Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0000200
Sequence Length
982 nt
GC Content
0.5682
AAUCCAGGGCCUGAAAACCCAGAAUGAACUUGUGUCCAUCCCAGAGAUCACUGCAGAUGUCAUGAGGUACCCUUUGUGUCACCAGCUCAAGCAGGCCUCUGGCCACUUUAUCAUCUGUGGUGGUCCUGUGCCGUGACCAGGAGGAAAAAUUAGCUCUUUGAAGAGAAAGUAGUUCUCUAUUGCAGGCACUGGCCUCUUAAAUUGUUGCAGGUGGGGAAUGGAUGAGAAUAUUUGUUUUGGGUGAUCAGAACUGAGACUCCUAUUGUGGAUUAGUAACAUGCCUCCUCCUAGAACAAGGGAGGGCAGGGAUCGCCGAGACCACCACCGGGCUCCCAGCGAGGAAGAGGCCUUGGAGAAAUGGGACUGGAAUUGUCCAGAGACGCGUCGCCUCUUGGAAGAUGCCUUCUUCCGUGAAGAGGAUUACAUCCGUCAGGGUUCUGAGGAAUGUCAGAAGUUUUGGACCUUCUUUGAACGCCUGCAGAGAUUCCAGAAUCUCAAGACCUCCAGGAAGGAGGAGAAAGACCCUGGACAGCCCAAGCACAGCAUCCCAGCGCUGGCCGACCUACCUCGCACUUACGACCCACGUUACCGCAUCAACCUCUCUGUUCUUGGCCCUGCCACGCGGGGCUCUCAGGGACUGGGCAGGCACUUGCCCGCGGAGAGAGUGGCUGAGUUCCGCCGAGCCCUGUUGCACUACCUGGACUUUGGCCAGAAGCAGGCAUUUGGGCGUCUGGCCAAGCUGCAGCGUGAGCGGGCAGCCCUCCCCAUCGCCCAGUAUGGGAACCGCAUCCUGCAGACGCUGAAGGAGCACCAGGUGGUGGUAGUGGCCGGUGACACCGGCUGUGGCAAGUCCACUCAGGUGCCCCAGUACCUGCUGGCUGCUGGCUUCAGUCAUGUGGCGUGCACCCAGCCCCGGCGGAUCGCCUGCAUCUCACUGGCCAAGCGUGUGGGCUUUGAGAGCCUCAGUCAGUAUGGCUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-384.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -402.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....((((((((..((((((((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((((....((((.((.....)).))))..((((...)))))))))))))))))))))))))))(((((((((...((((((........((((....)))).......)))))).)))).)))))..(((((..........).)))).))).))))))..))...))))))))))))..)))).(((((...(((......)))))))).....))))((((((.......))))))(((((((((((((..((((((((((((((((..((((((.((.((((((((.((..((.(..(((..((((((((.(....(((.((((((((((((.....))))))...))))))...((((((.((((....)))))).))))..((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).))....(((((.....))))).....)))))))))))).)))..).))...))))))....))))...)).)))))).........((((.((.((((.......((((((.....((((((((...))))))))..))))))..((((((....))))))))))..)).))))...((((..(((((((((...(((.((..((((.(....)))))....)))))...)))).)).)))..)))).((((((..(((((..((....((((((.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..)))).)))).)))))..(((((..((...))..))))).)(((.(((((...........))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,{,,(({(((((..((((((((((((.((.,((((((((({(.((((((((((((((..(((((((....,{{(.({.....}}.}}})..((((...))))))))))})))))))))))))))}(((((,((,...((((((...,{{..((((....))))..}},..)))))).,}}),)))))..(((({..........).)))).))),,))))),.}}...))))))))))))..)))).{((((...(((......)))}}})}.....}}},((((((.......))))))(((((((((((((.{((((((((((((((((..((((((.((.((((..,,,(...((((({(((..{(((((((.{,,{.((,.((((((((((((.....)))))),..})))))...,|,,,|}||(({{{((,{({|{{.||{,{{.,,{||{||,.,||||||}}}.}}}.},||||,|,,,,)))}))....(((((.....))))).......,,)))))))}.}},.}}.}}}..)))))...)}))))...)).)))))).........((({{(,.,,((,.....,(((((({{{{{((((((((...)))))))}..))))))}.((((((....}))))))})),,)).))}},|,|({,..||{{|||||,}.|||.,,,}{|||.,.,,{|||||,.{,,,}},...}})).))}))),,)),}.((((((..(((((..((....((((({.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..))))}}))).)))))..{{{,,.{{(,,.||..,||||{|({{.|||||.,,....,,.,))))).}))
Back