Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DLGAP4_0005100
Sequence Length
2937 nt
GC Content
0.5689
GUUCAUCAUGCCUAGUGGCGUAUAAGAAGACCCCGCCACCGGUCCCUCCACGCACCACUUCAAAGCCGUUCAUCUCAGUCACAGUCCAGAGCAGUACUGAGUCUGCCCAGGACACCUACCUGGACAGCCAGGACCACAAGAGCGAGGUGACUAGCCAGUCGGGCCUGAGCAACUCGUCGGACAGCCUGGACAGCAGUACCCGACCGCCCAGCGUGACACGGGGUGGAGUCGCCCCAGCCCCUGAGGCCCCAGAGCCACCCCCAAAACAUGCAGCUCUGAAAAGUGAACAAGGGACGCUGACCAGCUCUGAGUCCCACCCCGAGGCCGCCCCCAAAAGGAAACUGUCAUCGAUAGGAAUACAAGUUGACUGCAUUCAGCCAGUGCCAAAAGAGGAGCCCAGUCCCGCUACCAAAUUCCAGUCCAUCGGGGUUCAGGUAGAGGACGACUGGCGAAGCAGCGUCCCCUCUCACAGUAUGUCCUCCCGACGGGACACAGACUCGGAUACCCAGGAUGCCAAUGACUCAAGCUGUAAGUCAUCUGAGAGGAGCCUCCCGGACUGUACCCCUCACCCCAACUCCAUCAGCAUCGAUGCCGGUCCCCGGCAGGCCCCCAAGAUUGCCCAGAUCAAGCGCAACCUCUCCUAUGGAGACAACAGCGACCCUGCCCUAGAGGCGUCCUCGCUGCCCCCACCCGACCCCUGGCUCGAGACCUCCUCCAGCUCCCCAGCAGAGCCGGCACAGCCAGGGGCCUGCCGCCGAGACGGCUACUGGUUCCUAAAGCUACUGCAGGCAGAAACAGAGCGGCUGGAAGGCUGGUGCUGCCAGAUGGACAAGGAGACCAAAGAGAACAACCUCUCUGAAGAAGUCUUAGGAAAAGUCCUCAGUGCUGUGGGCAGUGCCCAGCUACUGAUGUCCCAGAAAUUCCAGCAGUUCCGGGGCCUCUGUGAGCAAAACUUGAACCCUGAUGCCAACCCACGCCCCACAGCCCAGGACCUGGCAGGGUUCUGGGACCUGCUACAGCUGUCCAUCGAGGAUAUCAGCAUGAAGUUCGAUGAACUCUACCACCUCAAGGCCAACAGCUGGCAGCUGGUGGAGACCCCCGAGAAGAGGAAGGAAGAGAAGAAACCACCCCCUCCGGUCCCAAAGAAGCCAGCCAAAUCCAAGCCGGCAGUGAGCCGCGACAAGGCCUCAGACGCCAGCGACAAGCAGCGCCAGGAGGCCCGCAAGAGACUCCUGGCGGCCAAGCGGGCAGCUUCUGUGCGGCAGAACUCAGCCACCGAGAGCGCAGACAGCAUCGAGAUUUAUGUCCCGGAGGCCCAGACCAGGCUCUGAGACCAUGCAGGAGGAAAGAAACGAUUUUAAAUCAUUAAAAACACAAAAACUAAGUGCGAACGGAACAGAGUUUUCUCAACCUUUGCUAUGGUUAUUCUGUCUAGAGACCCUGAGCCAACUUUCAAAUUGACGCAUACAAGGGCUCACAAUUUGGCUUUUUUGGGUCCCUCCCAGCUUUAGGUUAUGAAGAUUUUACUCACAAAAAAAAUCAACAAAAAUCACGAAACUAGAAAACUUUUUUUUUCCUCUUGCUGGCCGUGGUGGACUAGAUAGAUGGACGUCGGCAACUCCCGGCCCAGCCUCCAUACUGCGGUCUUUUUACUCGUUCUAUCUGAUGAGAACUCACACUAGCUUGUUUACAAGAUGACGACAGUCCAAGGGCAGCCUUGGGCACCUGCCAUGUCCCUCCUUUCCCCAGCUAUCCCCGCUCUGACCUUGAUUUUCAUUCUUAUGUUUUUCUCUUUUCCCUUCAGAGCUCACACAGUGGUCACCAUUGUGGCAAGCGGCUUUCUGGGUCUCAGCCCUCUCUGCGGUUGAGGGCCCAGAGGACAGAGAGAUGGACAUGCGUCCCCUCCCUCCCCCCGCCAAGUGCUCACACACAACCUCACGCGCACACACACACACGCAGAUGGAGGCGCCUCACUGGGAGGUGCCCCGCCAGCCCUGGGCAGUGUCAGGCAGGACUCACUCACCGCUGAGCAGAUGAGGGAAGUUUUAGUCUUGGCGGGUGGAAAUGAGACGAAGCCACAGUUAUCACACUCCAGACUCCUGCCCUUUUAUUUUCUCCAGCCCCUUCUUCCUUCAGCAAAAUCUAGGACUCCCGAGUGGCUUCCAGGGGGCCGUCAGUCCUCAGCCGCGCCUGUGUCCGGUGCCCGAGGGGCGGGCGGCGGUGUCUGUAUGUAUGUGUACAUAUGCACAUAGACCUUAGAGUGUAUAGUUAACAAACGCCCAUCUGCUCACCCAUGCCCACCCAGCGCCGCCGCCGCUGGCUCUCGGGGCACCUGGCAGGAGGCGGGUGUGUGAAUAGCAUAUAUUUUUACAUGUACUAUAUCUAGGUGUGUGUACAAGUGUGUGUAAAAAUAUAUACCUUGUGUGUAAGCAGCCCUUUUUUUUUUUGGUCUCCACCCCCCUCCCCCCGCCCCGCACUCCUAAGGGCCCAUCUGCCCAGCCUCUGAGUUUUCUGUUCUAUUUUUUUUUUAACCCCAAUUAUCCUUCUCUCUCUCCUGCCCCCGCAUCCCACUCCCAGGGUGUCACGAGCCCUGAGCUGCAAUGGCCCGGGCCUGCAGGGCGGGGUAGGGGAGGGCAGGGGCUGAGCCCCGAAGCCAGCUCAGUACCUGAGGGGCUGCUCUAUGCUGUGUAUGCGCCUCUCUGGCAUCCGAGACAUCCUCUUGGCUGGCGCUUGCUGCAGGGGGGGACCCCCCCCCGUCCCCAGGUGAACCAAGGGUCUGCUCCGGGGCCCAUUUCCAGCUUGGCCGCCGUCUGUGACCUUGGGCAAGUCACUUGACCUCUGUGUGCCUCAACUUCCUCCUCUGUAAAACGGGGACAGUCCCUGCCCCUCCCUACCUCACAGGCAUGUUGUGAGAAUAAAUGAGGUAACGUGUACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1050.