Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DOCK9_0009100
Sequence Length
451 nt
GC Content
0.4457
CACCAACAAAGUAGCACAUUGGGAAAUUCCGUGGUUCGCUGUGAUAAACUUGACCAGUCUGAGAUUAAGAGCCUACUGAUGUGUUUCCUCUACAUCUUAAAGAGCAUGUCUGAUGAUGCUUUGUUUACAUAUUGGAACAAGGCUUCAACAUCUGAACUUAUGGAUUUUUUUACAAUAUCUGAAGUCUGCCUGCACCAGUUCCAGUACAUGGGGAAGCGAUACAUAGCCAGUUUAACAAAGUGUGUGGCUCUUCUCCUUCCUGCUUGGAACAGGAAUGAUGCAUGCCAGAUUGCAGCAGCUGGGCAGCCUGGAUAACUCUCUCACUUUUAACCACAGCUAUGGCCACUCGGACGCAGAUGUUCUGCACCAGUCAUUACUUGAAGCCAACAUUGCUACUGAGGUUUGCCUGACAGCUCUGGACACGCUUUCUCUAUUUACAUUGGCGUUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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