Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DSCAM_0010300

Sequence Length

358 nt

GC Content

0.5028

GGGUGUGUGUACAUGUGUGUGAUGUGCGUGUCCACAUAUGUGUGUGGUGUUUGGUGUGGUGUGUGCAUACGUGUGUGUGGUGCAUGAUGUGUGUUUGUAUGUGUGUGUAGUGUGUGUGGUGUGUGUGUGGCAUGUGGGGUGUGUACUCUGUGUAUAUGUGGUGUGUGUGUGUGCCGUGUAUGGUGUGUGAGCUCUGUAUGUGUGUGGGGUGUGUGUGUGGAGUGUGUGCUGUGUGUGGUGUGUGAGCUCUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGGAGUACGUGCUAUGUGGUGUGUGUGCUCUGUAUGUGUGUGUGUGUGAUAUAUGCAGGGGGUGUGUGUGAUGUGUGUGCUCUGUAUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-68.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -79.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 147.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........((((((((((.(((......)))))))))))))..........(((((((...((((((((((......(.(((((.(((((......)))))..))))).)..................((((((.(.((((((((...)))))))).).))))))......((((((((((((......(((((((((...............)))))))))....))))))))))))......(((((.(((((((((......(((((((((((((((........))))))))))))))).............))))))))).))))).......)))))))))).))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,,....,{((((({{{,,.,||}}}},.}}|||||||||||{{{{......,,,,.,{...,|||||||||}}}}},|.{((((,(({{{......}))}}.,))))).,.......,.,,.......||||{{{{{({,,.{((|||.,|{((({{{{{{,........|||||||||||{{|.....||{||,|||},,,....,,.....,,,,|||||...,||},,,..,}}},.....|||||.{{{,,,,,,......((({(((((((({((........}},}}}}|||||||||,,,.........))))))))),))})}.......))))))))))})),)))}.