Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0000400
Sequence Length
1652 nt
GC Content
0.5835
AAUCCAGGGCCUGAAAACCCAGAAUGAACUUGUGUCCAUCCCAGAGAUCACUGCAGAUGUCAUGAGGUACCCUUUGUGUCACCAGCUCAAGCAGGCCUCUGGCCACUUUAUCAUCUGUGGUGGUCCUGUGCCGUGACCAGGAGGAAAAAUUAGCUCUUUGAAGAGAAAGUAGUUCUCUAUUGCAGGCACUGGCCUCUUAAAUUGUUGCAGGUGGGGAAUGGAUGAGAAUAUUUGUUUUGGGUGAUCAGAACUGAGACUCCUAUUGUGGAUUAGUAACAUGCCUCCUCCUAGAACAAGGGAGGGCAGGGAUCGCCGAGACCACCACCGGGCUCCCAGCGAGGAAGAGGCCUUGGAGAAAUGGGACUGGAAUUGUCCAGAGACGCGUCGCCUCUUGGAAGAUGCCUUCUUCCGUGAAGAGGAUUACAUCCGUCAGGGUUCUGAGGAAUGUCAGAAGUUUUGGACCUUCUUUGAACGCCUGCAGAGAUUCCAGAAUCUCAAGACCUCCAGGAAGGAGGAGAAAGACCCUGGACAGCCCAAGCACAGCAUCCCAGCGCUGGCCGACCUACCUCGCACUUACGACCCACGUUACCGCAUCAACCUCUCUGUUCUUGGCCCUGCCACGCGGGGCUCUCAGGGACUGGGCAGGCACUUGCCCGCGGAGAGAGUGGCUGAGUUCCGCCGAGCCCUGUUGCACUACCUGGACUUUGGCCAGAAGCAGGCAUUUGGGCGUCUGGCCAAGCUGCAGCGUGAGCGGGCAGCCCUCCCCAUCGCCCAGUAUGGGAACCGCAUCCUGCAGACGCUGAAGGAGCACCAGGUGGUGGUAGUGGCCGGUGACACCGGCUGUGGCAAGUCCACUCAGGUGCCCCAGUACCUGCUGGCUGCUGGCUUCAGUCAUGUGGCGUGCACCCAGCCCCGGCGGAUCGCCUGCAUCUCACUGGCCAAGCGUGUGGGCUUUGAGAGCCUCAGUCAGUAUGGCUCACAGGUCGGCUACCAGAUCCGCUUUGAGAGCACACGUUCGGCGGCCACCAAGAUUGUAUUCCUGACAGUGGGGCUGCUCCUGCGACAAAUCCAGCGGGAACCCAGCCUGCCCCAGUAUGAGGUCCUGAUUGUGGAUGAAGUCCAUGAGCGGCAUCUCCACAACGAUUUCCUCCUGGGCGUCCUCCAGCGCCUGUUGCCCACGCGGCCUGACCUCAAGGUCAUCCUCAUGUCGGCCACCAUCAACAUCUCGCUCUUCUCCAGCUAUUUCAGCAAUGCCCCUGUGGUACAGGUGCCUGGGAGGCUGUUCCCCAUCACGGUUGUGUACCAGCCGCAGGAGGCGGAGCCGACCACGUCCAAGUCAGAGAAGCUGGACCCGCGGCCUUUCCUGAGGGUGCUGGAGUCCAUUGACCACAAGUACCCGCCUGAGGAGCGGGGUGACCUCCUCGUCUUCCUCAGCGGCAUGGCGGAGAUCAGCGCCGUGCUGGAGGCUGCCCAGACCUAUGCCAGCCACACCCAGCGCUGGGUGGUACUGCCACUGCACAGCGCCCUGUCUGUGGCCGACCAGGACAAGGUAUUUGAUGUGGCACCCCCUGGAGUCCGGAAAUGCAUCCUCUCCACCAACAUUGCUGAGACCUCAGUCACCAUUGACGGGAUCCGCUUCGUAGUAGAUUCCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-660.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -691.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 495.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.((((..((((((((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((((....((((.((.....)).))))..((((...)))))))))))))))))))))))))))(((((((((...((((((........((((....)))).......)))))).)))).)))))..(((((..........).)))).))).))))))..))...))))))))))))..)))).(((((...(((......)))))))).........((((((.......))))))(((((((((((((..((((((((((((((((..((((((.((.((((((((.((..((.(..(((..((((((((.(....(((.((((((((((((.....))))))...))))))...((((((.((((....)))))).))))..((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).))....(((((.....))))).....)))))))))))).)))..).))...))))))....))))...)).)))))).........((((.((.((((.......((((((.....((((((((...))))))))