Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0008300
Sequence Length
2376 nt
GC Content
0.4061
GUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCUAUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAGUUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAGGUGUGCUAUCGAGUAGUGAUGCAGCUUUGUGGACUUUGGGGUCAUCCUGUUUUAGCAGUGAGAGUCUUAUUUGAAAUGAAAACUGCUAGGAUAAAGCCUAAUGCUAUUACUUAUGGUUAUUAUAAUAAGGUAGUCUUGGAGAGCCCGUGGCCUAGCAGUACCCGCAGUGGUAUUUUCUUAUGGACGAAGGUACGGAAUGUGGUACGUGGCUUGGCACAGUUUAGGCAGCCGCUUAAAAAGACUGUGCAAAGGUCACAGGUCUCCUCAAUAUCAGCUCUUCAAAAUGUCACAGGUGGAAGUGAUGGGGACACGGUGAGCCACGGUAGUGUGGAUAGUUCUAAUGAUGCUAACAAUGGGGAGCACACAGUCUUCGUCAGAGAUUUAAUCAGGCUUGAGUCCAUUGAUAAUCACUCUAGCACAGGUGGUCAGUCUGACCAAGGAUACGGGUCUAAGGAUGAACUUAUAAAGGAUGAUGCAGAAAUUCAUGUGCCUGAAGAACAGGCAGCAAGAGAAUUGAUAACUAAAACAAAAAUGCAAACAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-604.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -653.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 603.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((.((((..(((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))))(((((..((((((((((((.(((....))))))...(((((...(((...(((((.......((((((((......((((((...((((((((.((.....(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))...)).)))))))).((((((.(((((((((((((((.((((..(((..((((((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((((((((.......((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..)))))))))))).....)))))).....(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..)))..).))).............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))....)))))))))))))))))))))..))))))))......(((...(((((......)))))...)))((((((.((((((((.....((((((.....(((.((.((((((..........((.(((..((..((.((((.(((((((...(((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((((((((((((......)).)))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((((((.....(((((((.(((((........(((((((.........(((.(((((((((((((.((......((((...(((((....)))))....))))........)).))))..))))))))))))(((((((.((((.((((..(((.((((((((.((......)).)))).)))).)))))))...(((((....)))))......)))).)))))))..((((((..(((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...))..)))))).)))))))))))).))))))).))).)))).))))....))))))))))))))..(((((((((.....)))).)))))...))))))))))))))))))...(((.((.(((.(((((.(((.(.((((((((........)))))))).)..))))))))...))).)))))..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))))).....................)))))))).))..))..)))))..)))))).))))).....)))))))))))))).((.((((..(....)..))))))))))))..((((((......(((.((((.((((............)))).))).).)))......))))))...)))))..)))...)))))...)))))..))))....)))))(((((.((((((((.....)))))).))...))))))))).))))))...))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...,{,((({(({,{{{(((((((,..{({{|,...,,,.,,,.((({{.|(({.,,..,}}}.})}}}.,{{{{,..|||||,,....,{(({.(((((((...{(,..............)))))))...}}}},.{(((.((((.((((((((..(((({...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((({,{{,...,,,.,,,)))}...,((....}}...}})))},)..)).)))))).)))).)))}((((.........))))......(((((({....})))))).,,,,,.,},.}}}.{{{....}}))}},,}})))}...}))},}|,.}}}}}}.)})){{{{{({,..,{||.....}))}},}}....(((((......))))).,,{{,.((((...(((((,(({...((((((....(((((..{.(((((((..(((((({{{.....}|}((((((({.,,({{..((((((((.............(((((((((((({{{{.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..}}}.}))))))).....(((((({...((((((((.((((((((.{...{,((((((,.((((...,,,...{((((,,,.,|||}|....}||,,,,,..{{{(((...,,|.((....}}.......))))))....(((((...))))).....,,..((((.,........,,.)))),,,.,{{{...{({.(((((((((,((((,((((........)))).}})),))),,|}},,,||,..{{{.((((.{(.((((.{...(((.((......)).))).,.....)))).)}.))))...}}}{((((((....))),)))}.{|{{{{{,,,.......((((((.....)))))).....{{(((...,.((((...........))))....(((((({.((,,,,{{,,,,{,,,,})}|,........,((((((((({.((((,,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.))))}))))))))))))))))..,......}}}}}.((((((({....,((((((.....(((.((.((((({.,......,,((,{((..{({{((,,((({((,(((,..((((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((({((((((((......,}})))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((({((.....(((((((.(((({,......,(((((((.........{((,({(((((((((((,((,{,...,.{{,..{((((....))))}....,}}},||,...,}}.})}}..))))})})))),,||||||,|||{.|||..|{||.||||{{{{,(({,{{,,{{,||||,||||,|}}}}||.,.{{{{{,.|,|||}}..,}}|)}}}.}||}}}},,{{{{||,.|{{|||{{{,|({.{({{.....))))))}))))))).,,)),,)))))}.)))))))))))).})))))),}},.}))).))))....))))))))))))))..{{{{(((((.....))))},})))...))))))))))))))))))...{{{(((.(((.((({({(((.{.((((((((........)))))))).}..))))))))...))).))),)..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))).,}),.}})))}...........,,,,,)))}))..,),.))))).,)))))).)))))..,..))))))))))))))..))))))}....})))))..))}...)))).)))))))))).}}...}.))))))))...........)))))))),.)))))))))).)))..))))))).}.)))))..)).)))).....))}))))).)))).}||{((.((((((((.....)))))),)).},},,,,},,,.,,,,,....,,,}....})}}}}}
Back