Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0000300
Sequence Length
2816 nt
GC Content
0.5376
CAUCCGCAUGUACGCCAAGAACCGGAUUGGCAAGAGCGAGCCCAGCAACGAGCUCACCAUCACGGCGGACGAGGCAGCUCCUGAUGGUCCACCUCAGGAAGUUCACCUGGAGCCUAUAUCAUCUCAGAGCAUCAGGGUCACAUGGAAGGCUCCCAAGAAACAUUUGCAAAAUGGGAUUAUCCGUGGCUACCAAAUAGGUUACCGAGAGUACAGCACUGGGGGUAACUUCCAAUUCAACAUUAUCAGUGUCGACACCAGCGGGGACAGUGAGGUUUACACCCUGGACAACCUGAAUAAGUUCACUCAGUACGGCCUGGUGGUGCAGGCCUGUAACCGGGCCGGCACGGGGCCUUCUUCUCAGGAAAUCAUCACCACCACUCUCGAGGAUGUGCCCAGUUACCCCCCCGAAAAUGUCCAAGCCAUAGCAACAUCACCAGAAAGCAUAUCAAUAUCCUGGUCCACACUUUCCAAGGAAGCCUUGAAUGGAAUUCUCCAGGGGUUCAGAGUCAUUUACUGGGCCAACCUCAUGGACGGAGAGCUGGGUGAGAUUAAAAACAUCACCACCACACAGCCUUCACUGGAGCUGGACGGGCUGGAAAAGUACACCAACUACAGCAUCCAGGUGCUGGCCUUCACCCGCGCAGGAGACGGGGUCAGGAGUGAGCAGAUCUUCACCCGGACCAAAGAGGAUGUUCCAGGUCCUCCCGCGGGUGUGAAGGCAGCGGCGGCCUCAGCCUCCAUGGUCUUUGUGUCCUGGCUUCCCCCUCUCAAGCUGAACGGCAUCAUCCGAAAGUACACUGUAUUCUGCUCCCACCCCUAUCCCACAGUGAUCAGCGAGUUUGAGGCCUCUCCCGACUCGUUUUCCUACAGAAUUCCCAACCUGAGUAGGAAUCGUCAGUACAGCGUCUGGGUGGUGGCUGUUACUUCAGCCGGAAGAGGCAACAGCAGUGAAAUCAUCACAGUCGAGCCACUAGCAAAAGCUCCUGCACGAAUCCUGACCUUCAGUGGGACAGUGACUACUCCAUGGAUGAAAGACAUUGUCUUGCCUUGUAAGGCUGUUGGGGACCCUUCUCCUGCAGUCAAAUGGAUGAAAGACAGUAACGGGACACCCAGUCUAGUAACGAUUGAUGGGCGGAGGAGCAUCUUUAGCAACGGAAGCUUCAUUAUUCGCACGGUGAAAGCAGAAGACUCCGGCUAUUACAGCUGCAUUGCCAAUAACAACUGGGGAUCUGAUGAAAUUAUUUUAAACUUACAAGUACAAGUUCCACCAGAUCAGCCUCGGCUUACAGUCUCCAAGACCACGUCUUCCUCCAUCACCCUUUCUUGGCUCCCUGGAGACAACGGGGGCAGCUCUAUCAGAGGAUACAUACUGCAGUACUCCGAGGACAAUAGUGAGCAGUGGGGGAGUUUUCCAAUCAGCCCCAGCGAACGUUCCUAUCGCUUGGAAAAUCUCAAAUGUGGGACUUGGUAUAAGUUCACACUGACAGCCCAAAAUGGAGUGGGCCCAGGGCGCAUAAGUGAAAUCAUAGAAGCAAAGACCUUAGGAAAAGAGCCCCAGUUCUCAAAGGAGCAGGAGCUGUUUGCCAGCAUCAACACCACACGCGUGAGGCUGAACCUCAUUGGCUGGAAUGAUGGCGGCUGCCCCAUCACCUCCUUCACACUAGAGUACAGGCCCUUUGGGACCACAGUUUGGACCACAGCUCAGAGGACCUCUCUCUCCAAGUCCUACAUCCUGUAUGACCUGCAGGAAGCCACCUGGUAUGAGCUGCAGAUGCGGGUGUGCAACAGUGCGGGCUGCGCGGAGAAGCAGGCCAACUUCGCUACGCUGAACUACGAUGGCAGUACAAUUCCUCCACUCAUUAAGUCAGUUGUCCAAAACGAAGAAGGGCUGACGACCAACGAGGGGCUCAAGAUGCUGGUGACCAUCUCCUGUAUCCUGGUGGGGGUCUUGCUGCUGUUUGUGCUCCUGCUGGUUGUGCGGAGGAGGCGGCGGGAGCAGAGGCUAAAGAGGCUGCGAGAUGCAAAGAGUUUAGCUGAAAUGCUCAUGAGUAAGAAUACCCGGACUUCAGAUACGUUAAGCAAGCAACAGCAGACCCUGCGAAUGCACAUCGACAUACCCAGGGCUCAGCUUUUGAUUGAAGAGAGAGACACGAUGGAGACCAUUGAUGAUCGCUCCACGGUUCUGUUGACGGAUGCUGACUUUGGAGAGGCAGCUAAGCAGAAGUCCCUGACGGUCACUCACACGGUCCAUUACCAAUCGGUGUCUCAGGCCACUGGGCCCUUAGUGGAUGUUUCAGACGCUCGGCCGGGAACGAAUCCCACCACCAGGAGGAAUGCCAAGGCUGGGCCCACAGCGAGAAACCGCUAUGCCAGCCAGUGGACCCUCAACCGACCCCACCCCACCAUCUCAGCACACACCCUCACCACAGACUGGAGGCUGCCAACACCCAGGGCUGCAGGAUCAGUAGACAAAGAGAGCGACAGUUACAGCGUCAGCCCCUCGCAAGACACAGAUCGAGCAAGAAGCAGCAUGGUCUCCACAGAAAGUGCCUCCUCCACUUACGAAGAACUGGCCAGGGCCUACGAACACGCCAAGAUGGAAGAGCAACUGAGGCACGCCAAGUUCACCAUCACGGAGUGCUUCAUAUCAGACACGUCAUCGGAGCAGUUGACGGCAGGGACAAAUGAGUACACGGACAGUCUGACCUCCAGCACCCCUUCCGAAUCGGGAAUCUGCAGGUUCACUGCAUCUCCCCCCAAACCUCAGGAUGGAGGAAGAGUAAUGAAUAUGGCAGUUCCAAAGGCACAUCGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-931.