Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0000100
Sequence Length
2948 nt
GC Content
0.6174
ACGAGAUGGCUGUGUGCGCAGGCGCAAGACUAGCGCUCUUGGGACCGGAAGUUAAGGCGUUCGCGGCGUGUGAAUCCAGGGCCUGAAAACCCAGAAUGAACUUGUGUCCAUCCCAGAGAUCACUGCAGAUGUCAUGAGGUACCCUUUGUGUCACCAGCUCAAGCAGGCCUCUGGCCACUUUAUCAUCUGUGGUGGUCCUGUGCCGUGACCAGGAGGAAAAAUUAGCUCUUUGAAGAGAAAGUAGUUCUCUAUUGCAGGCACUGGCCUCUUAAAUUGUUGCAGGUGGGGAAUGGAUGAGAAUAUUUGUUUUGGGUGAUCAGAACUGAGACUCCUAUUGUGGAUUAGUAACAUGCCUCCUCCUAGAACAAGGGAGGGCAGGGAUCGCCGAGACCACCACCGGGCUCCCAGCGAGGAAGAGGCCUUGGAGAAAUGGGACUGGAAUUGUCCAGAGACGCGUCGCCUCUUGGAAGAUGCCUUCUUCCGUGAAGAGGAUUACAUCCGUCAGGGUUCUGAGGAAUGUCAGAAGUUUUGGACCUUCUUUGAACGCCUGCAGAGAUUCCAGAAUCUCAAGACCUCCAGGAAGGAGGAGAAAGACCCUGGACAGCCCAAGCACAGCAUCCCAGCGCUGGCCGACCUACCUCGCACUUACGACCCACGUUACCGCAUCAACCUCUCUGUUCUUGGCCCUGCCACGCGGGGCUCUCAGGGACUGGGCAGGCACUUGCCCGCGGAGAGAGUGGCUGAGUUCCGCCGAGCCCUGUUGCACUACCUGGACUUUGGCCAGAAGCAGGCAUUUGGGCGUCUGGCCAAGCUGCAGCGUGAGCGGGCAGCCCUCCCCAUCGCCCAGUAUGGGAACCGCAUCCUGCAGACGCUGAAGGAGCACCAGGUGGUGGUAGUGGCCGGUGACACCGGCUGUGGCAAGUCCACUCAGGUGCCCCAGUACCUGCUGGCUGCUGGCUUCAGUCAUGUGGCGUGCACCCAGCCCCGGCGGAUCGCCUGCAUCUCACUGGCCAAGCGUGUGGGCUUUGAGAGCCUCAGUCAGUAUGGCUCACAGGUCGGCUACCAGAUCCGCUUUGAGAGCACACGUUCGGCGGCCACCAAGAUUGUAUUCCUGACAGUGGGGCUGCUCCUGCGACAAAUCCAGCGGGAACCCAGCCUGCCCCAGUAUGAGGUCCUGAUUGUGGAUGAAGUCCAUGAGCGGCAUCUCCACAACGAUUUCCUCCUGGGCGUCCUCCAGCGCCUGUUGCCCACGCGGCCUGACCUCAAGGUCAUCCUCAUGUCGGCCACCAUCAACAUCUCGCUCUUCUCCAGCUAUUUCAGCAAUGCCCCUGUGGUACAGGUGCCUGGGAGGCUGUUCCCCAUCACGGUUGUGUACCAGCCGCAGGAGGCGGAGCCGACCACGUCCAAGUCAGAGAAGCUGGACCCGCGGCCUUUCCUGAGGGUGCUGGAGUCCAUUGACCACAAGUACCCGCCUGAGGAGCGGGGUGACCUCCUCGUCUUCCUCAGCGGCAUGGCGGAGAUCAGCGCCGUGCUGGAGGCUGCCCAGACCUAUGCCAGCCACACCCAGCGCUGGGUGGUACUGCCACUGCACAGCGCCCUGUCUGUGGCCGACCAGGACAAGGUAUUUGAUGUGGCACCCCCUGGAGUCCGGAAAUGCAUCCUCUCCACCAACAUUGCUGAGACCUCAGUCACCAUUGACGGGAUCCGCUUCGUAGUAGAUUCCGGAAAGGUGAAGGAGAUGAGCUACGAUCCGCAGGCCAAGCUGCAACGGCUGCAGGAGUUCUGGAUUAGUCAGGCCAGCGCAGAGCAGCGGAAGGGCCGGGCGGGCCGCACGGGCCCCGGAGUCUGCUUCCGCCUCUAUGCCGAAUCGGACUAUGAUGCCUUCGCCCCCUACCCCGUCCCAGAAAUUCGGAGGGUGGCCCUGGACUCGUUGGUGCUGCAGAUGAAGAGCAUGAGUGUGGGGGACCCCCGAACCUUCCCCUUCAUCGAGCCCCCACCACCAGCCAGCCUGGAAACCGCCAUCCUCUACCUCCGGGACCAGGGGGCCCUGGACAGCUCAGAGGCCCUCACACCCAUUGGGUCCCUGCUAGCCCAGCUGCCUGUGGACGUUGUGAUUGGGAAGAUGCUGAUCCUGGGCUCCAUGUUCAGCCUGGUGGAGCCUGUGCUCACCAUCGCAGCCGCACUUAGCGUCCAGUCGCCCUUCACCCGCAGCGCCCAGAGCAGCCCAGAGUGCGCGGCAGCACGGCGGCCGCUGGAGAGCGACCAGGGUGACCCCUUCACGCUCUUCAACGUCUUCAACGCCUGGGUGCAGGUGAAAUCUGAACGGAGCAGAAACUCUCGCAAGUGGUGCCGCCGCCGGGGCAUAGAGGAGCAUCGACUGUACGAAAUGGCCAACCUUCGGCGCCAGUUCAAGGAGCUGUUGGAGGACCACGGGCUGCUGGCUGGGGCCCAGGCCGCGCAGGUAGGGGACAGCUACAGUCGGUUGCAGCAGCGCCGGGAGCGCCGGGCCCUGCACCAGCUGAAACGCCAGCACGAGGAGGGCGCGGGGCGCAGGCGCAAGGUGCUGCGGCUGCAGGAGGAGCAGGACGGCGGCUCCAGUGACGAGGACAGGGCUGGCCCAGCCCCCCCAGGGGCCAGUGAUGGCGUGGACAUCCAGGAUGUGAAGUUCAAGCUUCGGCAUGACCUGGCGCAGCUGCAGGCCGCUGCCAGCUCAGCCCAGGACCUGAGCCGCGAGCAGCUGGCUCUGCUGAAGCUGGUGCUGGGCCGGGGCCUGUACCCACAGCUGGCCGUCCCCGACGCCUUCAACAGCAGCCGAAAGGACUCAGACCAGAUUUUCCACACGCAGGCCAAGCAGGGCGCCGUGCUGCACCCCACCUGCGUCUUCGCUGGCAGCCCCGAGGUGCUGCACGCACAGGAGCUGGAGGCCAGCAACUGCGACGGAAGCCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1289.