Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0015400
Sequence Length
2086 nt
GC Content
0.3351
GCUGGUCUGGCUUUGGUUUUUAUUGUUUCAUGAUCAUAGAUUAUAUUGAAUAAUGGCGUUAUGAUUAUUUUUAACUGUGAGGGCUGGAUGAACUACAUGUGCUUUUAAUCCUUACUUAAAUUCCAGUUCUUGUCUUUGGGCACACAGCAUUUUUGAAGCCUACCAGUAGGUAGUUUGAAGUCUCAUGUCAACUAGGUUUGACACUUAGAAUAUUAUAAUUCUAAAAUGUAACUUUUGAAUCUAGACUUCAGUGUUGUAUUCCUAACUCCAACAUUGAAAAUAUAUGUUGGAAGGUUAGAAUGAGAUGGCUAAAUUUGACAGAGGUCGAUUGAAUGAAAAGAGAACUUCCUUGAAAUUCACUUAUUCAAAUUGUUUGCAUCAGUUAAGACUGUAGUAAAAACAUCUUUUCCAUUUUCUUGUUUUAGGUUGAUGCAAGAAUUUUGUCUAGUAAAAGCAGAUUAUGAAUAACACAUUUUAUGAAUUUUGUUCUGAUUUAAUAGAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGUGAGUAGCAUUGAAAGUACAAUUCCUUUUAUUGAGGUGAAAAAUAUUUUAUAUUUGAUGUUGCUGCCAAGAAAUACUUAUUGUAUAAAUUAUUACAAAUUCACAUUCAAAUAUAAUGAACCUCCAUGUAUUUGUAACCUAGCUUUAUGACUAGAAUUUCUUGUAAUUUUUAUAGCCCAUUUUUCUCCUGAGAAAUCUGAAACUAGAGAUAUUUAAUUAUGAAAAGUCAAAGAUGUUACCUAUAUUUACAAUAUCUUGUAGUCAGUUAUUUUAGUAGAACAUAACUGGAGAUUUGCCUUCAGGUAUUUCCUCAAUUUUGCAUAGUUCCUUGGAUUUGUACACUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAUAGAGCAGAGUCUUGCUGUGUUGGCCAGGCUGGACUUGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCCUCCUCCCUGGCUUUCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCACUUGGCCAGAUGUGUACACUUUUGGCUUUACAAUUAGUUUGUGCAAUGAGGGCACUACAUUUUAACCAUUUUUGACUAAUGUAACUUUGUUCCAGGGAAAAACGUAUACUCGUUAUUUUUAGUAUGUUUUGUUUUAGGGAAUUAUAGAGAUUUUUGUUGUUAUUCAGCUACUGUUAUAUAUGUAGUAGCAAUCUUACAUCUAUAUCAAUAUUUAUGUGAAAUUAUUUUACUUCUCUGUGCUUUUUACCUAGUGAUUACUUUAAAAAAAAUCUGUAUUUUCCCAAUAAUCCUUUUGUCCUUUAUCUUUUCUGCUUUAGUGUAACUUACCACUUAAAUAUUUAGUUACUACUUACUGGCUAGUUAUUAUGUAGGAAUAUAAAGAAGUAUAAAACCUAGCUCUAUGGGAUCUUAAAUGGAAAAUAAUUAAGAUAUUUUAAAAAUAGAACAAGUACUCAAGAAAACAUAUUUUACACAGUUUUAAUUUGGAAGUUUUAAGAGUUCAGAAAAAAAAGGGAUGUUCUUCCAAAUAUUCCAGUAUUUCAAAAUGGGUGUUUUGGAAGACUUCGUGGAAGAAGCAUGACUUGGAAGAAUGGGUAGAAUGGAGAUAAAUGGAGAAGAACAGAAAAGGCUUUCUGGAAGUCCAUAGGCAUUAAGAGUCAAAUCUGAGUUAGAAUUUCUACUUUGUUAUUUAUAAAGUCUUCCUGGAGCUUAUUAAAGUUUUCUCUAAUGGGCGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAACACUUUGGGAGACUAAGGCAGGCAGAUCACCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-516.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -560.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 561.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.(((..(((((((((.((((((...))))))...))))))))).((((.((....)).)))).(((((((.((((...((.....))...)))).))))))).....(((((((((.((((((((((...(((((((.........(((((....)))))..((((((((....((((..(((((..(((.(((((((......)))))))..))))))))))))....)))))))))))))))...))))..((((((((.........)))))))).(((((........)))))....(((((....)))))..((((...(((........)))...))))(((....((((...(((((((((.(((((((.............................)))))))..)))))))))...))))...)))....((((((((((((........)))))))..)))))((((((((...)))))))).......))).))).)))))))))((((....((((..(((.((((((((.((((((((((..((..((((.((((((.....((((.((((.((((........)))).)))).))))...((((((.........))))))...((((((((((..((.....(((((((.......((((((((((...((((((((((....))).)))).)))..))))))))))..((((((.....))))))(((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....)))))(((.....))).((((((((((((.(((.(((...((((((....))))))...))).))).))))))))))))..((((((((.....(((((........))))).........((((((((.((......))))))))))....(((((.....).)))).))))))))