Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0008800
Sequence Length
507 nt
GC Content
0.3964
UUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-100.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.......((((....(((.((((....(((...(((((......)))))...)))................(((.(((((......)))))))).)))).)))....))))..(((((.((.((((((....((..((((.((.(((...((((((..........))))))....))).)).))))...........)).....)))))).))...)))))....(((((.....)))))))))))))(.((((.(((.(((((((((((((((((((((.((.(((((...((((...(((((.........(((((((.((((.....((...(((((....)))))....)))))).))).)))))))))...))))...))))).)).))))..)))).)))..))))(((((((((.(((.....(((.((.(((.........))).)).))).))).))))))))).......))))))..))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{,((((((.((((.{.{.(({.((((((({(((...(((((......))))}...}))...,,.,{{{{.,,,{(((.(((((......)))))))).||||,||}}}.,|{,,,.((({{,{..{{((||....,|||{{{|..||((|,..,||||}}}}}........))}}|||...,})}{{{.{{{{{{...{{{{{{.{{{,,||||,||,..{{{((({{({((({...,,|}}}}))),.,,,,,..}}}}}).,}},,.}|}|,.}}}},..,,|,((((((((({.......,{{,,(((,,....{{{,...||,.|||,..||,..|((((....))))),...,}})))))))))),.,))))}.)))))}.))))))))))).))),})))).))))))}}.,.((((((.,,,.({{,..((,{.,..,,.,}|...||}|},.|||,|,,.,}|||||,,..{|.,,,)}..}.}}))}))))))
Back