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -980.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 657.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.(((.(((.......((((((.((...((((..(........)..)))).))))).))).....((((((.(((((((((((((......))..((...(((((.((((..........)).)).)))))...))(((((.((.(((((................))))))).)))))((..(((.....)))..)).......((((((.((((((((((......((.(((((...))))).))(((((((.(....((((((.((........((....)).....)).)))))).....).).))))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.(((((...(((...............))).))))).).))))))))))))))........(((((.((....))......(((((................)))))..........(((((...)))))...(((....)))((((((((((.........)))))))..)))..)))))((((.(((((((((...........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))((((((((((.(((.((......((((.((.(((((......))))))).))))...((((((.......))))))))))))).))))))))...(((((((((((((((((((((.((((((((((((((......((..(((..((..(((((((((((..((((((((((((((((....(((............)))...((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((...(((...(((......))).......((((.....)))))))..)))))))).)....))).))).)))).)))))...)))))))))))))))..))))...))))))........((((((((.......((((((.(((((....))))).))))))...(((((((..(((.((.((.((((.....)))).)).))..((((((((.(((((((......((((..((((..((((....(((((...)))))....))))..))))))))..(((.((((((((((((........(((((((((.((.((((....................)))).)).))))))(((....)))..........(((((...))))).........)))....))))).(((((.......)))))(((((((((((((..(.....((((((..((((...........)))).)))))).((((.(((((((.........(((((.........))))))))))))))))..(((((((((((((.....(((((.((((....((((((.......(((((..((((((.(..(((....)))..).)).............(((.(((.((.(((((....))))).)).))).)))(((..(((((...(((..((.((((((.....))))))))..)))..)))))..))).))))......(((..........)))....)))))))))))....)))).)))))........(((((.....))))))))))))))))))((((((.....))))))....)..)))))).))))))).))))))).)))(((....)))((.((((........)))).))......((((((........)).)))).......))))))).)))))))))))..))))))).......((.(((((((((...(((..(..((((....(((((.(((.....((((((((((((((((.((((((((((..((((.(((((((((((.((.(.....).)).))))))))))).))))....((((.(((((((((......(((((((((.....(((..((((.((.....(((..(..((((..(((....(((.(((.(((.(((((((.(.(((........))).).))))).)).))).))).)))....(((.((((((((((...)))))).)).)).))).)))..))))..).)))...)).))))..)))...)))))))))....(((...)))((((........(((((((((((....))))...(((....)))((((...((((..((...))..)))).))))((((.....)))).((....)).((....))..((((((...((.((((......)))).)))))))).))))))).......)))).........)))))).))).....))))....))).)..)))))).)))....)))))).)))))))))).))).))....))))..).)))....))))))))).)))))))))).((((((.((........)).)))))).........)))))...))..)))..))......)))))))))..)))))...))))...))).)).))...)))))).))))......))))))).))))))))))..........)))))))))))(......(((.((((......(((....((((...))))..)))......)))).))).....((((.