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1102.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((.((.......((((........)))).......)).))))).....((...(((((((..((...((((.(.((((........)))).).)))).....(((((....))))).......))..)))))))...))..((((.((.((.((.....(((((.....(((.....)))...))))).)).)))).))))..((((((....)))))).((((.((((((((..(.((((...........((((((((......((((....(((((((((.(((.((((..((((.......(((((((..((....))...(((((...)))))((((.((.......)).))))((((((((((....((((.(..((((((..(((((.((((((........))))))..))))).(((((.(((......))))))))(((((((.....((((((......))))))((..((.((....))))..))...((((((.........)))))).)))))))........))))))..).))))..........((((......)))).(((....(((((((((((...((((.....))))..........(((((...)))))...((((((...((((.....))))...))))))................((((((((.....)))..(((....))).)))))(((...))).))))))))))))))....))).))))))).....((((.(((.(((.((((.((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((..(((((...(((((......)))))......)))))((((....))))....(((((((.(((..(((((((((.((.(((((.(((..........))).))))).)).)).))).......(((((((...((((.((...((......))...))...)))))))))))))))..))))))))))))))))))..))....)))))...(((((...)))))((((((((....(((((...((((((..((..(((.((((...(((..(.((..((...........))..)))))).))))))).))..)))))).........((.(((.....))))).....((.((((((.(((.((........))((((((((.(.(....).).))))))))((((...(((((((((((((((((((........))).......))))))).)))...........)).))))..)))).......))))))))).))..(((((((((((((((.((((...))))........(((.........)))......((..(((((((((..(((((..(((..((...........((.(((((.(((((((.......((((..((........))...)))))))))))....))))).)))).)))...)))))..)))))))))..)).......................................))))))))))))))))))))..)))))..)))...((.((((((.((((......(((((((........))).))))......((((((......))))))............((((....)))).........((((((((....))))))))...)))))))))).))......)))))).))))))))))).....((....(((....)))....))..)))).))).)))))))..((((((((...))))))))....)))))))(((((((((((((((.....).)))))).))))))))))))..)))).))).)).))))))).................(((......)))........(((............))).(.(((.((((((((.....))))))))))).).((((((((.((((...(((((((...(((((..((((.(((((((.((........((((..((((((.(((...(((((.(((.........((((((.((...((((((((.........................................((((......((((((....((((((.....))))))))))))......))))((((((((((((.((((((((((((.(((...((.(((..((.(((((((............)))))))))..))).))........((........)).....)))))))))))))..)).))))).))))))).))))))))...)).))))))...((((((((((.((((((((((.......)))))))))).)))))))))).....(((((((...)))))))................))).)))))........))).))))))..).)))........))))))))).))))...))))).))))))).......................................(((....)))...)))))))))))).)))).......)))))))).))))).)))))).))))))((((((((((.((((((((((((.((((((.(((..((((..((((((.(((((.((.....))((((((.(((((..........((((((.....))))))..))))).))).)))(((((((...))))))))))))))))))......))))..))).)))))).............((((((.(((.(((((.........)))))..)))....))).))).........(((((........))))))))))))))))).))))))))))