Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0009500
Sequence Length
1261 nt
GC Content
0.4021
AUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCUAUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-281.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -307.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((..(((.((.............)).)))...)).))))))))((((.(((...((((((......(((((.(((((((...((............)).)))))))...))))).((((.((((.((((((((..(((((...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((..((.......)).))))....((....)).....))).))..)).)))))).)))).))))((((.........))))......(((((((....))))))).))))))(((.(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))))).((((((((.....((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..))......(((((....)))))......(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..........)))))))).((((......))))))).))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{(((,{(((((({(,.{((,,{..,,,,,.,,,,,|,.,}}...||.}}}}}|||,(((({{{,..,||||{......{((((.(((((((...{(............,..}})))))...}}}},.{(((.((((.((((((((..(((((...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((({,{{,...,,,.,,,)))}...,((....}}...,})))},)..)).)))))).)))).)))}((((.........))))......(((((({....})))))).,,,,,..,,.(({,(((((..(((((((((((...,,(((((...((((((({{{{{{.,{{,(((({{(((.....}}}.........{((({......})))},,..,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).}}..,)|||||||,,,,|}}...))),,,}))))))...))))).})...)))))))}..,)))..))))))))((((.,........,}.)))).....,|{{,||||,||,..((((.((((.((((........)))).}))).)))}..,{{{{{{.......,,)}}}}),|}},|.,,|||.{{}},,..)),))).,.,,,.}})}}})}))}),,},}|,||||{{,,,,|||{|{....))))),.....{{(((((.{((((((,.....((((((.((((((((.((((...........))))....))).))))}....))))))((....))((((({...,}}))),|||},.(((....))}...})))))).))))))}..,,..,,,,.||......,||}},,,..,})})))})},)}})}
Back