Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0002000
Sequence Length
950 nt
GC Content
0.5326
GCUCCCAAGAAACAUUUGCAAAAUGGGAUUAUCCGUGGCUACCAAAUAGGUUACCGAGAGUACAGCACUGGGGGUAACUUCCAAUUCAACAUUAUCAGUGUCGACACCAGCGGGGACAGUGAGGUUUACACCCUGGACAACCUGAAUAAGUUCACUCAGUACGGCCUGGUGGUGCAGGCCUGUAACCGGGCCGGCACGGGGCCUUCUUCUCAGGAAAUCAUCACCACCACUCUCGAGGAUGUGCCCAGUUACCCCCCCGAAAAUGUCCAAGCCAUAGCAACAUCACCAGAAAGCAUAUCAAUAUCCUGGUCCACACUUUCCAAGGAAGCCUUGAAUGGAAUUCUCCAGGGGUUCAGAGUCAUUUACUGGGCCAACCUCAUGGACGGAGAGCUGGGUGAGAUUAAAAACAUCACCACCACACAGCCUUCACUGGAGCUGGACGGGCUGGAAAAGUACACCAACUACAGCAUCCAGGUGCUGGCCUUCACCCGCGCAGGAGACGGGGUCAGGAGUGAGCAGAUCUUCACCCGGACCAAAGAGGAUGUUCCAGGUCCUCCCGCGGGUGUGAAGGCAGCGGCGGCCUCAGCCUCCAUGGUCUUUGUGUCCUGGCUUCCCCCUCUCAAGCUGAACGGCAUCAUCCGAAAGUACACUGUAUUCUGCUCCCACCCCUAUCCCACAGUGAUCAGCGAGUUUGAGGCCUCUCCCGACUCGUUUUCCUACAGAAUUCCCAACCUGAGUAGGAAUCGUCAGUACAGCGUCUGGGUGGUGGCUGUUACUUCAGCCGGAAGAGGCAACAGCAGUGAAAUCAUCACAGUCGAGCCACUAGCAAAAGCUCCUGCACGAAUCCUGACCUUCAGUGGGACAGUGACUACUCCAUGGAUGAAAGACAUUGUCUUGCCUUGUAAGGCUGUUGGGGACCCUUCUCCUGCAGUCAAAUGGAUGAAAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-308.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -324.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((................)))))((((((((((..(((.....)))..))(((((.........((((((((((......((.(((((...))))).))(((((((.(....((((((.((........((....)).....)).)))))).....).).))))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.(((((...(((...............))).))))).).))))))))))))))............((((((..(((.....((((................(((((((((....(((.((((...))))))))))).....)))))(((((((.........)))))))..((....))..((((.(((((((((...........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))..((((.(((((((((.(((.((......((((.((.(((((......))))))).))))...((((((.......))))))))))))).)))))))))))((.(((....))).)).)))).....)))..))))))....)))))..(((....))).(((((((..((((((((((((((((....(((............)))...((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((...(((...(((......))).......((((.....)))))))..)))))))).)....))).))).)))).)))))...)))))))))))))))..))))...)))))))(((((...))))).........((((((.(((((....))))).))))))..)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((................)))))((((((((((..(((.....)))..)){{{((..{{,,...((((((((((......{(.(((({...})))).)}(((((((,(,,,,((((((.{{..,.,,..((....}},|...,}.})))})..},.}.}}})))))((((.((((((....)))))).)))).(((({.{{(((,,.(({...............))).))))).).)))))))))))))).......,||..{{(({{..||,.,,..(((({...............{|||||,,,....{{,(((((...))))),,||||....,)))))(((((((,,.....,.)))))))..||...,)),.((((.(((((((({,.,........)))))..,...)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).))))).,(((|{(((((((((,(((.(({{{{..((((.((.(((({......})))))).))))...,,(((,..,}}..)))))))}))))).)))))))))))((.(((....))).)).}))}...}}))),,)))))}....}}}}}..|||....|||.(((((((..((((((((((((((((....{{{............}}),..((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((,,..{{,,.{{{....,.)))..,.{{.((((.....)))).}}..)))))))).)....))).))).)))).)))))...}))))))))))))))..))))...))))))){((((...)))))}}}......((((((.(((((....))))).))))))..)))))))).......
Back