Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0022600
Sequence Length
1630 nt
GC Content
0.4184
GUAGUAUAUCAAAUGUGCUGUUUUCUACUCAAGAUCCAGUUGAAGAUGCAGUCUUUGGCGAAGCUACUAAUCUCAAGAAGAAUGGUGAUAGAGGAGAAAAAAGACAAAAGCAUUUUCCUGAGAGGAGUUGUAGUUUUAGUUCUGAAAGUCGAGCAGGAAUGUUGCUUAAGAAGAGUAGUUUGGAUUCGAAUUCAAGUGAAAUGGCUAUCAUGAUGGGAGCAGAUGCCAAGAUUCUCACAGCAGCAUUGACAUGUCCUAAGACUUCUCUACUUCAUAUUGCAAGAACCCAUAGCUUUGAGAAUGUUAGCUGUCACCUACCUGAUAGUAGGACUUGUAUGUCUGAAAGCACUUGGAAUCCUGAGCACAGAUCAUCUCCGGUGCCAGAGAUGCUUGAGGAAAGCCAAGAACUCCUUGAGCCUGUGGUUGAUGACGUACCUAAAACUACUGCAACAGUAGAUACAUAUGAGAGUCUACUAAGUGAUAGUAACAGUAAUCAGUCCAGAGACUUGAAAACAGUAUCCAAAGAUCUGAGGAAUAAGAGAAGUAGUUUAUAUGGUAUUGCUAAGGUGGUUCAGAGGGAAGAUGUUGAAACUGGACUAGAUCCUUUGUCUCUUUUAGCCACUGAAUGUACAGGAGGAAAAACUCCUGAUUCUGAAGAUAAGUUGUUUUCUCCAGUUAUUGCACGUAAUCUGGCUGAUGAAAUAGAAAGCUAUAUGAACCUAAAAAGUCCCCUAGGUAGUAAAUCUUCUAGUAUGGAAUUACACAGAGAGGAAAACAGAGAGUCUGGCAUGACUACUGCAUUUAUUCAUGCUCUAGAGAGGAGAUCAAGCCUACCUUUAGAUCAUGGUUCACCAGCACAGGAAAAUCCUGAAAGUGAAAAGAGCUCACCUGCAGUGUCCAGGUCUAAAACUUUUACUGGGCGUUUCAAGCAGCAAACCCCCUCUCGAACUCAUAAAGAACGUUCAACUUCUUUGUCAGCACUGGUGCGUUCUUCGCCACAUGGCUCGUUGGGUUCUGUAGUAAAUUCUUUGUCAGGGCUAAAGCUGGAUAAUAUACUCUCAGGGCCCAAGAUAGAUGUCCUGAAAUCUGGUAUGAAACAAGCAGCGACAGUAGCCAGUAAGAUGUGGGUAGCUGUUGCGUCUGCCUACAGCUACUCAGAUGAUGAGGAAGAAACUAAUAGAGACUACAGCUUCCCAGCUGGCCUAGAAGACCAUAUUUUGGGGGAGAAUAUAUCGCCUAACACAAGUAUCUCAGGGUUGGUCCCCAGUGAACUUACCCAGAGCAACACAAGUCUUGGCAGUAGCAGCAGUAGUGGAGAUGUAGGAAAACUGCAUUAUCCAACAGGUGAAGUUCCAUUUCCAAGAGGCAUGAAAGGGCAAGACUUUGAAAAAUCAGAUCAUGGUUCUUCUCAAAAUACCAGCAUGUCUAGCAUCUAUCAGAAUUGUGCAAUGGAGGUUUUGAUGUCCAGUUGUUCACAGUGUAGAGCUUGUGGAGCUUUAGUUUAUGAUGAAGAAAUUAUGGCUGGAUGGACAGCAGAUGACUCAAAUUUGAAUACAGCUUGUCCAUUCUGUAAAAGCAACUUCUUGCCUCUUCUCAAUAUAGAAUUCAAAGAUUUGAGAGGUUCUGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-451.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -484.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 436.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..........(((((((..(((((((((((...((((.((((((.(((((((((..((((((((.(((.....))).)))).....(((((((..............)))))))..(.(((((((((((((((((...(((.(((..(((..(((((((((...((.((((..(((((..((...(((..((((........))))....)))...))..)))))))))))..)))))))))....))).....))))))...)))...(((((((.(((((((..(((((.(((..(((.(((((((......)))))))..))).......))).))))).(((((..(((((((((.......((((........))))))))).))))...)))))........(((((((((((.((.((((((((.....((((((...))))))........(((((..(((((.....))))).((((((..(((....(((((((....(((.(((....))))))................(((((((((((..(((...(((((((.(((((((.............(((.....)))....))))))).)))))))....)))((((((......)))))).....(((((((...))))))).