Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0000400
Sequence Length
2070 nt
GC Content
0.4232
UUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUGAUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAGUUUAUUUUCUUUGCUGUCUAAAAAACACAACAAAGUUCUGGAACAAGCCACACAGUCCUUGAGAGGUUCGCUGAGUUCUAAUGAUGUUCCUCUACCAGAUUAUGCACAAGACCUAAAUGUCAUUGAAGAAGUGAUUCGAAUGAUGUUAGAGAUCAUCAACUCCUGCCUGACAAAUUCCCUUCACCACAACCCAAACUUGGUAUACGCCCUGCUUUACAAACGCGAUCUCUUUGAACAAUUUCGAACUCAUCCUUCAUUUCAGGAUAUAAUGCAAAAUAUUGAUCUGGUGAUCUCCUUCUUUAGCUCAAGGUUGCUGCAAGCUGGAGCUGAGCUGUCAGUGGAACGGGUCCUGGAAAUCAUUAAGCAAGGCGUCGUUGCGCUGCCCAAAGACAGACUGAAGAAAUUUCCAGAAUUGAAAUUCAAAUAUGUGGAAGAGGAGCAGCCCGAGGAGUUUUUUAUCCCCUAUGUCUGGUCUCUUGUCUACAACUCAGCAGUCGGCCUGUACUGGAAUCCACAGGACAUCCAGCUGUUCACCAUGGAUUCCGACUGAGGGCAGGAUGCUCUCCCACCCGGACCCCUCCAGCCAAGCAGCCCUUCAAGUUCUUUUAUUUCUGGGUAACAGAAGUAGACAGACAGGUUACUUGGUGUAUCUUCUGUUAAAGAGGAUUGCACGAGUGUGUUUUCCUCACACACUUUGAUUUGGAGAAUUGGUGCUAGUUGGCAAUAGAUAACUCAGCGUAGAUAGUAUUGCAAAAAGGGGAGGAAAUACACAACAAUAAUAAAUGUAAAAACCUGCUAUUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-550.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -591.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 466.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......((((((((.(((((((((((((......)))))))).))))))))..........((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))))))....(((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........)))))).(((.....((..(((((((((.(((((((((.....((((((((.(((((((((((.((.................)).))))))))).)).(((((((..(((.((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)).)))))).....................((((((...(((.(((.....))))))...(((((....((((..(((.(((((((((((((((((..((((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).))))))(((((..((((((........))))))..)))))...........)))))))).........................)))))))))...))))))))......................((((.....))))(((.(((((....))))).)))...)))..))))..))))).......))))))..)))))))...))))).................)))).)).))))).))((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).)))....))))))))..)).)))))))..)))))))((..(((((.(((((((((((((.(((.((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))))))))).))))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).)))))........))).)))))))))..)))))))...))).......)))))))))...))))).))))..))....)))(((((((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...((((((.(((.((.(..((...))..)))..)))..)))))).))))).))))))(((((((((((((..........(((((.((((((((((((((((((...(((((((((((............................((((...........)))).........((.........)))))))))...))))..)))))).)))..))))..))))))))))..))))......)))))))))....(((..(((((((........)))).)))..)))((((((.((((..((((..((((((.((..........(((.((((((.(((.......))).))).(((((..((((((((.......))))))......((((((.(((((.(((.(..(((.(........).)))..).))).)).))).))))))..))..))))).))))))..(((((((((..(((((......)))))....)))))))))...(((((((...)))))))...)).)))))).))))(((((..(((((..((((((((((((((((((.....)))))))))).)))......)))))(((((((((((.....)))))).)))))((((((((.......))))))))..............)).)))..)))))....)))).))))))(((........))).....)))))))).........)))(.......(((......)))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{(,...},,{,((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).}}......,((((....(((((((((((({{(.,(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.})))))))))))}}}}.{{{((({({(((({,{(((((..,,....((((((.......)))))).....})))))}}}}........||}}}}.|||}||{{{{..(((((((((.((((((((({{{{.(({(((((.(((((((((((.{{....,,...........}).))))))))).)}.(((((((..(({{((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)),))))))................,,.,,({{{((...(((.(((.....))))))...,{{|,.....,,({{({.,(((((((((((((((((..{(((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))){(((({.((((((........))))))}.))))}.........,,||}}}}},..|||}.....,}..,,........))))))))}.,)))),))}}....,.,,.}}}......{,,.,,,,.....,||{(((.(((({....})))).}}}}},}}}.,)))),.,}}||.......}}))))..)))))))...)))))|,{,....,,,,.....}))).))}})))).}}((((((((((({..((,,(........,..,..)),,))))))))).)))....))))))))..)).))))))),.)))))))((..(((((.(((((((((((((.(({,((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))})))))).))))))(((((.((.(((((((,((.......,....,,........}).))))))))).)))))........))).)))))))))..)))))))...})),,.....)))))))))...))))).)))).,||....}}},,.{(((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...{(({{{.(({.,,.{.,{(,,.,,.,)),..))),.)))))}.))))).)))))}(((((((((((((.....,,...{{({{.,((((({{((((((((((...(((((((((((..........,..,|,............,,,.....,......}))}....{{...{{.........)))))))))...))))..)))))).)))}.)))),.}}})))}}}}..))))......)))))))))},.,|||,}||||{{{,,,{({{,({({,..((((({(((((....}})},{,,.,((((((,((..........(({.{(({{,.,}})}})}}.....|||,{,(((,.{,,{{{{{.....,,}}}}))}.....((((((.(((((.(((.,..(((.{........),)))..}.))).)).))).))))))..}}.,}}})),},}}}}..{((((((((..(((((......)))))....))))))))}...(((((({...))))))),..}),))))))}))))}}..|)))))}|},..||||||{(((((((((.....)))))))))).||,{{{{{{.|||}(((((((((((.....))))))}})))),|((((((,{{{{{{,|,|,|||{..,|||,||.{{{|,{((((((({.,....,.))))).)))},.}})}}).}}.)}}}}))}}))))))}}))}).,{{........}}}...,,}}))},.,,,.,
Back