Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0001800
Sequence Length
2454 nt
GC Content
0.6377
GUCGGCUACCAGAUCCGCUUUGAGAGCACACGUUCGGCGGCCACCAAGAUUGUAUUCCUGACAGUGGGGCUGCUCCUGCGACAAAUCCAGCGGGAACCCAGCCUGCCCCAGUAUGAGGUCCUGAUUGUGGAUGAAGUCCAUGAGCGGCAUCUCCACAACGAUUUCCUCCUGGGCGUCCUCCAGCGCCUGUUGCCCACGCGGCCUGACCUCAAGGUCAUCCUCAUGUCGGCCACCAUCAACAUCUCGCUCUUCUCCAGCUAUUUCAGCAAUGCCCCUGUGGUACAGGUGCCUGGGAGGCUGUUCCCCAUCACGGUUGUGUACCAGCCGCAGGAGGCGGAGCCGACCACGUCCAAGUCAGAGAAGCUGGACCCGCGGCCUUUCCUGAGGGUGCUGGAGUCCAUUGACCACAAGUACCCGCCUGAGGAGCGGGGUGACCUCCUCGUCUUCCUCAGCGGCAUGGCGGAGAUCAGCGCCGUGCUGGAGGCUGCCCAGACCUAUGCCAGCCACACCCAGCGCUGGGUGGUACUGCCACUGCACAGCGCCCUGUCUGUGGCCGACCAGGACAAGGUAUUUGAUGUGGCACCCCCUGGAGUCCGGAAAUGCAUCCUCUCCACCAACAUUGCUGAGACCUCAGUCACCAUUGACGGGAUCCGCUUCGUAGUAGAUUCCGGAAAGGUGAAGGAGAUGAGCUACGAUCCGCAGGCCAAGCUGCAACGGCUGCAGGAGUUCUGGAUUAGUCAGGCCAGCGCAGAGCAGCGGAAGGGCCGGGCGGGCCGCACGGGCCCCGGAGUCUGCUUCCGCCUCUAUGCCGAAUCGGACUAUGAUGCCUUCGCCCCCUACCCCGUCCCAGAAAUUCGGAGGGUGGCCCUGGACUCGUUGGUGCUGCAGAUGAAGAGCAUGAGUGUGGGGGACCCCCGAACCUUCCCCUUCAUCGAGCCCCCACCACCAGCCAGCCUGGAAACCGCCAUCCUCUACCUCCGGGACCAGGGGGCCCUGGACAGCUCAGAGGCCCUCACACCCAUUGGGUCCCUGCUAGCCCAGCUGCCUGUGGACGUUGUGAUUGGGAAGAUGCUGAUCCUGGGCUCCAUGUUCAGCCUGGUGGAGCCUGUGCUCACCAUCGCAGCCGCACUUAGCGUCCAGUCGCCCUUCACCCGCAGCGCCCAGAGCAGCCCAGAGUGCGCGGCAGCACGGCGGCCGCUGGAGAGCGACCAGGGUGACCCCUUCACGCUCUUCAACGUCUUCAACGCCUGGGUGCAGGUGAAAUCUGAACGGAGCAGAAACUCUCGCAAGUGGUGCCGCCGCCGGGGCAUAGAGGAGCAUCGACUGUACGAAAUGGCCAACCUUCGGCGCCAGUUCAAGGAGCUGUUGGAGGACCACGGGCUGCUGGCUGGGGCCCAGGCCGCGCAGGUAGGGGACAGCUACAGUCGGUUGCAGCAGCGCCGGGAGCGCCGGGCCCUGCACCAGCUGAAACGCCAGCACGAGGAGGGCGCGGGGCGCAGGCGCAAGGUGCUGCGGCUGCAGGAGGAGCAGGACGGCGGCUCCAGUGACGAGGACAGGGCUGGCCCAGCCCCCCCAGGGGCCAGUGAUGGCGUGGACAUCCAGGAUGUGAAGUUCAAGCUUCGGCAUGACCUGGCGCAGCUGCAGGCCGCUGCCAGCUCAGCCCAGGACCUGAGCCGCGAGCAGCUGGCUCUGCUGAAGCUGGUGCUGGGCCGGGGCCUGUACCCACAGCUGGCCGUCCCCGACGCCUUCAACAGCAGCCGAAAGGACUCAGACCAGAUUUUCCACACGCAGGCCAAGCAGGGCGCCGUGCUGCACCCCACCUGCGUCUUCGCUGGCAGCCCCGAGGUGCUGCACGCACAGGAGCUGGAGGCCAGCAACUGCGACGGAAGCCGAGACGACAAGGACAAGAUGAGCAGCAAACACCAGCUCCUCAGCUUCGUGUCCCUGCUGGAGACCAACAAGCCGUACCUGGUGAACUGCGUCCGCAUCCCUGCCCUCCAGUCCCUCCUGCUUUUUAGCCGGUCUUUGGACACCAAUGGUGACUGCUCCCGCCUGGUGGCCGAUGGCUGGCUGGAGCUGCAGCUAGCAGACAGUGAAAGUGCCAUCCGACUCCUGGCGGCUUCCCUGCGGCUCCGUGCCCGCUGGGAAAGUGCCCUGGACCGGCAGCUGGCGCACCAGGCCCAGCAGCAGCUGGAGGAGGAGGAGGAGGAUACGCCAGUCAGCCCCAAGGAGGUGGCCACCCUGAGCAAGGAACUCCUGCAAUUCACGGCAUCCAAGAUUCCUUACAGCCUCCGGCGGCUCACAGGGCUAGAAGUCCAGAACAUGUAUGUGGGACCCCAGACCAUCCCAGCCACCCCCCAUCUUCCUGGCCUCUUUGGCAGCUCCACCCUGUCCCCCCACCCCACAAAGGGGGGCUACGCAGUCACUGACUUCCUCACCUACAACUGCCUCACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1076.