Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0001800
Sequence Length
480 nt
GC Content
0.5354
GAUACAUACUGCAGUACUCCGAGGACAAUAGUGAGCAGUGGGGGAGUUUUCCAAUCAGCCCCAGCGAACGUUCCUAUCGCUUGGAAAAUCUCAAAUGUGGGACUUGGUAUAAGUUCACACUGACAGCCCAAAAUGGAGUGGGCCCAGGGCGCAUAAGUGAAAUCAUAGAAGCAAAGACCUUAGGAAAAGAGCCCCAGUUCUCAAAGGAGCAGGAGCUGUUUGCCAGCAUCAACACCACACGCGUGAGGCUGAACCUCAUUGGCUGGAAUGAUGGCGGCUGCCCCAUCACCUCCUUCACACUAGAGUACAGGCCCUUUGGGACCACAGUUUGGACCACAGCUCAGAGGACCUCUCUCUCCAAGUCCUACAUCCUGUAUGACCUGCAGGAAGCCACCUGGUAUGAGCUGCAGAUGCGGGUGUGCAACAGUGCGGGCUGCGCGGAGAAGCAGGCCAACUUCGCUACGCUGAACUACGAUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-147.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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