Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0014100
Sequence Length
1693 nt
GC Content
0.4052
AUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAGUUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAGGUGUGCUAUCGAGUAGUGAUGCAGCUUUGUGGACUUUGGGGUCAUCCUGUUUUAGCAGUGAGAGUCUUAUUUGAAAUGAAAACUGCUAGGAUAAAGCCUAAUGCUAUUACUUAUGGUUAUUAUAAUAAGGUAGUCUUGGAGAGCCCGUGGCCUAGCAGUACCCGCAGUGGUAUUUUCUUAUGGACGAAGGUACGGAAUGUGGUACGUGGCUUGGCACAGUUUAGGCAGCCGCUUAAAAAGACUGUGCAAAGGUCACAGGUCUCCUCAAUAUCAGCUCUUCAAAAUGUCACAGGUGGAAGUGAUGGGGACACGGUGAGCCACGGUAGUGUGGAUAGUUCUAAUGAUGCUAACAAUGGGGAGCACACAGUCUUCGUCAGAGAUUUAAUCAGGCUUGAGUCCAUUGAUAAUCACUCUAGCACAGGUGGUCAGUCUGACCAAGGAUACGGGUCUAAGGAUGAACUUAUAAAGGAUGAUGCAGAAAUUCAUGUGCCUGAAGAACAGGCAGCAAGAGAAUUGAUAACUAAAACAAAAAUGCAAACAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-429.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -463.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 454.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)((((........((((......))))......(((..((((((...(((((((((((.(((((.((((........(((........)))(((.((((((((.(.....((((((..((((...(((...(((((.....)))))....))).......((((((.......((....)).......))))))....(((((...))))).........((((.............))))....((((...(((.(((((((((((((((((((........))))...))))))..)))........(((.((((.((.((((.....(((.((......)).))).......)))).)).))))...)))(((((((....))).)))).(((((((..........((((((.....)))))).....(((((.....((((...........))))....(((((((.(((.....)))((....))............((((((((((.((((........((((.....((((((((..(((((.(..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)).)))))))..))))))...)))))))).....))))........))))))))))))))))))))).........))))).((((((((.....((((((.....(((.((.((((((..........((.(((..((..((.((((.(((((((...(((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((((((((((((......)).)))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((((((.....(((((((.(((((........(((((((.........(((.(((((((((((((.((......((((...(((((....)))))....))))........)).))))..))))))))))))(((((((.((((.((((..(((.((((((((.((......)).)))).)))).)))))))...(((((....)))))......)))).)))))))..((((((..(((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...))..)))))).)))))))))))).))))))).))).)))).))))....))))))))))))))..(((((((((.....)))).)))))...))))))))))))))))))...(((.((.(((.(((((.(((.(.((((((((........)))))))).)..))))))))...))).)))))..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))))).....................)))))))).))..))..)))))..)))))).))))).....))))))))))))))..)))))))....))))))..)))...)))).))))))))))......).)))))))).)))......))))..)))))..)))))))))..))...)))))).)))..((((......))))..........((((..(((((.((((((((.....)))))).))...))))).................))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{..,,,{,|||(({.({(({...}})},,.....,{((,.((((((...(((((((((((.(((((.((((........(((......,.}))(((.((((((((.{...{,((((({,.((((...,,,...{((((,,..,|||}|....}||,,,,,,.{(((((...,,|.((....}}.......))))))....(((((...)))))....,,,..((((.,........,,.)))),,,.,{{{..,|||,|||{{((((,((((,((((........)))).}})),)))},}}},,,||,..{{|.{({{.|{.((((.{...(({.((......}).))).,.,...)})),)),))))...}}}{{{((((....}}},}}}}.{||{{{(,,,.,,....{(((((.....)))))}.....{{(((...,.((((...........))))....(((((((.((,,{,{{},,{{,,,,}}}|,,,......{((((((((({.((((,,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.))))}))))))))))))))))..,......}}}}}.((((((({....,((((((.....(((.((.((((((........,,((,(((..{({{((,,((({((,(((,..((((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((({((((((((......,}})))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((({((.....(((((((.(((({,......,(((((((.........{((,({(((((((((((,((,{,...,.{{,..{((((....))))}....,}}},||,...,}}.})}}..))))})})))),,||||||,|||{.|||..|{||.||||{{{{,(({,{{,,{{,||||,||||,|}}}}||.,.{{{{{,.|,|||}}..,}}|)}}}.}||}}}},,{{{{||,.|{{|||{{{,|({.{({{.....))))))}))))))).,,)),,)))))}.)))))))))))).})))))),}},.}))).))))....))))))))))))))..{{{{(((((.....))))},})))...))))))))))))))))))...{{{(((.(((.((({({(((.{.((((((((........)))))))).}..))))))))...))).))),)..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))).,}),.}}))}}...........,,,,,)))}))..,),.))))).,)))))).)))))..,..))))))))))))))..}))})},.,..}})))),,))}..,)))).)))))))))).}}...}.)))))))).}}}......))))..)))))..))))))))}.,))...)))))).)))..{{((......)))}....}},,.,|{{{..{{(((.((((((((.....)))))).))...))))).................))),....)}}}
Back