((((..(((((.(((.(((.((.(((..(....)..))).)).)))))).)))))...))))))))...(((......))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.((((,{((,,,({({{...,,,,,}|||}..((({,.(,.......}..)))).}},,,,}})|}||.((((({,(((((((((((,,.,.,{,||...,...|||(({((((...,,.,.,..|{,|.}},})||,.{|{(({,||,{((({.....,..........))}}},,.}))}||{..{((.....)))..}},.,.,,.((((((.((((((((((......{(.((((,...|)))).}}(((((((,{..,{{(((((.({....,,..{{....)),}...}}.})))))..},.}.},})))))((((.((((((....)))))).)))).(((({.{((((,,.(({...............))).))))).).))))))))))))))........(((({.({....)}......,{{{{...............{|||||.......,{.(((((...))))),,||||....})))||(((((((,,....,,.)))))))..}},..)))))((((.(((((((({,.,........)))))..,...)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))((((((((((,(((.(({{{{..((((.((.(((({......})))))).))))...,,(((,..,}}..)))))))}))))).)))))))),,,(((((((((((((((((((((.((((((((((((((....,.{{..,{(,{,,..(((,(((((((..((((((((((((((((....{{{............}}),..((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((,,..{{,,.{{{....,.)))..,.{{.((((.....)))).}}..)))))))).)....))).))).)))).)))))...}))))))))))))))..))))...))))))).......{(((((((.......((((((.(((({....})))).))))))..{((((.({{((((.((...(((((.((((((...,,.....,|,.,.(((((.(.(((.....((((..((((..((((....(((((...)))))....))))..)))))))).....))).).)))))..,..,.))))))((((((.((.({{{,,{{...,,,...,}}}...}))).)).))))))(((....)))....)))}),...))...)))))).))))}((,((((({(({(({(((({,......)})))}|||||,,.,,,|,{|{{{{...,,,,.)}}.}},..((((((({{(((,.{(((((((((((..,,,.{((((...((((({.,{(((........)))}........{((((((((((((.....(((({.{(((...,((((,,......|||||(,,((((((.,..(((....)))..,.}}.....,|...||.(((.(((.((.(((((....))))).)).))).))){||..({{{{...(((..{{.((((((.....))))))}}}.))}..|||||,.||}.,)))},}},..|}},,,.....,|||...,||}||||||||.,..}}}}.)))}).....,,,|||||.,,,,})))}))))))))))))}(((((({...{|||||,..(((..,,))).,...)))))}))))))),|{((....,}))((.((((........)))).)).,}})))))..))))),,{.,..,}}.}}}..})))))))))))},))}.....)))))))....,.)))))))).)),.......,((((((((...(((((({,((((..((((((((((((((((({{((({{{((,{((((((,(((((((((((.((.(....,|,}}.))))))))))}.}|||,..,..}}}{||||||||,.....(((((((((.....(((..((((.{(..,..(((..(..((((..(((....(({.(((.(((.(((((((.(.(((,.....,.))).).))))).)).))).))).}))..{,({(,((((((((((...)))))).)).)).))),)))..))))..}.))).,,)}.})))..)))...)))))))))....{{{...)})((((........((((((({,||...,||||,|.|,{,.,,)))((((...((((..((...))..)))).))))((((.....)))).{{....}}.((....}}..((((((...{{.((((......)))).}))))))),))))))).......))))...}}}},}),}}}}.}}},..}}}||},.},}}},|,}},}}},}}}..},.}})))).)))))))||.,..........,,..}}..))))))))))))))))))))))))))}.((((((.((........)).)))))).......,,|||,,...,,}})))..}}.}....)))))))))..)))))...))))...)))},).)}..,)))))).))))..,,..))))))).))))))))))....,.....|||||}|}}}}{.}.|||{((.((((......(((....((({...))))..)))......)))).)))...,.((((.((((..(((((.(((.(((.((.(((..(....),.))).)).)))))).)))))...))))))))...(((......))).}
Back