Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0023400
Sequence Length
843 nt
GC Content
0.4152
GAAGAAACUAAUAGAGACUACAGCUUCCCAGCUGGCCUAGAAGACCAUAUUUUGGGGGAGAAUAUAUCGCCUAACACAAGUAUCUCAGGGUUGGUCCCCAGUGAACUUACCCAGAGCAACACAAGUCUUGGCAGUAGCAGCAGUAGUGGAGAUGUAGGAAAACUGCAUUAUCCAACAGGUGAAGUUCCAUUUCCAAGAGGCAUGAAAGGGCAAGACUUUGAAAAAUCAGAUCAUGGUUCUUCUCAAAAUACCAGCAUGUCUAGCAUCUAUCAGAAUUGUGCAAUGGAGGUUUUGAUGUCCAGUUGUUCACAGUGUAGAGCUUGUGGAGCUUUAGUUUAUGAUGAAGAAAUUAUGGCUGGAUGGACAGCAGAUGACUCAAAUUUGAAUACAGCUUGUCCAUUCUGUAAAAGCAACUUCUUGCCUCUUCUCAAUAUAGAAUUCAAAGAUUUGAGAGGUUCUGCAAGCUUUUUCCUGAAACCAAGUACCUCUGGUGACAGUUUACAAAGUGGAAGCAUUCCAUUGGCAAAUGAAUCCUUGGAGCACAAACCUGUAUCCAGUUUAGCAGAACCUGACUUGAUCAACUUUAUGGACUUCCCAAAACAUAACCAGAUCAUAACUGAAGAAACAGGCUCUGCAGUUGAACCAAGUGAUGAAAUAAAGAGAGCCAGUGGAGAUGUCCAAACUAUGAAAAUUUCAUCUGUGCCUAAUAGUUUAUCAAAGCGAAAUGUGUCUUUGACUCGAAGUCACAGUGUUGGAGGCCCAUUGCAGAAUAUUGACUUUACCCAGCGACCGUUUCAUGGCAUCUCAACAGUUAGUCUUCCAAAUAGUCUGCAGGAAGUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-219.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -237.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 218.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(................)((((((((((((((((.....((((((......(((((.((.......)).))))).....((..(((.((((.((((......).))).)))).)))..)).....((((((.((((((..((....(((((((((((.....))))))).)))).....))..)))..))).))))))(.(((((((.(((..((.(((((....))))))).((((............))))((.......)).....((((.(((.((((((((.(.(((((((........(((((.(.((((((((((((....((((((((((((((......))))))((.(((((((((((.......(((....))).....)).))))))))).))....((((....)))).....(((((................)))))((((((((((((((.....(((..((((........))))..))).......(((((((...)))))))...............(((..(((....))).)))))))).)))))))))....(((((....(((((............)))))...))))).))))))))..)))))))))))).))))))....(((((((......((.(((((..(((((.((........))..)))))..))).)))).....)))))))........((((.(((((...))))).))))..))))))).))))))))).))).))))...........).)).))))))).).............))))))....))).)))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(................)(((((((((({{((((,,...((((((......(((((.((.......)).))))}.....((..(((.((((.((({......).})).)))).)))..))....{((((({{,{{,{(,,(,.,.,(((((((((((.....))))))}.)))}.,.}|))..))}.,})),)))}},{}|,||{{{.|{|,,||}|{(((....}))}},,.{(((|{{|.{{{{{{,.||{({({{{{{.|,.....,,||,,,|}|||,,|||.,}||||||,,..{(.(((((((.(.((((((((((((....(((((((({(((((...,...{{{{{((.(((((((((((.,.{,..(({....))).,.}.))}})))))))).))....((({....})))...,{(({,,...,,,.......,,,|}}}}((((((((((((({.....(((..((((.,......))))..))).......{(((((,...|)))))},,.....,...,,.{(((.,({{....))).)))))))).)))))))))....,||}}....,{,(({.....}}}...)))))....)))))))))))))..)))))))))))).)))))},)).)),{,,,.....,||}||||{{|((({{,|{|{....,{||..,})))},}}},}},,..,,|||},,,,,,}}{{{{((,({(,(((...,||||{||},,{|||||}}.}))}})))).})).})))}}}}...}}}.)}))})))),))}),}}}}........))))))....))),)})..))))))))))
Back