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1116.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 431.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((........((((((((((((.....((((((..((((((((((((....(((((..(.((((((.((((((((..........)))))).....))..)))))).)..((((......(((((((.((.((((....).))).)))))))))......))))(((((((.((((((((((.(((((.....(.((((.(((....(((....)))...))))))).)...)))))...((((..(((((.(((((.........(((((((((((...(((((..(((((....)))))............))))).)))))))).)))(((((((.....(((((.((.......)))))))...))))...)))...((((((((..(((....)))..).)))))))(((((((((((((((......))))))..))))))..)))))))))))))..))))..)))))))))).)))))))..........((((((..((((((((((((((...))))))...))))))..))..))))))....)))))...))).))))..)))))..))..(((((((((((...(((((.((.(((...(((..(((.(...(((..(((((.((..(((((((.(((....))).)))))))..)))))))..))).).))).(((.(((((((((..(((((....(((((((((.((((((((.......((((..(((......)))....))))(((((((......((((...((((((((.(((.((......)).))).))))))......))...)))).....))))))).........((((((((((((.((.((.(((((((..((.(((((((.(...(.((.(((((...))))).)))...).)))))))..))......))))))).)))).)).....))))))))))...))))))))..(((((((((((.....)))).)))))))..((((...)))).))))).))))))))))))))))))))))))...))))).)))))...))).)))))))).((((((..(((((.(((....))))))))..((....)).....(((......)))..((((((....((((((((.(((........)))(((((.((...)).)))))(((((((((...((((....))))...))))))))).(((.....))).)))))))).))))))..)))))).)))).....)))))).)))))).)))))((..((((((..((((((((..((((((..(((.((((...((...)).)))).)))..((((((((((((((.(((..(((((.(((((((((((((((((((.((((.((.(((..(((((.((((((((((((.(((((....((.(((.(((((.(.(..((((......))))..).).))))).))).))...)))))..(((.((.(((((((.(((((.((.(((((((((((...(((....(((((((.((((((((((((((....))((((....)))).(((((.((((...)).)).)))))((((((((((...(((((.((((((((((....))).)))))..)))))))....(((((((.....)).))))))))))))))))).))))))))))..))))).))))))))).)))))))..).).)))))....)))))))..)).))).................(((((((....((((.((...)).))))......)))))))....((..(((((((...)).)))))..)).(((((((((((((.(((....(((((((...((((.((((....(((((.((((((.(((........))).))))...)).)))))..((((........).)))))).).))))......))).))))...))).)))))))...))))))...(((((((((((.((((.(((((..((((........))))))))).)))).))))))))))))))))))))....))).))).....))..)))..))))))))))))((((.(((((.....).)))).))))..(((..((((((..((.(((((.((.....))))))).)).((((((((..((((((..((((..(((.....(((((.....)).)))........(((.((....))))).......)))))))....))))))....))))))))(((((...)))))....))))))..))).....)))).)))))).)))...)))))..............))))))))