((((((((.....)))).))))...............)))))))))))........(((.((..((.((((.(((........))).))))))..)).)))...((((...))))....(((.((((((.....(((((.((((((((((........)))..))))))).)))))(((((.....(((((...)))))...)))))...........))))))))))))))))...))).))))))((.((((........)))))).)))))...((.((((((((........)))))))).))....)))))))).)).)))))).)))))..))))))))))))))..((((((.(((.(((((..((((.....((((((.(((((((...........))))))).....)))))).......)))).....)))))......((.(((((((((((.((....))..))))))))))).))..))).)))))).......)))))))))))))).))))).)))..))))))......(((((.((.......)).))))).....))))))..((((.((((......).))).))))....))))....))))))..))))).))))))).(((((((((((.....))))))).))))..((.(((((((((((.......(((((((....((.........(((.(((((.....))))).)))........))..)))))))(((.(((((....(((((((((((((.((....)).)))).)))..)))))))))))))).))))))))))).))((((((......))))))((.(((((((((((.......(((....))).....)).))))))))).)).......))))(((((..((((((((................))))))))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((......,|||(|{({((((({.(((.,,.,...(((((((((...|})))}}}}....,(((((.(((.....))).))))}...))).})}},,.,},},...}}}}}}|((((((((..((((((((((((((((((((((((..{{({,(((((((((...{.,((({..(((((..((...(((..((((........))))..,.)))...))..)))))))))))..))))))))}....}})},,..)))))..........((((((,,(((((((..(((((.(((..(((.(((((({......}))))))..))).......))).))))).(((((..(((((((({......,(({{.,,,,.},))))))))}.}))}...))))).......{(((((((((((.((.((((((((.....{(((((...}|||||((.{......{{||||}||...|{,|}}},...,,.,|||,|{.,,|)))}},,...{,|,||{....|,}|||,.{,...,{{{{(((.(((((((((((.,{{({,.{((((((,(((((((.,,{{{,,,,,,,{{{,.,,||,},||,|}}}}}|.}}}}})),,,,,,.((((((......)))))),,,}.{{{{{{|...})))))}.||||{{{{.....}},,.})))}}},.....}}}...))))))))))},,......{((.(({{(,,(,,,.,||}}}},...))).}},}...{||{||....{{{,.{({|,,....))}),|||,......,((((.((((((((((........)))..))))))).))))}{{{{{.....(((((...)))))...||||,....,,,,,,,||}|||((((((..............))))))|||,,..,,}}......,)))))){{{({,,,,,,||,.}}}}.)))))))),),}}..,.)))))))).,)})))))).))))),.)))))))))))))).........})))))))))))))|.,}}}}...))))))))|.....((((((((||..({.,,(((((((........,.||....}).((((((...((.(((((((((((.((....))..))))))))))).))..|{.(((((....,........,}}.,,)))))))))))))..{(((((((((.,,(((((.((.......)).))))}.....{{..(((.((((.((({......).})).)))).)))..))..,{((((((.{..,,,{{{(,.,..(((((((({{(,....|}}||||.}}},...|}||,||||||}}}}}}}..,,}|.}}....}.))))))}|{({....}}}},..))))}})))))....})))))).)).))..)))))))))...(((((((((((((.((....)).)))).))),.)))))).|{{{{({{.,.)))))))},|{((((((......))))))||.(((((((((((.,.{,..(({....))).,.}.))}})))))))),||....}},})))(((((..((((((((................))))))))....)))))
Back