Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0025000
Sequence Length
1469 nt
GC Content
0.4336
GAGAAUUGCUUGAACCUGGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUUGCACCACUGCACUCCAGUCUGGGUGACAGAGAGAGACUCUGUCUCUGAAAAAACAACAAAAACAUUUAGGCUGGGCAUGAUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGUACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGCAGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGGCAACAUGGCAAAACCCCAUCUCUACAAAAAAAUACAAAAAAGGUUAGCCCGACACCAUGGCACAUGCCUGUAGUCCCAGCAACCAGGAGGCUGAGGCAGGAAAAUGGUUUGAACCCAGGAGGCGAAGGUUGCAGUGAGCUGAAAUCACACCAUUUAAUUGUAGAGGUGUUUCUUCUCUGUUUUUUCUUUUAGCUUCAAGGGUGGAGCUAAGUCAAAUCAUACUCUUUAAUUCCUGACACACUAUCAUCUUUGGACUGUGCAAGGGCCCUCUCGUGUUUAUCCUCCUUUCCUCAUUCCCACCCUCAUUCCCCUAUUCUACGAAGACACUGACUCUGCUAAGUGUGAUAUAUAUCUAAAUUUACUUCUUUUUAUUGCUCUAUUUUAAAUCUGGGUUACUAUAUGUACAUCUAGUUUAUUCCUUUUCUUCUACAGGAAGUUAAUAUACCUUUCUACUUAUCCAUUAUUCUAGUGUUGGGUACUUCAGUUACUUUCAGUUCUCUGUUACUACAAACACCACGGUAGUAAUGCAGUGCACUGCAAAAUACAUGUCCCCUUUUGGACUUGUGAAGUAGUUUCUCUAAGAAAACGAUAAUCCUUGGAGUAAGAUCAUUUUCAUACAUGAUUUUAGUAAACACAAAAUAUUGCUUCCUAGACGGCUGCACUCCCACAAGUAGUACCCAAGAAUUCUCAUUUCUAUAUAGCCUUACCAGCAUUUGGUAUUAUCACUUUUUAAAUUUUGGCAUUGUUUGAAUUUCUCUUGAUACUGACAAAUUUGAGUGUCUCUUCAUUACUUGUUAUUCUAGCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGAGACAGAGUUUCACUCUUGUCGCCCAGGCUGGAGUCCAAUGGCACAAUCUUGGCCUACAACGUCUGCCUCCCAGGUUGAAGCGAUUCUCCUGCCUUAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAGUGCCCACCACCAUGCCCAGCUAAUUUUUGUAAUUUUUGUAGAGAUGGGGUUUCGCCAUGUUAGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGAUCUCAGAUGAUCCACCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCACCUGGCCUGCUCUAGCAUUUUCUAUGAAUUGGUUGCUUAUGUUCAUUGCCUAUUUUUUUUUUCUUUUUUGGCUGUUUGUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCGCAAUCUUGGCUCACUGCAAGCCCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-627.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -648.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 200.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((.((((((.......((((((((((.(.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((((((((((((((((((..(((((((...((((((.......(((((....((...(((.(((((((.(((.((((((((((((((((.(((.((((.((((..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((.........((((((..((.(((((.............(((((((((....)))))))))((((...................)))).(((..((.......))..)))..((((.......(((......................)))........)))).......))))).))...))))))...)))))))..........(((.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).))).............((((((.(((....))).))))))...........)))))))).)))(((((((..........)))))))(((((....)))))...((((.((((......)))).)))).........(((((((............)))))))(((((((((........)))))))))...............(((..((.....))..))).....(((((((((.....((((.......)))).........(((((.....))))).........(((((((.........)))))))........((((((.(......).)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...)))).)))).)).)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)))).)))).))).)))))))))))))))).).)).))))))).))).))...)))))....))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))..))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))((....)).......((((((...........)))))).(((...................)))..)))))).))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))).)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.........,...)(((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((.(((({,.,{,..,((((((((((.{.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((((((((((((((((((..(((((({,.{((((((..,....(((((....{(...(((.(((((((.(((.((((((((((((((((.(((.((((.((((..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((...,,,...((((((,,((.(((((..,{,.......,{((((((({....}))))))))|..,.,..,.,.........,{{(|.((((,,.{{{....))),.)))),.||||.......|||......................}}}...................))))).))...)))))),},))))))}..........{({.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).}}}.,,.,....,{{,((((((.(({....))).)))))).....,.....)))))))).))){((((((..........))))))}{((((....))))}...,(((.((((......)))).)))|,,(((({..(((((((.,...,,.....}}}}}}}(((((((((........))))))))).,..........,})))|})}.,,},.)),}))},,...(((((((((.....((((.......}}}}.....{,,.(((((,...,)))))..,........,||,,...|||..,}}|,|||,,,.,,..{{{{{{,|.,....),)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...))))}}))).}),)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)))).)))).))).)))))))))))))))).).)).))))))).))).}}...)))))....))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))..))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))}))).)),)))))|{...{{{{....,.,,{{,,.}}.,}}}...)},,,..(((...................))),})))))).))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))})))))))))))))
Back