Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DLGAP4_0004500
Sequence Length
518 nt
GC Content
0.6274
GUUCAUCAUGCCUAGUGGCGUAUAAGAAGACCCCGCCACCGGUCCCUCCACGCACCACUUCAAAGCCGUUCAUCUCAGUCACAGUCCAGAGCAGUACUGAGUCUGCCCAGGACACCUACCUGGACAGCCAGGACCACAAGAGCGAGGUGACUAGCCAGUCGGGCCUGAGCAACUCGUCGGACAGCCUGGACAGCAGUACCCGACCGCCCAGCGUGACACGGGGUGGAGUCGCCCCAGCCCCUGAGGCCCCAGAGCCACCCCCAAAACAUGCAGCUCUGAAAAGUGAACAAGGGACGCUGACCAGCUCUGAGUCCCACCCCGAGGCCGCCCCCAAAAGGAAACUGUCAUCGAUAGGAAUACAAGUCAGCUCGGGUGCGGAGGCCAUAGCCCCGCUUGGCGGCAGGAGCAGCAUGGAGCAUAGACGCUGUUGGGCCAGGGGCCCAGGACCCAGGGCCCUUGAGCCAUGGGGGUUGCUCGAGGGGAACUUUGCCCAGAGCCCUCUCGGGCCUUGGGGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.50
Frequency: 0.0001
Diversity: 83.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((((....))))).......(((.(((((.((((((.....((((...........((...(((((((..((...((((.(.((((........)))).).)))).....(((((....))))).......))..)))))))...)).....((((..(((...)))(((((.....(((.....)))...))))).)))).))))))).)))))))).)))(((.(((...))).)))(((.((((.(((((((...(((((.(((((.............(((((.(.((.....)).).)))))........(((((((((...((...(((((..((.....))..)).)))...)).))).((((.(((....)))))))..)))))).))))).))))).(((......)))....((((((((((((........))))))))).))).))))))).))))..)))))))(((.(((((.((((....)))).))))).).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...(((((....))))).......(((.(((((.((((({....,((((...........{{.,.(((((((..((...((((.(.((((........)))).).)))).....(((((....))))).......))..)))))))...}}..{{{((({,,({{...}}}(((((...,,{{{....,))),.,))))).)),}.))))))).)))))))).)))(((.(((...))).)))(((.((((.(((((((...(((((.(((((.....,,.,....(((((.{.({.....}).,.)))))..,,,,,,{({((((((...,|}..,((((,.,,,,,,,}}..,}..})...)),))).((((.(((....))))))).,}))}}}.))))).))))).(((......)))....((((((((((((........))))))))).))).))))))).))))..)))))))(((.(((((.((((....)))).))))).).))
Back