Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DLGAP4_0001700
Sequence Length
1313 nt
GC Content
0.6679
GAUAGCUGCCGCCCGGGAGAGGUGACCCGGGCGCCCUGCUAGGGUGAAGGCCCCUGCCCUCGGCCCGGGAUCAUGAAAGGCCUCGGUGACAGCCGCCCCCGCCACCUCUCCGACAGCCUAGACCCACCCCACGAGCCCCUGUUUGCAGGGACCGACCGCAACCCCUACCUGCUGUCGCCCACGGAGGCCUUCGCCCGCGAGGCCCGCUUCCCCGGGCAGAACACCCUGCCAGGAGAUGGCCUCUUUCCCCUCAACAACCAGCUGCCCCCGCCCAGCAGCACCUUUCCCCGCAUCCACUACAACUCCCACUUCGAGGUGCCAGAGGAGAGCCCCUUCCCCAGCCAUGCCCAAGCCACCAAGAUCAACCGGCUGCCCGCCAACCUCCUGGACCAGUUUGAGAAGCAGCUGCCCAUCCACCGUGAUGGCUUCAGCACCCUCCAAUUUCCCCGUGGCGAGGCCAAGGCCCGUGGUGAGAGCCCUGGCCGCAUCCGCCACCUGGUCCACUCAGUCCAGCGGCUUUUCUUCACCAAGGCACCCUCACUGGAGGGCACAGCGGGCAAGGUCGGUGGCAAUGGCAGCAAGAAGGGUGGCAUGGAGGACGGCAAGGGCCGGAGGGCCAAAAGCAAGGAGCGGGCCAAGGCUGGGGAGCCCAAACGGCGCAGCCGCUCCAACAUCUCAGGCUGGUGGAGCUCCGAUGACAACUUGGACGGCGAGGCCGGCGCCUUCCGCAGCAGUGGCCCAGCCUCUGGGCUGAUGACACUAGGCCGCCAGGCAGAACGCAGCCAGCCACGCUACUUCAUGCACGCCUACAACACCAUCAGUGGGCACAUGCUCAAAACCACCAAGAACAACACUACUGAGCUGACUGCCCCACCACCCCCGCCCGCACCCCCAGCCACCUGCCCCAGCCUUGGGGUGGGCACUGACACCAACUACGUCAAACGGGGCUCCUGGUCCACUCUGACCCUCAGCCACGCCCACGAGGUCUGCCAGAAGACCUCAGCCACCUUGGAUAAGAGCCUGCUCAAGUCCAAAUCCUGCCACCAGGGUCUAGCCUACCAUUACCUGCAGGUGCCCGGCGGCGGCGGCGAGUGGAGCACCACGCUGCUGUCCCCACGCGAGACGGAUGCCGCGGCCGAGGGCCCUAUCCCGUGCCGGCGCAUGCGCAGCGGCAGCUACAUCAAGGCCAUGGGCGACGAGGACAGCGACGAGUCCGGCGGCAGCCCCAAGCCCUCACCCAAGACCGCGGCGCGGCGCCAGAGCUAUCUGAGGGCCACGCAGCAGUCGCUGGGAGAGCAGAGCAACCCCCGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-538.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -555.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((...(((((((((((((((((.....((..((((....))))..)).....))))))).))......(((...((((.....))))...)))))))))))((((((.(((..........((.(.(((((....))))).)))..........)))...))))))((((((((.((((((((.((((((((((..((.((...(((((......))))).))))..)))))).................((((((.(((((.....((((((...(((((.(((.......((((((((....)))).....)))).((((((.(((..(((.(.((((.((((((....((.....((((((.((((.((.((((((((((.(((.((.(..((((.(((((......)))))...))))..).))))).......((((((.(((((.(((.(.......).))).))))).....))))))))))))).....((((.((.(((((........))))).(((((....)))))....)))))).)))..))))))...))))))..))..)))))).))).).).)))..)))..)).)))).........))))))))((((((((((((.(((.....)))((....))............((((((.((.(((((((.......))))).((((.(((.(((((.(((.((....(((((((((((....))))).........))))))...)).))).)).))).)))..((........))..((((((..........)))))).((.(((((......................)))))))................)))).)).)).)))))).....))))))))))))(((((((..((((.........))))..((.((((...((((......))))...)))).)).....(((((((......))))))).......((((((..(((....)))..))))))((((((....))))))...))))))).........))))))..))))).))))))..((((....))))((..((((((......).)))))..)).)))).)))))))).....)))))..)))((....)).))))))))))......(((...((((..((.((((........))))..))...))))...)))(((.((((.(((.((.(((.(((.(((((....)))).).))).))).)).)))..)))).)))....((.......))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((((((...((((((((({(((((((,,,..((..((({...,|}}}..)),.,,.))))))).}}......(((...((((...,,))}}...}})})))))))((((((.(((..........((.(.(((((....))))).}))...,......))}...))))))((((((((,((((((((.((((((((((..({{((,..(((((......))))).))))..)))))).................(((((.........)))))..,,......((((((.......{{{,{{{,..,.)))),..},)}})}|,((((((....(({,((((...{{{,,,.......,{{{{{(((((((...(({{,((((((((.{((.((.{..((((.(((((......)))))...))))..}.))))}.......((((((.((({{.(((|,,.,,,..}.))),)))))...,.))))))))))))))...{{{...|.|(((({........))))).,},|,,}}))))),....))))))}.})))))))))..}))),}}..)))))){|((.(((.(({{(((..,((((,,.,))))...,{(..(((((((((((..((((,((((,.....((((...((((.((((((({(...((((.....)))},.}})).....)))))))))...)))),.},,}))).))))..)))))).}}})))..))|((((....(((((.|,..{((,{,,.{.,||}.}}...||}.,,,,.,))..))))}......)))).||(((((,,.(((((......................)))))}}..)))))},|{{{,,{{|||||{.,|{||,|}|{(((((((((....))))((((((..((((.........))))...|,((((...((((......))))...)))).,))))}}(((((((......))))))).......((((((..(((....)))..)))))){{((((....))))))...}.............))))))),..)).}))))}))}).||||,{{.,,,,}}))))))))))).)).,...))))}),)))).)))))))),,..,)))))..))){{....)).))))))))))......(((...((((..((.((((........))))..))...))))...)))(((.((((.(((.((.(((.(((.(((((....)))).).))).))).)).)))..)))).)))....{{.......}}.,
Back