Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0026900
Sequence Length
435 nt
GC Content
0.3793
AUUCUGAAAAGAAAUCAUCUCUCCUGUCAGAGGAACAACAAGAAACAAGCACUUUAGUAGAAACCAUCAGGCAGAGUAUUCAGCACAAUAAUGUUCUUAAACCCAUCAACCUACUUUCACAGCAAAUGAAGCCAGGCAUGAAAAGACAAAGGAGUUUAUACAGAGAAAUCCUCUUCUUAUCAUUAGUGUCUCUAGGAAGAGAGAAUAUUGAUAUUGAGGCAUUUGACAAUGAAUAUGGAAUUGCAUACAAUAGUCUGUCUUCAGAGAUUCUUGAAAGGUUGCAGAAAAUUGAUGCUCCACCAAGUGCCAGUGUCGAGUGGUGCAGGAAGUGUUUUGGAGCGCCUCUCAUUUAAAUAGAGAUUCACUAGAAUGUUGACACACAAGGCUUGGGGAUUAGAUUUCAUCUGGAAACAUUCAAGUUUUUUUUUCCAAAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-86.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -96.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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