Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0025100
Sequence Length
803 nt
GC Content
0.3748
GAAAAUGGUUUGAACCCAGGAGGCGAAGGUUGCAGUGAGCUGAAAUCACACCAUUUAAUUGUAGAGGUGUUUCUUCUCUGUUUUUUCUUUUAGCUUCAAGGGUGGAGCUAAGUCAAAUCAUACUCUUUAAUUCCUGACACACUAUCAUCUUUGGACUGUGCAAGGGCCCUCUCGUGUUUAUCCUCCUUUCCUCAUUCCCACCCUCAUUCCCCUAUUCUACGAAGACACUGACUCUGCUAAGUGUGAUAUAUAUCUAAAUUUACUUCUUUUUAUUGCUCUAUUUUAAAUCUGGGUUACUAUAUGUACAUCUAGUUUAUUCCUUUUCUUCUACAGGAAGUUAAUAUACCUUUCUACUUAUCCAUUAUUCUAGUGUUGGGUACUUCAGUUACUUUCAGUUCUCUGUUACUACAAACACCACGGUAGUAAUGCAGUGCACUGCAAAAUACAUGUCCCCUUUUGGACUUGUGAAGUAGUUUCUCUAAGAAAACGAUAAUCCUUGGAGUAAGAUCAUUUUCAUACAUGAUUUUAGUAAACACAAAAUAUUGCUUCCUAGACGGCUGCACUCCCACAAGUAGUACCCAAGAAUUCUCAUUUCUAUAUAGCCUUACCAGCAUUUGGUAUUAUCACUUUUUAAAUUUUGGCAUUGUUUGAAUUUCUCUUGAUACUGACAAAUUUGAGUGUCUCUUCAUUACUUGUUAUUCUAGCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGAGACAGAGUUUCACUCUUGUCGCCCAGGCUGGAGUCCAAUGGCACAAUCUUGGCCUACAACGUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((.........((((((..((.(((((.............(((((((((....)))))))))((((...................)))).(((..((.......))..)))..((((.......(((......................)))........)))).......))))).))...))))))...)))))))..........(((.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).))).............((((((.(((....))).))))))...........)))))))).)))(((((((..........)))))))(((((....)))))...((((.((((......)))).)))).........(((((((............)))))))(((((((((........)))))))))...............(((..((.....))..))).....(((((((((.....((((.......)))).........(((((.....))))).........(((((((.........)))))))........((((((.(......).)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...)))).)))).)).)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,,....,}...)(..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((...,,,...((((((,,((.(((((..,{,.......,{((((((({....}))))))))|..,.,..,.,.........,{{(,.((((,,.{{{....))),.)))),.||||.......|||......................}}}...................))))).))...)))))),},))))))}..........{({.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).}}}.,,.,....,{{,((((((.(({....))).)))))).....,.....)))))))).))){((((((..........))))))}{((((....))))}...,(((.((((......)))).)))|,,(((({..(((((((.,...,,.....}}}}}}}(((((((((........))))))))).,..........,})))|})}.,,},.)),}))},,...(((((((((.....((((.......}}}}.....{,,.(((((,...,)))))..,........,||,,...|||..,}}|,|||,,,.,,..{{{{{{,|.,....),)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...))))}}))).}),)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)
Back