Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0001300
Sequence Length
443 nt
GC Content
0.5440
GUACAAUUCCUCCACUCAUUAAGUCAGUUGUCCAAAACGAAGAAGGGCUGACGACCAACGAGGGGCUCAAGAUGCUGGUGACCAUCUCCUGUAUCCUGGUGGGGGUCUUGCUGCUGUUUGUGCUCCUGCUGGUUGUGCGGAGGAGGCGGCGGGAGCAGAGGCUAAAGAGGCUGCGAGUAAGAAUACCCGGACUUCAGAUACGUUAAGCAAGCAACAGCAGACCCUGCGAAUGCACAUCGACAUACCCAGGGCUCAGCUUUUGAUUGAAGAGAGAGACACGAUGGAGACCAUUGAUGAUCGCUCCACGGUUCUGUUGACGGAUGCUGACUUUGGAGAGGCAGCUAAGCAGAAGUCCCUGACGGUCACUCACACGGUCCAUUACCAAUCGGUGUCUCAGGCCACUGGGCCCUUAGUGGAUGUUUCAGACGCUCGGCCGGGAACGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((((..........(((((((.(.(........).).))))))).......)))))))((.(((((........)))))...((.(((((((.(((((((.((((.(((((((((((((((((.((.(.....).)).))))))))))..........(((((((.(.(((....))))))).))))...........))))))).)))))))))).(((..((.(((((.((.((...((((((((((((((.....))))).((((((((((((.((((..(((((((((...((.(((((((((.......((((.((((...))))))))..)))))))..)).)).)))))).)))...)))).....)).))).)))))))......))))))))))))).)))))..))..))).).)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.....{{{((,.,,,.....(((((((.(.(........).}.))))))).......)))))}}{{.,{((({.{{.,,.},))}}}.||,{((((((.(((((({{((((.(((((((((((((((((.((.(.....).)).)))))))))),...,,....(((({({,(.(((....))),)),,)))).......,...})))))).)))))))))),(((..((.(((((.((.{{...((((((((((((((.....))))).((((((((((((.((((..(((((((((.{{,{.(((((((((......,((({.(({....)}))))))..)))))))..}).})})))))).)))...)))).....)),,))}}))))))......)))))))))}})).)))))..))..))).).))))))},,))
Back