..............)))))))..)).))))))))))..(((....(((......)))....)))....(((((.....))))))))))).))))..))...))))....))))))........((((((..(((....)))))))))....)))))))).)))..))))..)))).......................(((((.(((((....))))).)))))))))))))))))).........)))((((.((((((..(((((.(((.((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((((.((....)).))))))).............((((.......))))..(((((((.((((((((..((((.((...(((.(((((.(((..((((......)))).((((((((((((((((((((.(((((..(((.((((((((.(((.((.((((((((((.........)))))))....((((((..(((....)))..))))))........(((......)))............))).))...))).)))))))).))).))))).......((((..((((.(((..(..(((((..(((((((((................)))))).)))....))).))..)..))).))))....))))..........((((......))))(((((((.((.....)).)))))))......)))))))))))..)))).)))))..........((((..((((..(((.(((.((....)).))).)))..))))..).)))(((((((((...((((...........))))...))))))))).))).))))).)))....)))))))))))))).)))))))........(((((((((....((.(((((((..(((((.....(((.(((..((.(((....))).))..))).)))(((((((.....)))))))))))).))))))).))....)))))))))..))).))))))))))))))))))))))))).)).)))))))).))).)).)))..)))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((({{{(((...,{{{({{{.((((((,,,|}}}}|,,.}}}})))),.{|||,||,,,,,,.}}}}.(((((((.((((.,.((.....)).,.)))).))))))).....(((((((((.((((((((((.,.(((((((......,,.(((((....))))),,|(((((((....((((..(((((..(((.(((((((......)))))))..))))))))))))....))))))))))))))).,.}}||{{((((((((.........)))))))).||||||{{{{{{.||,,,..,.(((((....)))}},(((((...{((.{,..,}}}}).,,))))}}}}}}}}||{,{.(((((((((,(((((((.,.,|,,{{,.....,,,,...,,,,||.))))))}..}))))))))}}.}}||,,|.,,....|||||(((((((........))))))).,|||}}((((((({...}))))))).,}}},}))),})).)))))))))((((..,.((((..(((.((((((({.,,{,,,,,{{..{{,.{{{,.{{{{{{.....((((.((((.((((........)))).)))).))))..,((((((.........})})}}...((((((((((..((....{((((({(.....|{({{{{(((((...{{{{((((({....})}|}}}}.})},.)}}}}}}}},..{(((((.....)))))}{{{{{.{{{{{{{{.((((...........))))...,))),))}||,..,|}}}}|{{....,))}.{(((((((((((.(({.{{{,,|{({,,,.}}})})}},..,}}}.}}}.}))))))))))),,{(((((((.....{((((........))))}.........(((((((,,((......))))))))))....(((({.....).)))).}))))))).,,,,,,,,,,,}.}}}}}}}}})).))))))))))..{{({{(((((((({{.{{((....{{{...}}},,,...}))).))).)))))))).}))}{{|||{{,{{,,,,))}.}}}}}}|((((..((((....))))..)}}}}..)))))))).)))..))))}.)))).......................(((((.(((({....})))).)))))))))))))))))).........)))((((.((((((..(((,({(((.((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((.({,(((((((.((....}).))))))}...|,,..,,,.,||{{.......))}}..(((((({.((((((((.,(({{,({...{{{.(((((,(((,,((((,,,...,|}}.,{{{.{|||||{{{|{{{{{.(((((..(((.((((((((.,,{....,|,(((((((,.......,))))))),,,.((((((..(((....)))..)))))).,,,....{{{......}}|.,........}}})}..,...,,,.)))))))).))).))))).....,,,,{{{{{{((((((..(((((((,..{{{({((((..{{|,...,,,,.,,{{{||..,,,...)))},)),))),,.)}))))}.}})}})..,.,,....((((......))))(((((((.(,.....},.)))))))......}}}}}}}}}},.,}}}}.,}}|,,,,.....,,,,...,||||..|||}|||,||.,..}),)})}}},...,}}}}}}}|,(((((((((,,.((((...........)))).,,))))))))),}}}.))))),))),,,.}}}))))))))))).})))))).,,.....(((((((({.,..{{.{((({{||.(((((....,{({.{{{..((.(({....))).))..))).)))|((((((.....))))))}})))).))))))}.||...,))))))))).,))).))))))))))))))))))))))))).)).)))))))).))}.)).)))..)))))).))))
Back