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1336.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.((.(((((..(((((.......)))))..(((((((((..(((..((((.((.((((((((...(((((...((((..((((((((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((((....((((.((.....)).))))..((((...)))))))))))))))))))))))))))(((((((((...((((((........((((....)))).......)))))).)))).)))))..(((((..........).)))).))).))))))..))...))))))))))))..))))..))).)).(((......)))......)))))))(((((((.......)))))))..).)).))))..))).....))))..)))))((((((.((.((((((((.((..((.(..(((..((((((((.(....(((.((((((((((((.....))))))...))))))...((((((.((((....)))))).))))..((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).))....(((((.....))))).....)))))))))))).)))..).))...))))))....))))...)).))))))....(((.....)))...))))))).)))))).)).((((((..((((((.(((((((.((((.((..((((((....))))))(.((((((..((((((((((((((((.((((((...((((((((((...(((((((((.((..........)).)))))))))(((.((((((..(((((..((....((((((.....).)))))....))..)))))..)))))...).))).)))))))))).))).))))))))..((((((((((((..((((...(((((((....)))))))(((.((((((((....)))).(((((.((..(((((((..(((((((((((.(.((((....(((((.((...(((((((...))))).))....)).)))))...)))))))).....))))))))....((((....)))).((((((.(((...((((.......)))))))))))))((((((..........))))))...(((((((.(((((...((((......(((((((.((.((((....).))).)))))))))......))))))))).(((((((((((((.(((((....))))).(((((....))))).......((.(((((......(((((..((((((((...(((.....))).(((((((.(((((...((((((((((((.(((((((......((((((.....))))))((((((..((.((((.....(((((.((.......)))))))...)))))))))))).((((((((..(((....)))..).)))))))..(((((((((((((......))))))..)))))))((((((((((........))))))))))..(((((..((......)).))))).((((((....))))))....((((((..((....(((.(((((.(((....)))))))).)))...))..)))))).....(((((((((((...(((((.((.(((...(((..(((.(...(((..(((((.((..(((((((.(((....))).)))))))..)))))))..))).).))).(((.(((((((((..(((((....(((((((((.((((((((.......((((..(((......)))....))))(((((((......((((...((((((((.(((.((......)).))).))))))......))...)))).....))))))).........((((((((((((.((.((.(((((((..((.(((((((.(...(.((.(((((...))))).)))...).)))))))..))......))))))).)))).)).....))))))))))...))))))))..(((((((((((.....)))).)))))))..((((...)))).))))).))))))))))))))))))))))))...))))).)))))...))).)))))))).((((((..(((((.(((....))))))))..((....)).....(((......)))..((((((....((((((((.(((........)))(((((.((...)).)))))(((((((((...((((....))))...))))))))).(((.....))).)))))))).))))))..)))))))))))))...)))))).....))))))))))).)))))))))))))))...)).)))......))))).))....)))))((((((...)))))).))))))))..)))))))..)))))))...)).))))))))).))).)))).)))))))))))).(((((((((((....((.(((.(((((.(.(..((((......))))..).).))))).))).))...)))))....))))))((((((.(((((.((.(((((((((((...(((....(((((((.((((((((((((((....))((((....)))).(((((.((((...)).)).)))))((((((((((...(((((.((((((((((....))).)))))..)))))))....(((((((.....)).))))))))))))))))).))))))))))..))))).))))))))).)))))))..).).)))))....))))))....)))))))).)))..)))))).)(((((((....((((.((...)).))))......)))))))