Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DHX34_0003100
Sequence Length
1214 nt
GC Content
0.6582
GGAAGAUGCUGAUCCUGGGCUCCAUGUUCAGCCUGGUGGAGCCUGUGCUCACCAUCGCAGCCGCACUUAGCGUCCAGUCGCCCUUCACCCGCAGCGCCCAGAGCAGCCCAGAGUGCGCGGCAGCACGGCGGCCGCUGGAGAGCGACCAGGGUGACCCCUUCACGCUCUUCAACGUCUUCAACGCCUGGGUGCAGGUGAAAUCUGAACGGAGCAGAAACUCUCGCAAGUGGUGCCGCCGCCGGGGCAUAGAGGAGCAUCGACUGUACGAAAUGGCCAACCUUCGGCGCCAGUUCAAGGAGCUGUUGGAGGACCACGGGCUGCUGGCUGGGGCCCAGGCCGCGCAGGUAGGGGACAGCUACAGUCGGUUGCAGCAGCGCCGGGAGCGCCGGGCCCUGCACCAGCUGAAACGCCAGCACGAGGAGGGCGCGGGGCGCAGGCGCAAGGUGCUGCGGCUGCAGGAGGAGCAGGACGGCGGCUCCAGUGACGAGGACAGGGCUGGCCCAGCCCCCCCAGGGGCCAGUGAUGGCGUGGACAUCCAGGAUGUGAAGUUCAAGCUUCGGCAUGACCUGGCGCAGCUGCAGGCCGCUGCCAGCUCAGCCCAGGACCUGAGCCGCGAGCAGCUGGCUCUGCUGAAGCUGGUGCUGGGCCGGGGCCUGUACCCACAGCUGGCCGUCCCCGACGCCUUCAACAGCAGCCGAAAGGACUCAGACCAGAUUUUCCACACGCAGGCCAAGCAGGGCGCCGUGCUGCACCCCACCUGCGUCUUCGCUGGCAGCCCCGAGGUGCUGCACGCACAGGAGCUGGAGGCCAGCAACUGCGACGGAAGCCGAGACGACAAGGACAAGAUGAGCAGCAAACACCAGCUCCUCAGCUUCGUGUCCCUGCUGGAGACCAACAAGCCGUACCUGGUGAACUGCGUCCGCAUCCCUGCCCUCCAGUCCCUCCUGCUUUUUAGCCGGUCUUUGGACACCAAUGGUGACUGCUCCCGCCUGGUGGCCGAUGGCUGGCUGGAGCUGCAGCUAGCAGACAGUGAAAGUGCCAUCCGACUCCUGGCGGCUUCCCUGCGGCUCCGUGCCCGCUGGGAAAGUGCCCUGGACCGGCAGCUGGCGCACCAGGCCCAGCAGCAGCUGGAGGAGGAGGAGGAGGAUACGCCAGUCAGCCCCAAGGAGGUGGCCACCCUGAGCAAGGAACUCCUGCAAUUCACGGCAUCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-548.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -568.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 423.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((.....(((((((((..........)))))))))((.(((..(((.(.((((((......(((((.((..((((.((.((((((((((.......((((.(.(((.((((((.(((.((((.((.(((((((((...((((....))))...))))))))).)).......((((((....))))))...((((.......)))).....))))..))).)))))))))).)))).....(..(((((((((((..(((.((((...((...)).)))).))).((.((((..(((....)))..)))).))(((((...(((..(((.....))).)))..))))))))))))).)))..).(((((....((.(((.(((((.(.(..((((......))))..).).))))).))).))...)))))..)))))))))).)).))).)..)).))))))))))).).)))..))).))((((.(((((..(((.((...(((((...(((((((((((....))((((((((((((....))))).))))..)))(((.((((((((((((.(.(((((((((((.(((.(...(((((((.....)).)))))).)))..))))).))).))).).))))))......)))))))))((((((..(.(((((..(((((((((..((((.((.((....((((((.(((((((((....((((.((...)).))))......)))))))....((..(((((((...)).)))))..)).(((((((((((((.(((....(((((((...((((.((((....(((((.((((((.(((........))).))))...)).)))))..((((........).)))))).).))))......))).))))...))).)))))))...))))))..((((((((((((.((((.(((((..((((........))))))))).)))).))))))))))))((((.....))))...))))))))....)).)).))))..)))))((((.(((((.....).)))).))))...((((.......))))(((((.((.....)))))))....))))..))))).)..)).)))))))))).))))))))..)).))))))))))))..(((.((....)))))......)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((,,,,{{{{((((,(.{{{{{,,,{|||||||||(({({{.,(({.({{(((((......(((((,({{,{(((,((,({((((((((,.,.{{.((({.(.(((.((((((,(((.(((,,((,(((((((((...((((....))))...))))))))).}}.......{(((((.,,,)})))),,.{{{{...{{((,,,...}}}}})}..}}},|||||}}}}}.}})).....{..((((({((((({.,...{{{({..{{,.,||{,|||{{||.,{.{(((,.(((....)))..||||,}||||||},|||,..|||,,,,,}}}.}}|..|||})))))))}}||||.{|,(((((....((.(((.(((((.(.{..((((......))))..,.).))))).))).)).}.)))))..}}))))))}|{||,,||,||.|}.|||||||||||.,.|||..},|{||(((,{(((((((((((((...,}}((({....}))).(((((.{(|{.,,|},||.|}}},{(((((((({...(((((,{(((((((((....)))||)))}..)))))))....(((((((.....)).))))))))))))))))).))))))))}}},))))}.}}},}})))}}))||||{{..|.|||||..|{||||||{..,{{{.|{.,,.,,}|||||}}.|||{|||{|...||,|}{|,,,))}))))..,...))))))).,,,{{,|||{||{|...)),)))))..||.{((({((((((((.(((....(((((((...((({.{(((.,..(((((,(,((((.(((........))).)))).,,},.))))).||{(({...}},.},.}}))).}.))))....,.)))}})))...))).))))))),..)))))),.,(((((((((((.((((.(((((..((((........))))))))).)))).)))))))))))|((((.....)))).},)))}},}},,..}}.}}.}}}}|{||}}|((((.(((((.....)})})).))))}..||||,,}},,,))),|||||.||...,,)))))}),,..))))},})})),)..}},)))),,}}|||},,|||||..,}.)),)))}}}}))),|||,((....))))}......)))))))....
Back