Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0000700
Sequence Length
1527 nt
GC Content
0.3857
AUAUUUAUUCACUAUAUUAUAAAAAUCAAUUUUUGGACCUGCUGUGUCUAAACUCUGUGAACAAAAUAUUAAUCCCAGAAACUCAAAAAGAACUUAAAAUCCGACAUGGGGAAGAACAAGGCCCACAGGCACGUAGCGAAAAGCCCACUUGUGGACAAAAUAAGCAGCUUGCAAAGUAGCUGGUGGUGCCAGCAAACUGCUUGAGAAAGAAAUGGUUUAUCUGGAAUCACAAGCAGUGUCACCAGCCAUGAGCUGCCUUUGUUCUCACUCAUUGCCACAGAAUUGUGAGGCACAUGCUUGUUAAUGGCUGUGGCGCCAGCUAAGUCUCUUUACCUUCCAGAACAAAUGCAUUUAGUGGCAUUUAUGUAAUAUAGUGUACUUUCCACUAGAAUGGAUAAGACAAAAGUUAUUGUACUCUUAAACAAUUAGCAUUUAGGAGAGUAAUUCUGAAAGAAAAUGCAUAAAAACGUUUGUGAAGGAUUGUUUGUAACUUAAUAUAUUUUACCUAUAAAAUAGAAGACAUAAAAGGUAAUGCUCAACUUUACAAAAACACAAUAAUUUUUUAUAUUUUUGCAUGUCUGACUAUAAACACCUAAAUGUUAUUCUCUUGAAUUUAAAAGGGAUCUGCAGUCUUCUUGAUUUAUGAACAUUGUGGUUUUAAAAAUAAUUUGCUGAAAAAUGAUGUUUUGUUUUCAUUUUUUAGUGACAAAUAUUUAGGGACCGUGUAUUUCCAGAAUGCUACUGUGUUAAUAUCUUGCUGCAUACUUUGGGCUGUGCUAUAACAUGAAGCAAAAGUAAUUAUAGGUUGCUAUUUGUUAUCCCUGGUGAUCAUGAUAAGGGAAAUGUGGCUAAAUUCAUAGAUAAUCCCCAAAACAUCAUUUUAGCCAUUAGUUUCAAAUUCUUUCCUGUUAAGCCCUUUUGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCUAAUAUUAAGCUUCAAAAGUGAUAGGCUUUAGGGUUUAGCUUUCUCUCCCGACUUUCUGUUGGAUACUGCUCUAUAAACGAAAUAUAAAUGCAAGGUCAGGCAGCACAAGAAAGAGUAGAAUUCAGGAGGCUACUUAAUUCACAGAAUGAAUAAUCAGCCCUGGAUAUUGAGGGGUUGCCUCUGAUUCGGCUAUCAAACCCAACGGAGAGCAAACUGCGUUUAGGAGGGCUAGUGAAUUAAAAGCCGGGUCACUGUAGGAAUGGAAUCAUGAUAGUUUGACUACCAUGUGAGAAAGGCGGCUACUAAAAAUACAUUUCAUACCUCUUCUUGUUUAAAAAAUAACACUUUACAUUACAGGUGAUCUCCUUCUUUAGCUCAAGGUUGCUGCAAGCUGGAGCUGAGCUGUCAGUGGAACGGGUCCUGGAAAUCAUUAAGCAAGGCGUCGUUGCGCUGCCCAAAGACAGACUGAAGCCGCUGGCCGAUCGUCAGGUGGACAGAGUCCUUGCAUGCCAGGCCUUUGUGUAUGCAGCUUCUGGGUUCUCACAGUUUCAUGGCUUGUCUGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-394.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -426.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 374.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((((((((((.((((.....((((((((....).))))))).((((.((............)).))))..........................(((((..(((((((((.(((((((......((.....))...))))))).........(((...)))...((((((.(((((........((((((((.........((((((.....)))))))))))))).......))))).)))))))))))))))..))))).(((((((.((((..((((....))))..))))..)))))))((((.(((((((.....................).)))))))))))))).))))))))))))..(((((((......)))).)))..((((((((((((.((((((((.........))))))))..(((((((......(((((........)))))....)))))))(((((((...........((((((...................)))))).........)))))))...))))))))))))...........))))(((((.((((...((((((((((..((((((........)))))).(((((((.(((.........))).))))))).............((((((((((((((..........))))))))))))))..))))))))))..(((((...............((((((..(((.....(((((((((...(((((..((..........(((((((((((((...))))))).)))))).(((((.((.......)).)))))...(((((((((..........................)))))))))...((((...(((((((((.(((((....))))).)).)))))))...))))...((((((.(((((((((((((....((((((((....)))..)))))......)))))))))))))(((((.....)))))...)).))))...............((((((((((.(((((((((((((.(((....(((((((..(((..(((.((((.....)))))))..))))))))))...((((.....))))((((((((((.(((..(((..(.(((.(((...))).))).)..)))....)))......))))))))))..(((((((((....((((.((((...)))).))))........................)))))).)))))))))))))..................((((((((.(.(.((((..(((((((........)))).)))..)))).).).)))).)))).(((((..(((...............)))..)))))..))))))....))).((((....((((((((.....)))).))))....)))))))))))))..)))))....)))))))))......)))..))))))..))))).))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.....((((((((((((.{{{{.....{(((((((....).))))))}.((((.((............)).))))..........|,..............(((((..(((((((((.(((((((...,..{{.....))...))))))).........((({{{|}}...((,((({(((((....,,..((((((((.........((((((.....)))))))))))))),,},}}}))})),)))))))))))))))..))))).(((((((.((({..((((....))))..})))..)))))))((({,(((((({..,,.........,.......}.))))))))))}))}.))))))))))))..(((((((......)))).}}},,{{{{((((((((.{{{{{{,|,,...,,,.||||||}}.||,.||||...}}},.,|||,..,,....,{((((((({{{((({{((,{,,,....{.{{(({,((.,...,}},..,,.,,...)))),},,.....}})))))},...}})))))))))),,,,,,,.}},))))(((((........((((((((((..((((((........)))))).(((((((.(((.........))).))))))).............((((((((((((((..........))))))))))))))..))))))))))((((.(((((({{{(({{(((..{.|,{,.........|,.||||..}}}|||{{{{,,....}}}...((((((((((((,...})))))).)))))).(((((.{(.......)}.)))))...(((((((((..........................)))))))))...{(((...{((((((((.((((,....})))).)).))))))}.||}}|{,((((((.(.(((((((((((((..{,((((((((....}))..))))).,,...))))))))))))),|,,|}}}}},)}||...,,.}))}.............,}))))).))))(((((((.((.((((..(((((((((((((((((..(((((((((....,||....}}|(((((...{,..,.(.(((((((((((.((.((........)).}}))))).))},,)).).,.,,..)))))}.))))))))}.))))((((((((((({,.{{({,..((((.((((...)))).)))).,{{,,{{{.||.,............,}},.},)))}))))|{{{........}}},.,,....}})))}})))))},....{(((((((.{(.(({...})),)).)))))))},|{,(((((.(((((,,((({............},})),.))))).))))),.....,,,.{(((....((((((((.....))))}}))).,..)))),{((((((((({....,)).)))))))),))))))))))).))..)))).)))),,)))))))))
Back