Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0001200
Sequence Length
975 nt
GC Content
0.5692
GGCCUGAAAACCCAGAAUGAACUUGUGUCCAUCCCAGAGAUCACUGCAGAUGUCAUGAGGUACCCUUUGUGUCACCAGCUCAAGCAGGCCUCUGGCCACUUUAUCAUCUGUGGUGGUCCUGUGCCGUGACCAGGAGGAAAAAUUAGCUCUUUGAAGAGAAAGUAGUUCUCUAUUGCAGGCACUGGCCUCUUAAAUUGUUGCAGGUGGGGAAUGGAUGAGAAUAUUUGUUUUGGGUGAUCAGAACUGAGACUCCUAUUGUGGAUUAGUAACAUGCCUCCUCCUAGAACAAGGGAGGGCAGGGAUCGCCGAGACCACCACCGGGCUCCCAGCGAGGAAGAGGCCUUGGAGAAAUGGGACUGGAAUUGUCCAGAGACGCGUCGCCUCUUGGAAGAUGCCUUCUUCCGUGAAGAGGAUUACAUCCGUCAGGGUUCUGAGGAAUGUCAGAAGUUUUGGACCUUCUUUGAACGCCUGCAGAGAUUCCAGAAUCUCAAGACCUCCAGGAAGGAGGAGAAAGACCCUGGACAGCCCAAGCACAGCAUCCCAGCGCUGGCCGACCUACCUCGCACUUACGACCCACGUUACCGCAUCAACCUCUCUGUUCUUGGCCCUGCCACGCGGGGCUCUCAGGGACUGGGCAGGCACUUGCCCGCGGAGAGAGUGGCUGAGUUCCGCCGAGCCCUGUUGCACUACCUGGACUUUGGCCAGAAGCAGGCAUUUGGGCGUCUGGCCAAGCUGCAGCGUGAGCGGGCAGCCCUCCCCAUCGCCCAGUAUGGGAACCGCAUCCUGCAGACGCUGAAGGAGCACCAGGUGGUGGUAGUGGCCGGUGACACCGGCUGUGGCAAGUCCACUCAGGUGCCCCAGUACCUGCUGGCUGCUGGCUUCAGUCAUGUGGCGUGCACCCAGCCCCGGCGGAUCGCCUGCAUCUCACUGGCCAAGCGUGUGGGCUUUGAGAGCCUCAGUCAGUAUGGCUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-385.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -402.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..((((((((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((((....((((.((.....)).))))..((((...)))))))))))))))))))))))))))(((((((((...((((((........((((....)))).......)))))).)))).)))))..(((((..........).)))).))).))))))..))...))))))))))))..))...(((((...(((......)))))))).((((((..((((((.......))))))(((((((((((((..((((((((((((((((..((((((.((.((((((((.((..((.(..(((..((((((((.(....(((.((((((((((((.....))))))...))))))...((((((.((((....)))))).))))..((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).))....(((((.....))))).....)))))))))))).)))..).))...))))))....))))...)).)))))).........((((.((.((((.......((((((.....((((((((...))))))))..))))))..((((((....))))))))))..)).))))...((((..(((((((((...(((.((..((((.(....)))))....)))))...)))).)).)))..)))).((((((..(((((..((....((((((.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..)))).)))).)))))..............)))))))))))(((.(((((...........))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((..((((((((((((.((.,((((((((({(.((((((((((((((..(((((((....,{{(.({.....}}.}}})..((((...))))))))))})))))))))))))))}(((((,((,...((((((...,{{..((((....))))..}},..)))))).,}}),)))))..(((({..........).)))).))),,))))),.}}...))))))))))))..))),.(((((...(((......)))))))).,,,,{{..((((((.......))))))(((((((((((((.{((((((((((((((((..((((((.((.((((..,,,(...((((({(((..{(((((((.{,,{.((,.((((((((((((.....)))))),..})))))...,|,,,|}||(({{{((,{({|{{.||{,{{.,,{||{||,.,||||||}}}.}}}.},||||,|,,,,)))}))....(((((.....))))).......,,)))))))}.}},.}}.}}}..)))))...)}))))...)).)))))).........((({{(,.,,((,.....,(((((({{{{{((((((((...)))))))}..))))))}.((((((....}))))))})),,)).))}},|,|({,..||{{|||||,}.|||.,,,}{|||.,.,,{|||||,.{,,,}},...}})).))}))),,)),}.((((((..(((((..((....((((({.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..))))}}))).)))))....{,,..{,...))},)))))))(((.(((((...........))))).)))
Back