..))))))..((((((....))))))))))..)).))))...((((..(((((((((...(((.((..((((.(....)))))....)))))...)))).)).)))..)))).((((((..(((((..((....((((((.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..)))).)))).)))))((((...(((((..((.(((((((((((((...))))).......)))))))).)).)))))..)))).((((....((((....))))))))((((((((((((....(((((..(.((((((.((((((((..........)))))).....))..)))))).)..((((......(((((((.((.((((....).))).)))))))))......))))(((((((.((((((((((.(((((.....(.((((.(((....(((....)))...))))))).)...)))))...((((..(((((.(((((.........(((((((((((...(((((..(((((....)))))............))))).)))))))).)))(((((((.....(((((.((.......)))))))...))))...)))...((((((((..(((....)))..).)))))))(((((((((((((((......))))))..))))))..)))))))))))))..))))..)))))))))).)))))))..........((((((..((((((((((((((...))))))...))))))..))..))))))....)))))...))).))))..)))))...)))))))((((((.((((...............)))).))).))).(((((....)))))(((((((.(((....))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.((((..((((((((((((.((.,((((((((({(.((((((((((((((..(((((((....,{{(.({.....}}.}}})..((((...))))))))))}))))))))))))))))((((({((,...((((((...,{{..((((....))))..}},..)))))).,}}),)))))..(((({..........).)))).))),,))))),.}}...))))))))))))..)))).(((((...(((......))))))))....,{{{.((((((.......))))))|||(((({{((((.{,{{,,,,{||||||||,.((((((.((.((((..,,,(...((((({(((..{(((((((.(,,{.((,.((((((((((((.....)))))),..})))))...,|,,,||||(({{{((,{({|{{.||{,{{.,,{||{||,.,||||||}}}.}}}.},||||,|,,,,)))}))....(((((.....))))).......,,)))))))}.}},.|}.}}}..)))))...)}))))...)).))))))....,,{..,,,|}|..((((({({{,,{{{,(({{({{(({{{{((,,,|||||||...|||||,{(,(((,({.{{{||}|||{,,..,,.)))),|}}||.}}}}|.}))}}}}.{{({(({{((((..,{((((((((.((........,.)).)))))))))}{{.((((((..(((((..((....((((({.....).)))))....))..)))))..))))))..)}))}.))})))))))}}...(((((((...)))))))((((,..,,||||,{((((((....)))))}(((((.(((,,(({.{{,,,.||.|||,.||}.|||||..|||||||||,||}||.,,,,,.,{(({.,({{{{({{(({{{,,{{((|,|,,,,,,..,)))),.,,{{{{{{||....,,|{{||||,..{{||....))))|||((((.(({..{(({{.....,,}}}}||||||}|||(((((,.........}}||||,...{||{{||||||{...((((...,,.(((((((.((.((((....,.))).))))))))),,,...))))|||||||.,{(((((((({((({(,{,{,(.((((.(((....(((....)))...))))))).,...,,,,,...,(({..,,,,,.(((,,...,||...||{{{||||||}}}|||||,}|||||}}}}))))),.....{{{{|.,,}}),)))))))),))))}}))||}}}..{{{,..{({{{.{{.||||}}}...)))),}}),)})}((((((((..(((....)))..),,))))))({(((((((((((((......)))))}..)))))))}})|||})))},))..,,))}})))))))}})})))))))}}....))}}||{{{{.}||||{{|||||||,,,}))))),...,))}))}}))|.}))))).}.)))))))},)),..}))}})))),...))))))),|{,(({......}}},,{,...,,....}|||||}}..||||{{,...,))}|((((((.(((....))).)))))))
Back