..))))))))).....(((((((...........)))))))...))))))..)).).))))).........)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((.,,,....{{((((((((((.....((((((..((((({{(((({....(((((..{.((((((.((((((((..........)))))}....,))..)))))).}..((((...{,.(((((((.((.((((....,.))).)))))))))......))))(((((((.((((((((((.(((((.....(.((((.(((....(((....)))...))))))).)...)))))...((((..(((((.(((((.,,.{,..,(((((((((((...(((((,,((({(....})))),....,||,.,.))))).)))))))).)))|{{||{(.,...{{{{,.{(,,,.,,.||||}}}...)))).,,)}),},((((((((..(((....)))..),}))))))(((((((((((((((......)))))}..))))))},))}))))))))))..))))..)))))))))).)))))))........{.((((((..((((((((((((((...))))))...))))))..))..)))))).}..)))))...,},,)))}..)))))..))..(((((((((((...(((((.((.(((...(({..(((.(...(((..(((((.((..(((((((.(((....))).)))))))..)))))))..))).).))).(((.(((((((((..(((((....(((((((((.{{{((({....,,,.|||,.,{{|,,,},.}}|,..((({|((({(((((.....)}))}{{.((((((.(((.((......)).))).)))))).}}..}))}..|||||||..,,.(((((.((.....((((((((((((.((.((.(((((((.,((.(((((((.(...(,((.(((((...))))}.))).,.,.)))))))..))....,.))))))).)))).)).....))))))))))...)).)))))..||||||{((({.....)))).)))))))..((((...)))).))))).))))))))))))))))))))))))...))))).)))))...))).)))))))),((((((..(((({{(((....))))))))..((....}}.....(((......)))..((((((....((((((((.((.,,,....{|||{{{{{.{{...)).)))))(((((((((...((((....))))...))))))))).|{{.....,,)})))))))).))))))..))))))})))).....)))))).))))))})))))((..((((((,.((((((((..((((((..(({.((((,..{,...}).)))).}))..((((((((((((((.(((.{(((((.(((((((((((({((((((((((((.((({.((((.,,.,{(((({(((((((((((....((.(((.(((((.(.{..((((......))))..,.).))))).))).)).}.)))))..,,))))))((((((.(((((.(,.(((((((((({..,(({....(((((((.((((((((((((((....))((((....)))).(((((.(({,...}}.)}.))))}((((((((((...(((((.((((((((((....)))}}))))..)))))))....(((((((.....)).))))))))))))))))).))))))))))}.))))).)))}}})))}))))))),...).)))))....))))))}...(({.{{......))...))}..,{{,.,{((.....,)}),,}))))))..))),)))))))).((((((((((((((...)).)))))..{{,{((({((((((((.(((....(((((((...((((.{(((.,..(((((,(,((((.(((........))).)))).,,},.))))).}|,(({...}},.},.}}))).}.))))....,.)))}})))...))).)))))))}.,))}}))}.{(((((((((((.((((.(((((..((((........))))))))).)))).)))))))))))}((((.....)))).))))))}.{{{{{{,(((..(((.((({,|(((((.(((((.....)})))).))))).,))))..))).)))..,,|||}||....})))},|,{((.((((((((..((((((..((((..(((.{{,,(((({...,.)).))).....,|,((,{((....))))).....,.)))))))....))))))....)))))))).))),...{((({...}))))....,.......)))).)))))).)))...)))))..............))))))))..))))))))).....({((((({..........))))))}...))))))..)).)}})))).........)))))).))
Back