Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DNAJC6_0012000
Sequence Length
384 nt
GC Content
0.5885
GAGGCUUUGGAAUGGGAAGCAAGUCAGCUGCCACCAGCCCAACCGGAUCCUCGCAUGGUACUCCCACCCAUCAAAGCAAACCCCAGACUCUGGAUCCUUUUGCCGACCUUGGGACACUAGGUAGUUCUUCCUUUGCCAGCAAACCCACCACACCAACUGGAUUGGGUGGAGGAUUCCCGCCUCUCAGCUCGCCACAGAAGGCGUCUCCCCAGCCUAUGGGUGGCGGGUGGCAGCAGGGAGGUGCCUACAACUGGCAGCAGCCACAGCCUAAGCCUCAGCCCAGCAUGCCCCACUCCUCUCCCCAGAACCGACCCAACUACAACGUGAGCUUCUCAGCCAUGCCUGGGGGCCAGAACGAACGUGGGAAAGGAUCAAGUAAUUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-121.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -128.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 84.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((..(((((.........((((....))))(((..(((....)))..)))...)))))....)))))))....)(((((..((.((((((((.((.((.((((((....((((((..(((((((((((((......((.((((.((((.....)))))))).))...((((((.(((((((((((......)))).......)))...)))).)))))))))))).)))))))))))))....((((....))))...))))))..)).)).........(((((((.(((((((((.................((((.(((....))))))).))))))...)))..))..))))))))))))).))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((((..((((,.,,......{|{(....}}))((,..,{|.....,)..)))...)))}},}},)))))))....)(((((.,((.((((((((.{(.{{.{{((((.,..((((((..((((((((((((,....,(((.((((.(((...((.{((({,(((((.....{,||}||,,{..((((......)))).,,.}))))))..))))))).))))))))).)))))))))))))....((((....))))..|}}}}}),.},.))...,,....(((((((.(((((((((.................((((.(((....))))))).)))))),..}))..)}..))))))))))))).))...)))))
Back