((((((((,((,{,...,.{{,..{((((....))))}....,}}},||,...,}}.})}}..))))})})))),,||||||,|||{.|||..|{||.||||{{{{,(({,{{,,{{,||||,||||,|}}}}||.,.{{{{{,.|,|||}}..,}}|)}}}.}||}}}},,{{{{||,.|{{|||{{{,|({.{({{.....))))))}))))))).,,)),,)))))}.)))))))))))).})))))),}},.}))).))))....))))))))))))))..{{{{(((((.....))))},})))...))))))))))))))))))...{{{(((.(((.((({{{(((.{.((((((((........)))))))).}..)))))))).,,))).)))|},,(((((((....))))))}..))))))))...))).)))))))),}}}}.}}}}}},,.........,....))))))..,),,))))),}}))))).)))))..,..)))))))))))))).,}}})))..}.,)))))))},,..})))))))))))))))).)))(.((((.((((............)))).))).).)
Back