Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0003700
Sequence Length
459 nt
GC Content
0.5142
CUCCUGAUGGUCCACCUCAGGAAGUUCACCUGGAGCCUAUAUCAUCUCAGAGCAUCAGGGUCACAUGGAAGGCUCCCAAGAAACAUUUGCAAAAUGGGAUUAUCCGUGGCUACCAAAUAGGUUACCGAGAGUACAGCACUGGGGGUAACUUCCAAUUCAACAUUAUCAGUGUCGACACCAGCGGGGACAGUGAGGUUUACACCCUGGACAACCUGAAUAAGUUCACUCAGUACGGCCUGGUGGUGCAGGCCUGUAACCGGGCCGGCACGGGGCCUUCUUCUCAGGAAAUCAUCACCACCACUCUCGAGGAUGUGCCCAGUUACCCCCCCGAAAAUGUCCAAGCCAUAGCAACAUCACCAGAAAGCAUAUCAAUAUCCUGGUCCACACUUUCCAAGGAAGCCUUGAAUGGAAUUCUCCAGGGGUUCAGAGUCAUUUACUGGGCCAACCUCAUGGACGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -141.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 120.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((....))))))).))(((.(((((((...((.((((.........(((((((..(.(((((((.(((((................))))).....(.(((..(((.....)))..))).)(((.....)))((((((((((......((.(((((...))))).))(((((((.(....((((((.((........((....)).....)).)))))).....).).))))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.(((((...(((...............))).))))).).))))))))))))))..............((....))......(((((................))))).....))))))).)...))))))))))).)).)))))))(((((((.........)))))))..((....))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((....)))))))},)(((.((((({({{{...,,,,....}.,|.|||||((,.({(((({((.{{(({.........,,.....|||||,..,}||{((,,(((.....)))..},,.,,{{......,,((((((((((......{(.(((({...})))).)}(((((((,{..,{{(((((.({..,.....{{....}),|...}}.))))))..},.).),})))))((((.((((((....)))))).)))).(((({.{{(((,,.(({...............))).))))).).)))))))))))))).......,||,,..||,,,.)}....,.,{{{{...,...........,|)))}.....}}}}}||{||..,)))))}}})},...,))))))(((((((,,....,}.)))))))..||...,)),,.)))
Back