..)))))))..))))......))..((((.....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((({(((((((,((((,({....,..((({.,,,,.,.|||}.....,,||.}}}}}.....{{.,.(((((((..((...((((.(.((((........)))).}.)))).....(((((....))))).......))..))))))),,.}}..{((({({{{(.({..,,,(((((...,,{{{....,))),..))))).)).},))})))).,{(|(||,.,,)|||||.({(((((((((((..(.((((...........((((((((.,....((({.,..(((((((((.(((.((((..((((......,(((((((.,,,....}}...(((((...}}}}}({{{.{,.|,,..,}}.}}}){(((((((((....((((.(..((((((..(((((.((((((........))))))..))))).(((((.(((......))))))))(((((((.....((((((......))))))((..((.((....))))..))...((((((.........)))))).)))))))........))))))..).))))..........((((......)))).{|({{..(((((((((((...{.((((,,.......).)))}.,(((((...)))))...((((((...((((.....))))...))))))..............,,(((({({(.....}}}..(((....))).))))}|||...))).))))))))))),,).},}))).))))))}.....((((.(((.(((.{(((.((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((..(((((...(((((......)))))......)))))((((....))))....((((((({(((.,((({((({(.((.(((((.(((.,,.....,,})).))))).)).)},})).......((((((,..,((((.{(...((......))...))...))))))))))))))).,))))))))))))))))))..))....)))))...{((((...))))){{{(((((....(((((...((((((..((..(((.((((...{{{..(.((..((...........)}..)}}))).))))))).))..)))))).........{{{(((.....)))),,....((.((((((.(((.((.....}}.,|((((((((.,.{....}.}.))))))))|(((...{(((({(((((((((((((........))).......))))))).)))...,.,,,...}),)}))..)))).......))))))))).))..(((((((((((((({.{,(({{{|....,}}}},.{,....,,{{,.|,|{,,,.{(...,((({..,|},,{||},,}}..,)))).,}||}},.{{.(((((.((((((,.......,{((,.((........))}},,}}}))))))}....)))}).,,}},}},,,,}}}||.,|..((((((..........}}}}}}......,,,,.......,,}}....,.)))))))))))))))))))),.)))))...,|{..((.((((((.((((......(((((((........))).))))......,(((((,.,,,,,,||}|,,{.........,{{|||..},)),,))))}..((((((((....))))))))...)))))))))).))...,..)))))).))))))))))).....((....(((....)))....}}..}))).))).)))))))..((((((((...))))))))....))))))){((((((((((((({.....}.))))))))))))))}))))..)))).))).)).))))))).................(((,.....}..........|{|,...........}}}.{.{((.((((((((.....))))))))))}.,.((((((((.((((...(((((((...(((((..((((.(((((((.(({,......,,,|..(({((({(((...{((({.(({.....((((((((((.((...((((((((...............,...............}.........((((.,..,.((((((....((((((.....)))))))))))).,..}.))))((((((((((((.({((((((((((.(((..{(({((({{(,.{{|||||}}}......,{,||||,},||..,,,.})|,......||........)}.....))))))))))))).}}).)))))}))))))).))))))))...)).)))))},))))((((((((((((((((((({{{{....}})})})))}}}}}}}})))))))))))))...,|||},,,..}},............})).))}))}}}}}.},))),}}}|||{.,.,,,.....}}})}))))))).))))...))))).....|,,.............},.....................}))))))...,,....))))))))))))})))).......)))))))).)))),.)))))).))))))||||{(((((,((((((((((((.((((((.(((.,((((.{((((((.(((((.{{.....})((((((.(((((.....{{,..{(((({.....)))))),}))))).))).)))(((((((...)))))))))))))))))}..,...)))},}))).)))))).........,...((((({.(((.{{|{|.,,,,.,}})))))..)}}....))).))).........{(({(,{,...,}))))})))))))))))),)))))))})),,})))))).,))))}.....})..((((.....))))..
Back