Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0005800
Sequence Length
294 nt
GC Content
0.5170
UUCCUCCCAAGUUUGUGGUUCAGCCACGGGACCAGGACGGGAUUUAUGGCAAAGCAGUCAUCCUCAAUUGUUCUGCUGAGGGUUACCCUGUACCUACCAUCGUGUGGAAAUUCUCUAAAGGUGCUGGGGUUCCCCAGUUCCAGCCAAUUGCCCUAAAUGGCCGAAUCCAAGUUCUCAGCAAUGGGUCGUUGCUGAUCAAGCAUGUCGUGGAGGAAGACAGUGGCUACUACCUCUGCAAGGUCAGCAACGAUGUGGGCGCAGACGUCAGCAAGUCCAUGUACCUCACGGUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-90.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -96.16
Frequency: 0.0001
Diversity: 81.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((....((((((((...))))))))....))).))))(((.((((..(((((.((........))..)))))..(((..(((((((((((.((((...))))...........)))))).)))))..))).((((..((((.((......)))))).))))(((.(((...)))..)))(((((((((((((..(((.(..((((((...........)).))))..))))..)))))))))))))(((((.((((((........)))..))).)).))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((...,((((((((...)))))))),,..))).))))(((.{(((,.((((({{{......,,)),,,)))){,(((,.{(({{{((({{.,,,,.,,}}}}......,,...,||}||,|||,,..)))}}}.|}.((({.((,.....},}))).||||,,,.|||,.,|}}..)))|((((((((((((..(((.(..(((({(,.......,..)).))))..))))..))))))))))))|(((((,((,{{{....,,..))),,))).|}.}}}})),,)))
Back