Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0009300
Sequence Length
670 nt
GC Content
0.4134
AUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-148.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -162.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 201.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))..))))(((......)))((((((..(((((.(((((((...((............)).)))))))...)))))......((((((.((((((((.((.....(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))...)).))))))))...))).)))((((((((..((((((.((.........(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).)))((((....))))....(((((....))))).((((......))))....(((((((((((.(((............(((((......)))))........((...(((....(((((..((........))..)))))....)))...)))))..))))).))))))......(((..((((((((.(((.....((((((......))))))......((((((...)))))).))).)))((.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))).)))))..))))).)))).))..))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,(((((((((((..(((,{{.........,.,,||.}}|,,.}}.})))).})))){{{......)))((((((..{((((.(((((((...,(............,,.)))))))...))))}..,,{.(({{{(,(((((({{,((,,...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..,||.}||}}}}}...})}))}}{(((((((..((({{{{(({{,|.,{{.{{{.{(((((({....{(((.........))))......(((((({....})))))).}}}}}.}}|,|||,{{,....||||,...{((((,...,}}}},(({,....},},,,...,{{{(,{{((({......,,,.......,((({.,....}}},,.......}|,.,,|,,....|||||..,,........}|..|||,,..,,}))},,}|,}},|))))}.)})))}...........,.,,{{{(,{{{.....,,,,,(,,,...))))}}......((((((...}))))).)},.})}|,,(((((((...(((((.((....(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..))))))))||||||||,,,,}}}))))}))}})))))))}))))))
Back