Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DOCK6_0002600
Sequence Length
788 nt
GC Content
0.5939
AGGGCCCAGGUCAGCGGUCAAGACUGGCCUCAAUGCUUGACUCAGACACAGAAGGCGAAGGGGACAUUGCGGGUACCAUCAACCCCUCUGUGGCCAUGGCCAUUGCUGGUGGCCCCCUAGCCCCUGGCUCCCGGGCCAGCAUCUCCCAGGGGCCACCAACGGCUUCUCGCGCAGGCUGUGCCCUCUCUGCUGAGUCAAGCCGGACCUUGCUGGCGUGUGUGCUGUGGGUGCUGAAAAACACCGAGCCGGCGCUCCUGCAGCGCUGGGCCACUGACCUGACACUCCCCCAGCUGGGACGUCUGUUGGAUUUGCUGUACCUUUGCCUAGCUGCCUUUGAGUACAAGGGGAAAAAGGCCUUUGAACGCAUCAACAGCCUCACAUUCAAAAAAUCUCUGGAUAUGAAGGCGCGGCUAGAGGAAGCCAUUCUGGGUACCAUCGGAGCUCGACAAGAAAUGGUUCGGCGAAGUCGUGAGAGGAGCCCGUUUGGGAAUCCGGAGAAUGUGCGCUGGCGGAAGAGCGUCACACACUGGAAGCAAACCUCAGACCGCGUGGACAAGACCAAGGAUGAAAUGGAACACGAGGCCUUGGUGGAAGGGAACCUGGCAACCGAGGCAAGCCUAGUGGUUCUGGACACACUGGAGAUCAUCGUGCAGACGGUGAUGCUUUCAGAAGCCCGGGAGAGCGUCUUGGGGGCAGUGCUGAAGGUUGUGCUGUACAGCCUGGGCAGUGCCCAGAGUGCCCUCUUCUUGCAGCAUGGCCUGGCCACCCAGAGGGCCCUUGUGUCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-316.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -330.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 240.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((.(((((....))))).....(((((((((((.((.(((.(((..(((((....((.(....)))....)))))..(((((....)))))...((((((((((..((...((((((....))))))...))....))))))))))((((((((....).)))))))))).))).)))))))))))))..........((((.((.(((((((((((((((.............)))))).)).))))))))).)))))))))))(((..((((......)))).)))((((((...(((.((......((((...(.((((((....)))))).)...))))......)))))))))))((((((.(((((.........))))).)).))))..((((......))))..(((((((....(((.....)))........((((.(((.(.((.(((((((((((((....)))..(((((....((((((((........)))).))))..)))))((((((((((((((.(((((..((.((((((((.................((((((((...(((...)))....))))))))...)))..))))).))..))).((((((((((((((....)))))))).).)))))...(((((((.....))))))).)).)).))).))))).))))((((...((((((...)))))).)))).)))))))))).)).).))).))))))))))))))))))(........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((,(((({....))))),....(((((((((((.((.(((.((({.(((((....((.(....)))....)))))}.(((((....)))))...((((((((((..{(...((((((....))))))...}}....))))))))))((((((({....}.)))))))))).))).))))))))))))).,|.,,...{((({,{{.(((((((((((((((.............)))))),)}.)))))))||,}))}}||}}}}{{(,{(((({{,,..|||,,|{(({{{((.{{(((({.,,({{(.,((((((((..,((,((.((((((........)))))).}},},}}},..((((((.(((((.........))))).)),,))))))))))).||}}}{{,,{((((((.(({.(((.{{((,.,..,,...,||||,|||,..)),}}},.,)})))))..))),.}}}})))}..{(((((((........}))).)))}..||||{|||,,,}|,|}},||,,(((..({.{{{({{{{.,.....,.....,...((((((((,..(((...)))..}.))))))))...}||,,||||}.}}..)}),}|||,|((((((((....))))))))})))))))..,}||||{{|||.|))||}}|((({.{{({..{(((((((,,,|}}}}}}},|||}.})))}.,}}))),)}}}}}},}))))}})))}|||},,,)))}.)))))))(........)
Back