Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DSCAM_0009500
Sequence Length
628 nt
GC Content
0.5016
AUGCCUUGUGAAUCAUUUUCCCAAGAAAAGGACUUCUCUACACCUUAACCCUCUUUAAAAAUGCUUGUGUCCUAGGAGGGGAGAAUGUACCCGCUGAGUUUCAUGCAGGGGUCUUGUCAGGGAAGACAGAAUGAGUGCCUAUGCACUGCCAGGUCCUGGUACCAGAUCACAUCAUUUAAGUAUUACGACCAGGUUACUAGGGAUUAUUUGGAUCUUCUUUUGUGGAGGAGGGAACAAAGGCUCGCCAAGGCUGGAAACCCACCAAGGUUUCCCACUGGUAGAGAAAGCCCAGACUGGACCUGACUUUCUGUUCCCAAAGCCCUUGACACGUGGCCACUCCAGUCACUGGUUUUCUCAGUGACAGACUGGCUGGGCUACACACAAGGGGGCUAGGGGCUGAAGCCACUUUUUGAGGUGACUCUUUGUUCUCCCCUCAUUCAGUAAGUGUUGGAGGCUGGUGCUCGGAGCCAUAGCCAGACCAUUGCUGGUGCCAGCUCAAUGCCUGCAGUGUGCUGGGAUGGUGUGCAUAUUUCACACAUCAUCUCACACAAUUCUUACCCCUGCCAAGUGUCCCAGGACACCUGUUUUAGAGAUGAGGAAACUGAGGUUCCCAGAAAGUCAGUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-209.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.(((.....))).))))....(((((((((..........(((((((..................)))))))))))).)).))((((((.((((..((((((((.(((((......)))))....(((((....)))))(((.((((.((((((.((((......))))..)))))).)))).)))(((.(((((............))))).)))((((.(((((((((((.(((((......(((((((......)))))))...(((.(.((((((..(((.......))).)))))).)..))).(((((((.....((((((...(((((((((((.....)))))....))))))...))))))......)))))))((((((....))).))).....))))).))))))))))).)))).....(((.((((((..((((((((((...(((.((.(.....).)).))))))))))))))))))).)))..((((.((((((((((((.........))))))))))))))))......))))))))((.(((((....))))).)).........((.((((.......)))))))))).))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((({((.(((....,|||.}}}}....,((({({{,...{{{(({.{(((((({{{{...{{..{{{{{{{.{{|||||,,,..,..}||{{{({.,,||..((((((((.,,{{(,,,,,,||}}|{,,.((({(,,,.|}}}}(((.((((.((((((.{(({......|}}}..)))))).)))).))),,}}}||,|||,}},.},))))}},,.|,,((((.(((((((((((.(((((..{,..(((((((......)))))))..,|((.{.((((((..(((.......))).)))))).}.|)}..(((((((.....((((((...(((((((((((.....})))))}...,))))...))))))......))))))),{|(((....))).}},.....))))).))))))))))).))))...,,(({,{{((({,.(((((({(({...|||..,.|||,,.,..,.})))))}))))}}}}}})).))),.((((.((((((((((((.........))))))))))))))))......))))))))...|{,||}.}}))))).,)}}}}}}}}},},||....}}}}))},,.})))),))},})))..
Back