Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DLGAP4_0006300

Sequence Length

1416 nt

GC Content

0.4407

GAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUUGCAGCGAGCCGAGAUCGUACCACUGCACACCAGCCCGGGCAACAGUGCGAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGUGCACUCCUGUAGUCCUAGCUACACAGGAAGCUAAGGCAGGAGGAUUGCGCACGCACAGAAGGUCAAGGCUGCAGUGAGCCGUGAUGGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAAGACAGAGACCCUAUCUCAAAAACAAAACACAUGAUCUGUAUGAUACCCAGUCAGUUCUUUGUAAUUUAAUUUAUUGUAUAUUUUAUGGCCAAGAAUGUGGUCAUUUUUAGCAAAUGUUCCAUGUGUGAGAAGUAUAUUUUAUAUGAGGUUUAGAGUUUUCUGUCUGUGUGCGUGCGUGUGCGUGCGUGCAUGUACACACAGAUUUUCUUUUUAGUCAGAGUCUAUUCAUCUAUUGACAGACACUUGGGUUGUUUCUACCUUUUGGCUACUGUGAGUCAAACUGCUAUAAAUAUUGGCGUACAAGUAUCUGUUUAAGUCUGUUUUCAAUUCUUUUGGGUUUAUACCCAGAAGUGGAAUUGGUUGAUCAUGUGGCAGAUCUAUGUCUCGCUUUCUGAGGAACCACCCAACUAUUUUCCACAGCAGCUGCAUCAUUUUAUAUUCCUACCAGUAAUGCACAGGGUUCCAAUCUCUCCACAUCUUUGCAACACUUGCUUCCACUUUUCUUGAUAGCUUUUGGGGUUUGUUUGUUUGUUUGUUUGUUCUGGAGACAGGGUUUCACUCUGCUGCCCAGGCUGAAAUUAACAAUAGUGCCAUCAUAGCUCACUGCAGCCUUGACCUUCUGGGCUCAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUGUGUAGCUGGGACUACAGGUGUGCACCACCAUGCCCAGUUUGUUUUUUUUUUUUUCUUUUGGUAGAGAAGAGGUCUCACUGUGUUGCCCAGGCUGGUCCUGAACUCCCAGGCUCAAGUGGUACUCCACCUCGGCCUCCUAAAGUUCUGGGAUUACAGGCAGGAGCCUUGAUAGCUAUCUUAAUGGGUAUGAAGUAUCAUUAUGGUUUUGAUGUGCAGUUCCCUGAUGACUAAUGCUGUUGAGAUGUUGAGCAUAUUUACUGAACAUCUAUCUUUGGAGAACUAUCCUUGUACAUUUUAAAACUGGGUUUAUCUUUUUGUUGUUCAGUUGUAGGGAAUUCUUAUAUAUAUAUAUUCUUGGCAUUAAACCCUUAUCAGAUACAUGAUUUGCAGAGAUUUUCUCCCAUUCUGUGCGUUGGCUUCAUUUCUUCAUAGUGUCUUUUUUUCUAUGAGACAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAUCUCAGCUCACUGCACCCUCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-578.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -602.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 220.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.............)(.((((((..((((.(((((.((((.(((((.((.(((((((((.((((((.(((((((((.(.(((((((..((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((.(((..((((((((((....((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((...((.....((((((((((....(((..((((((((.((((...((((((.((.((((.....((((..(((((..((((....((((......))))...............((((((.((((........(((((.((((.((((((.((((.(((((...)))))((.(..((((.(((.((((((((((..((((((((((....)))))))))))))))))).........))..))).))))..).))....((((((.((((((((.......))).(((((((......))))))).(((((.......)))))..))))).)))))).((.(((((.........((((((((....))))))))((((((.((((((.(((...(((((((....)))).)))...)))((.....))))))))..)))))).(((((((...................))))..)))))))).))......))))))))....)).)))).))))).))))..))))))..)))).)))))..))))....)))).))))))))...)))).))))))))..)))...)))))))))).......))...)))))))))).)))))))))))))))))))))))).))....))))))))))..))).))).))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))......((((((((((((...(((((((.((((...(.((((((((((((...(((((...((((....))))...))))).....))))).)))))))).))))((((((((.(((.((((....)))).))).)).....((((((..(((((((.(((((...............)))))..(((((((.((........)).)))))))......(((......))).................(((((((.........(((..(..((((((.....))))))..)..)))..........))))))).)))))))..))))))..(((.(((...........))).)))...)))))).......))))))).))))))))))))))))..))))))).).))))))))).)))))).))))))))).)).))))).)))).))))).))))..)))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.............)|,((((((..((((.(((((.((((.(((((.((.(((((((((.((((((.(((((((((.(.(((((((..((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((.(((..((((((((((....((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((...{{.....(((((((((({.{.(((..((((((((.((((...(((((((((.((((.,...((((..(((((..(((,...,({{{.......,}}.,,,.,...,}}|||((((((.((((........(((((.((((.((((((.((((.{{{,,...,}},|{(,{..{(((,,,,{((((,(((((({((((((((,,..}}))))))))))))))))),...,,....,,.,}}},}}},..|,,,....{(((((.((((((((.......))).{((((((......))))))}.,((((.......))))}..))))).)))))}.,|,,{{{,...,,...{((((((((....))))))))|{((||.{((((,.{{{.,.(((((({....)))).)))...)))|,}}}}},,}},,,...}}}}}}.{{|||((,,,................}})).,))),,,}},,.......))))))))}...}).)))).))))).))))..))))))..,))).)))))..))))..,.)))).))))))))...)))).))))))))..)))}.})))))))))).......}}...)))))))))).)))))))))))))))))))))))).))....))))))))))..))).))).))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))}......((((((((((((...(((((((.((((...{.((((((((((((...(((((...((((....)))).,.))))).....))))).)))))))).))))(((((({(.(((.((((....}})),))}.}}{||||,....(((((((((((((((((({(.{{,({{.......}}}.(((((((.((........)).))))))).,,...)).)))),.....})))))},.,))))))(((((((.,,....,.(((..{..((((((,...,))))))..}..))).....,}...)))))))..{{{{,,..,.)))}.,(((.(((...........))).)))}..)))))).......))))))).))))))))))))))))..))))))).).))))))))).)))))).))))))))).)).))))).)))).))))).))))..)))))).)