..)).)))).)))))))..)))..)))(((.(((..(((((...)))))..))).).))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((((.((.((.(((((..(((((.......))))},,(((((((((..(((..((((.((.((((((((...((((({..((((..((((((((((((.((.,((((((((({(.((((((((((((((..(((((((....,{{(.({.....}}.}}})..((((...))))))))))})))))))))))))))}(((((,((,...((((((...,{{..((((....))))..}},..)))))).,}}),)))))..(((({..........).)))).))),,))))),.}}...))))))))))))..))))..))}.},.{{{......))),,....))))))){((((((.......))))))}..).)).))))..))).....))))..)))))((((((.((.((((..{{,(...(((({{(((..{(((((((.{,,{.((,.((((((((((((.....)))))),..})))))...,|,,,|}||(({{(((,{({|{{.||{,{{.,,{||{||,.,||||||}}}.}}}.},||||,|}}}})))}))....(((((.....))))).......,,)))))))}.}},.||.}}}..)))))...))))))...)).))))))....{{(.....}))...))))))).)))))).},}((((((,,(((({(.(((((((.{(((.((..((((({....})))))|.((((((..((((((((((((((((.((((((...((((((((((..,(((((((((.((..........)).)))))))))|((.((((((..(((((..((....((((({.....).)))))....))..)))))..)))))).,).,,,.)))))))))).))).))))))))..((((((((((((..{{{(,{.,,{|||({{{.,||||||(((((({,.((({,{{||||.({(((.{{,.{{{{{{{,.(((((((({{{.{,{{{{...{((((,.((.{{(((((((,,,|}||}.}}..,.}}.})))}},,)})),))),....))))))))....((((....)))){((((((.(({..{((((.......))))))))))))}{(((((..........)))))}...(((((((.(((((...((((...,,.(((((((.((.((((....,.))).))))))))),,,...))))))))),(((((((((((((.(((((....}}||}.{((((....))))}.......||.(((({......{({{{..((((((((...(((.....))).(((((((.(((((...(((((((({(((,(((((((......((((((.....))))))((((({,.((.((((.,...((((,,((.......)))))))..,))))))}))))).((((((((..(((....)))..)}})))))),.(((((((((((((......)))))}..)))))))|(((((((((........)))))))))|{.(({(({,{{......||{|,{({{((..({((((((((((((...})))))...)))))}..||,,|}}||}...,,,))}},.))),},,}.|}||||}.,.,.(((((((((((...(((((.((.(((...(({..(((.(...(((..(((((.((..(((((((.(((....))).)))))))..)))))))..))).).))).(((.(((((((((..(((((....(((((((((.{{{((({....,,,.|||,.,{{|,,,},.}}|,..((({|((({(((((.....)}))}{{.((((((.(((.((......)).))).)))))).}}..}))}..|||||||..,,.(((((.((.....((((((((((((.((.((.(((((((.,((.(((((((.(...(,((.(((((...))))}.))).,.,.)))))))..))....,.))))))).)))).)).....))))))))))...)).)))))..||||||{((({.....)))).)))))))..((((...)))).))))).))))))))))))))))))))))))...))))).)))))...))).)))))))).{{{{{(,.(((({{(((....))))))))..||.}}}}).....|||....,.)))..((((((....((((((((.((.,,,....{|||(((((.{{...)).)))))(((((((((...((((....))))...))))))))).|{{.....,,)})))))))).))))))..})))}})))))))...}))))},,...))))))))))).)))))))))))))))...}}.))}..,,..))))).}}....)))))((((((...)))))).))))))))..})))))),})))))))}}},,}))))})))))))))))}}.)))))))))))).(((((((((((....((.(((.(((((.(.{..((((......))))..,.).))))).))).)).}.)))))....))))))((((((.(((((.(,.(((((((((({..,(({....(((((((.((((((((((((((....))((((....)))).{((((.(({,...}}.)}.))))}((((((((((...(((((.((((((((((....)))}}))))..)))))))....(((((((.....)).))))))))))))))))).))))))))))}.))))).)))}}})))}))))))),...}.)))))....))))))....)))))))).)))..)))))).,(((((((....((((.((...)).))))......)))))))..)).)))).)))))))..)))..)},(((.(((..(((((...)))))..))).).)),..))))))
Back