Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0004800
Sequence Length
423 nt
GC Content
0.4823
UUCCUGCGAUGAUAACAUCCUAUCCAAAUACUACCCUGGCCACGCAGGGGCAGAAAAAGGAGAUGAGCUGCACGGCGCAUGGUGAGAAGCCCAUUAUAGUCCGCUGGGAGAAGGAGGACCGAAUCAUUAACCCUGAGAUGGCCCGUUAUCUUGUGUCCACCAAGGAGGUGGGAGAAGAGGUGAUUUCUACUCUGCAGAUUUUGCCAACUGUGAGAGAAGAUUCUGGUUUCUUUUCCUGCCAUGCUAUUAAUUCUUAUGGGGAGGACCGUGGAAUAAUUCAGCUCACAGUGCAAGAGCCCCCAGACCCUCCCGAAAUUGAGAUCAAAGAUGUCAAAGCACGCACAAUUACGCUCAGGUGGACCAUGGGGUUUGAUGGAAACAGUCCCAUCACAGGCUACGAUAUUGAAUGCAAAAAUAAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-113.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -122.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 69.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.((((......((((.(((........(((((......)))))((((..............)))).(((((.((.((((........)))).)).))))))))..))))((((....(((((((((((((((((......))))))(.(((((((.((.(((((((((((((((.((..(((.((((((((..........)))).)))).))).))...)))))))))))))).).))...........(.((((((....(((.........((((.........))))..)))...)))))).)..((((.(((...))).)))).....((........))...))))))))..)))).))))))).....)))))))).))))..)(((((((.........))))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((.((((......((((.(((........(((((......)))))((((..........}...)))).(((((.(({(((,......}})))).},.))))))))..))))((((.,..(((((((((((((((((,....,))))))(.(((((((.,{.{((((((((((((((.,{..(((.((((((((.,........)))).)))).))).}}..,)))))))))))))).|,||...........{.((((((..,.(((.........(({{.........))))..))),..)))))).,..((((.(((...))).)))),||..({........)),..)))))))},.)))))}})))))...,.)))))))).))))..)(((({((.........,}},.})).)
Back