Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DNAJC6_0007100
Sequence Length
427 nt
GC Content
0.4543
AUGGGAAGAAAGAGAUUUAGAAAGACUGACUUCCAGGGUCACACAGCUAGGGGUAGCAAAGCUGGGCAGGAACCCAGGUGCCUCAUCUCCAGACAUGGAGCCCAGCUAUGGGGGAGGUCUCUUUGACAUGGUAAAAGGAGGUGCAGGGAGGCUCUUUAGUAACCUAAAGGACAACUUGAAAGACACCCUCAAAGACACAUCUUCUAGAGUGAUACAAUCUGUGACCAGCUACACAAAGGGAGAUUUAGACUUCACUUAUGUUACCUCCAGAAUUAUUGUGAUGUCCUUUCCUCUGGACAAUGUUGACAUAGGAUUCAGGAAUCAGGUUGAUGACAUUCGAAGCUUUUUGGAUUCCAGACAUCUUGACCACUACACAGUAUACAAUCUGUCACCUAAGUCUUAUCGAACUGCCAAGUUUCACAGCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -113.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...((..(((((((((.....((((..(((...(((((((((((.(((((((((.(((((((((((.((....)).)))....((((....)))))))))))).((((((.((((((((((.(((...........)))))))))))))((((((....))))))................))))))....(((.(((...))))))........((((........))))(((((((.......)))).))).))))))))).)).....))))).(((((........)))))....))))...))).))))...(((((.((.((..(((((((....)))))))..))..)).))))).......((((........))))...))))))))).))...)))((..(((....))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{(,..(,..(((((((((.....{(({,,,.},}|||||(({{{((.(((((((((.(((((((((((.((....)).)))....((((....)))))))))))).((((((.{(((((((((.(((...........))))))))))))|((((((....)))))),.............,.)))))),{{,,{{.|||,..,|||||,.....,,((({........}}},,{{|{{|.......}})),))).))))))))).)).....})))).{((((........))))}.,{..,.,,|{((((({.(((((((((((({.,....})},}}})}.,,,)))))).}}.)})))),,,.....{{||,.......))))...))))))))).}},{{||.,,.}||}}....,)},}
Back