Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DLGAP4_0001400
Sequence Length
2307 nt
GC Content
0.5167
GUGUGAGCCACCGUGCCUGGCCCAUUUGGGGUUUUUGAAGGACAACCUUGGUUCCAUCUCUGUAGUCCCUUUGUUCUGAGAGUCUAGAAGACUUCAGUUCUUAGGUCUGUGUUUUCUUAUCUUUUCAGUGUCUACCACACAAAGAUGAGUGCUGCGUAUGGAGCCCCUGUGACCCACAGAGUCUCUGCUGAAGCCAGGCAGGUUUCAAUGGGGGUGGGGUCACAGAGAGGCCAAGUAAGCAGCCCUGUCCCUACCGAGCCCCCACCCCCUGAGGAGCUGUGACAUCCACAUCCUGGGCCCUGUGUUCAGAGUUCACUGUCAGGAUGGGCCUGGGAAUUCACUUCUCAUGGUUGUCUUCAAGUGGAGGAGGGACCCGAGGUGGGAGCAGUGUCAGUCACACGUCCCCAGCAGCCAUGGCCUGCUAUCUUGUUGACCAAACAACUAGUUGAAUAUCAUGCUUUUCAGACAGUUGCUAUGGACACGGACUUAGGCUGGAAACAAUUCAGACCUUGAAUGCAUCAGGAUUAUGGAGCUGUCUUAGAUGGAAGGAAUCCCGGAAUCUCAACUCAGCCUGGUGGGCAGGGCCAUGGGAUGUGGGCUCAAGGAUCAGGCUCGGAUUCAUACCCAGCGCCACCCCCUUCUGGAUGUGGGGCCUAGAGAGGUGACUUCAGCCAUUGAGCUGCUGCUUCUCCUCUAACAUGGGUAGAUUCGUGACCUAUUUCUUUCUUUCUUUUUUUUUUCUUUUUUUUGAGAUAGGGUCUUACUCUUGUCACCUAGACUGGAGUGCAGUGGCAAAAUCAUGGCUCACUGUAGUCUCGACCUCCUUGACUCAAGCAAUCCUCUCAUCUCAGCCUCCUGAACAGCUGGGACUACAGCUGCGUGCCACCAUACCCAGCUAAUUUUCUCAUGCUUUAUUUUUUGUAGAGAUGGGGUCCUCGUUAUGUUGCCCAGGCUGGUUUUGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCUUCCUGCUCAGCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGUGUGAGCCACUGUACUUGGCCCUCAGUGACCUAUUUCUGCAUAGUAAAUCACCCCAAAACUUGGCCAUGGUUUCCAGCAAUAAAUAUGUAUCAUCUCACAGAGCUUCUAGGGGUCAGGAAUCGGGUAAUGGCUCAGGGUCUUUCAUGAGAUGCAGUCAAGUUGUCAGCUACUGCCAUCUGAAGUCCUACUUCAGGGGCUACUGCCAUCCGAAGUCCUAACUGGGGCUGCAGGAUCCCCUUCCAAGGUGGUUCACCCACAGGGUUGGCAAGUUAGUGCUGGCUGUUGGCAGGAGGCCUCAGUUCCUUCCACAUGGCCCUCUCCUUAGGACUACUUGAGUGUCCUCACAACAUGGCGGCUAACUUCUCCAAGGGAGCAAAGCAGAAGCUGCAGUGUCUUUCCUGACCUAGCCUCAGAGGUCACACUUGGUCAUCUCCACAAUAUCCUAUUGGUGACACCGGUCAACCCUGCACAUGUUAAGGGAGAGGGGUGUACACAAGGAUGGGACUUCAGGAGGUGGGGACCACCGGGGUGUAUCUUGGAGGCUGGCUGCCAUGGUGGAUGCAAUAUUCCCAGCAGGAGGAGUUGUAGUGAGGAUUAAAUGAGCUCACAUAAUGUGAAGCACCUGGUAUACAAUAAGCACUCAAUAAAGGAUCACACACAGCUCUCCCCACUAGCCUGAUUGGCUUGAGUGGAAAACUUAACUACCCUGUAGCUGCCUCACUUUCUGGAUCAUUUCUUGGCGUCCCCAAGGCCUUCCACCACUCUUUCAUUCAACACAAUCUUCAUGAACACCUACUAUAUCCAAGCCCCGUGCUGGAUGCUGGAGACGCAGUGGUGGCAGAGACACAGUCUGUACUUGCUGUUCCAGGCUGCUUCGGGCAUACAUCAGAGCAGAGAGGGGCUGGCAGACGAGGAGCUGCUUUGGACAGUGUGGUCAGGGAUCGCCUCUCAGUGGAUGUAGCCUGUGAGCCAAGUCCUGAAUGAAGUGAGGGGGCAUUGUGUGGACACAGGAGGGAAGAGCACUCCAGGCAGCUGGAUCAGGUAGGGCAAAAGCAGGAGCAAACCAUCCAUGUCCCAAGGACAGAAUGAAGACCCAAGGGAAGAGGGGCAGGAAAUGAGGUCGGGAAAGCCAGAAGAAGACUGGUUUUUGGCCAGGCGCAGUGACCCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGAGAGGCUAAGGUGGGCGGAUCACCUGAGCCCAGGAGUUCAGGACUGGCCUGGGCAACAUGGGGAAACCUUGUCUCUAUAAAAAACACAAAAAUUAGGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-897.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -940.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 555.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...(((.((((((((((((((((((((((.((((....))))...(((((((..(((((.((...(((((((((((((...))))))..((((..((((((((((((((((((((((...((((.....))))))))))))).(((((.(((...(((((((((((((.((...((((((.(((((((.....))))))).))))))))))))))))).).)))...))).))))).((((.((((((..(..(((.((((((((((((((((((........((((((((((..((..(((......))).))....)))))))))).........)))))))..))))).)).)).)).)))...)..)))))).))))...(((((....((((.......(((((((..(((.(((.((((......)))).((((((...))).)))....))).))).)))))))....))))...)))))))))))...))))))).))))...)))))))...)).)))).)..)))))))))))))))))).((((((.(((.((((...)))).)))...))))))))))))........))))).))).)))))))(((((...........((((.(((((((((..((((((((.((..((((((.((((((((((..(((((((((((.((((((((......((((((((...........................))))))))))).))))).)))....))))..)))).))))))))....))))))))...((.((((...........))))))))))..))))))...((((....)))).((((((......)))))).).))).))))).))))((((((((....((.....(((((((((((((((((((..((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(.((((((.(((((((.....((((((.(((((((.............((((...))))..(((((....(((....(((.((..((((((((.((((.((((..((((((............)))))))))).))))..))))))).)..)).)))....)))...)))))(((((((...))))))).(((....)))((((..((((((....))))))...))))((((((((...((((.....)))).(((((..((.....((((((((((((((.(((((.......))))).))).))))))(((((((((((....)))))((((((.(((((((((((((((.....((((...))))....((((...))))((.(((......)))))((((((.((((((((.((((((..(((((((....(((((((.((((((((..((..((((..........)))).))..))))).)))...))))))).........)))))))..))))))))).))))).))))))))))))))))(.(((........)))).(((((.((((((((.(((..((((...((((.(((((...))))).((...((.....))....)).))))......)))).)))))))))))..(((((((((.....))))..))))).............))))).(((.((((((((((.(((......(((((((((.....)))((.((((((((..(((((..............)))))...((.(((((((((.((.....)))))))).)))))....)))))))).)).....(((((((.((.....))..)))))))...(((((.((((((...((.((((((.((((((..((.....(((((....).)))))).)))))....).)))))).)).)))))))))))...))))))))).))...)))))))).))).))))).)))))).))))))...)))))(((((....))))).........((....)).(((........))).(((((...)))))...))..)))))...))))).))))))))))...)))))).(((((((((.......)))))))))))))))).)))))).).))))))))))))))))))))))))...))))..)))))).))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))..)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({(((.{(((.((((((((.((((((((((({.((((....)))).,{(((((((..(((((.((...(((((((({((((...})))||((({,({(((((((((((({.(((((((((...((((.....))))))))))))).(((((.(((...(((((((((((((.((...((((({.(((((((.....))))))).})))))))))))))))).).)))...))).))))).((((.((((((..{,{(((.(((({(((((((((((((........((((((((((..({..(((......))).}},,,.)))))))))).........)))))))..)))))).).)).)).)))...,..)))))).)))).,...((((.({(.....((((((....},}))))....))}))))....(((((.{(((((..........))))),})))))...,))))))))))))))))))}}....,||||},,,}}))}}...)))))))...)).)))).)..))))))))))))))))))}...........((({...)))).)))))).)).))).})))||{((({.,{((((,((({,..,,,{{,((.((((..((....))..)))).))...((((((.(.{..,((({{..{{||||{{|{.,|{|{|||{,{,,||||||||,,,.{{((((((((...........................))))))))))),,||||,,||,...}})),.)))),)|||||||....}}}}}))},,}||,||||,.|,..,,},,))))},,},...)))}})}}}|{||}}}}))},.((((((......))))))...,....)))))((((((((((((....((.....(((((((((((((((((((..((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(.((((((.(((((((....,{((,,(((({,{{,..,|,|.,|||},((,...,||||{,.||||,,|||{{{...,.,.||,..(((((((.{(((.{(((..((((((..,......,..)))))),))).)))}..))))))).,{{||{,|,((((((,{(((((,{(((((((...)))))))}|||....)}}((((..((((((....))))))...)))},((((....,||{||...||||,,,))),})))},}}.,}})))))),,}})))|||,(((((((.{(((|......{(.((((((((((.((.(,,{,{,,{(((({|{,,.,((((((((((..,{{(({{..|)))).,..((((...)))),,,(((...,,,}||||{(((((.((((((((.((((((..(((((((....(((((((.((((((((..((..((((,,....,,..)))).))..))))).)))...))))))).,,...,,,)))))))..))))))))).))))).)))))))))))))))){,(({{{,....{|{{,.{{.(({{{((((((.(((..((((...,{,(((((({...})))},)}...{{.....},....,,.}}}}......)))).)))))))))))}}(((((((((.....))))..))))).........{{{,|,|||{((({((({{{{{{{,{{,{,..,{(((({.{(({|{{|,|{((,(({{((((..,(((((({.......,....,)}.......,..((((({{((.....)))))))),||||}..{{||||||}|{||{....,,,||||}||..}}}))}})))||||{{{(((((.((((((...{(.((((((,({,{{(,({(.....{{{{|....}.}})).,.))),}....).)))))).)).))))))))))).}))),.,)),,}))}}))))))})),))).}))|).)))),)}}}}}}}},..,,.,}}}))))))))),,,))))))).{{....)).|||,.....},))),|((((...))))).......,..)).)))),}))))).)))))).))))))),,|((((((((.......))))))))}))))))).)))))).).))))))))))))))))))))))))...))))..)))))).))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)).))))))))))))))))))).,,,)))))))}}))))
Back